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CRISPRs details
NZ_CP010905_9
Flanking alignement tool
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NZ_CP010905_9                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridioides difficile 630 GCF_000932055
RefSeq :
NZ_CP010905 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP010905_9
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
Number of repetitions :
16
Begin Position :
1920130
End Position :
1921143
1920130
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CTAGAATTAGAACTCATTATTAAAACCATTCTTGCAAG
1920196
1920197
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TAATCTGACACATACAAAGTTGAACCTAGTGGTACGG
1920262
1920263
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AAAAGCGTTCTTAAATCGTTACTTAACTCTTGCAAAT
1920328
1920329
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TGGTATATCATACTCGTGCATTGCCTGCTCCACATT
1920393
1920394
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
ATACAACCATATATTTACCAATTATGTACTTATGAAG
1920459
1920460
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTTTTTAACTTTTCAGTTCTCACAGGCGTTTCATCT
1920524
1920525
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTCATATTCCAAGCGTTTTGCTTACACTTAATAGAA
1920589
1920590
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AAAATTAAATTTCATGCTCTTAGACATACATATGCAAC
1920656
1920657
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TAGATTGCTTTCAAATTACCTCTTGTATAGCGTCTT
1920721
1920722
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTGCTCCGCTATGCCTTGCGCTCTCTAATATCGCTTA
1920787
1920788
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TGAACTTTAATCGGTTTTATACAACAATATAACGC
1920851
1920852
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TCACACATGAGCAATATCGAAACAGGCAAATCTACAG
1920917
1920918
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTCGTAAAATAACAATTATCTGGAATATGAGAAGTT
1920982
1920983
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAA
1921048
1921049
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TCAATATCTATATTAAGTTTATTTTTAAAAACATCTT
1921114
1921115
GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT
1921143
Left flanking sequence : Till position 1920130 (length
bp)
GGTGTGTGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1921143 (length
bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACCCCAATAATTTATACAGCATTTTATCCTTTAAAATATAATTATTTT
TTAGCATTTGTAGTAAATAATTACCAGATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp