CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP010905_6
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP010905_6                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridioides difficile 630 GCF_000932055
RefSeq :
NZ_CP010905 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP010905_6
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
Number of repetitions :
14
Begin Position :
1419402
End Position :
1420285
1419402
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAGCTTTCATAGCATCCTCTTCTGAACATTCATCACT
1419467
1419468
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TAGTAAGTTAACTCATACATACCACCTTCCCCATAAA
1419533
1419534
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TATTATAAATCTTTAAATAGCCTTCTAAGCGTCTACTA
1419600
1419601
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ACATTATCAACATCATCTAATTTTTTTGTCACTGTA
1419665
1419666
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TAAGAATTAACTAATGTGAATTTTTTAGACATGTCAT
1419731
1419732
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ACAAACAAGTGTAGGATAAACTTTCCTTGCCCAGTATA
1419798
1419799
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TAACAAAATTTGCGAGTACACTTATTTCTAATATATC
1419864
1419865
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ATAAGAGTGGTTTAAGAAAATAAGTTATTTTTCAAA
1419929
1419930
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TGACTCGTGCTATTTTTTTTACACGCCTAAGAGGTA
1419994
1419995
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CGAAAAATCTAGGAAAAACTATTGTAAAAGCGTTTA
1420059
1420060
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTTGATTACATGGGCAGTTTTTTATTATAGAGTGTTA
1420125
1420126
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAAAATCTTATTAAAGATTATTCAAAGTCTTTTGATT
1420191
1420192
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT
1420256
1420257
GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG
1420285
Left flanking sequence : Till position 1419402 (length
bp)
GGTATATGATAAATATTATCATTTGCACTACTCGTGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAATTGTATAGATGT
AAGTGTTGGAAATACTCAATTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1420285 (length
bp)
ACAGATATAATGTCAAAATAAGGTTAGGACTTTTAAAAGCATAGCCATATCAGTAAAAATTTAATTATCA
TTTAAAAATAAATTTTTATTTAAAGAATAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp