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CRISPRs details
NZ_CP011056_8
Flanking alignement tool
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NZ_CP011056_8                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus solfataricus 98/2 SULC GCF_000968395
RefSeq :
NZ_CP011056 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP011056_8
DR consensus (25 bp) :
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
Number of repetitions :
71
Begin Position :
2134655
End Position :
2139117
2134655
ATTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TTGAAGATAGAGTTAAATGAACTTTTGATGACACAAAA
2134717
2134718
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GTCTACACCTCTTGCGTCTATTATGATATCATATTTGTCAA
2134783
2134784
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAATACGTTTTCTCCATTGTCATATTGCGCATAAGTTGA
2134847
2134848
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ACCAAGTGAAACTTGGAATATATAACCAAAAAGATAT
2134909
2134910
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GATTCTTCAATAAAGCTGGTAATATACTTTGACAGAAT
2134972
2134973
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AGTAATAGAAACTCATTCAGAGTCTCTTCCAACCCGTACA
2135037
2135038
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CGTGGTAGTGGTGGTAGTTGTTGTTGTTGTAGGCG
2135097
2135098
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TAGTATAGTGTTACAGTTAAACGCTGTACCGAATAATGG
2135161
2135162
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TAGTATAGTGTTACAGTTAAACGCTGTACCGAATAATGG
2135225
2135226
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAAATGTTTAATATTGGTGGAGTAGTTGATTTCGATAATAT
2135291
2135292
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAGGGTAATAGAAAGCATGCCCATATCAGCAAGTTCTAA
2135355
2135356
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GTAAAATCCCCAACGCCACATACGTTATAAGGGAAGATA
2135419
2135420
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CTAGTGTTAAAATATATTTCAAGCCTTACGATGAGAA
2135481
2135482
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CATGCATCAGTTCATCGTAGTTGAACTCAGCATGGAT
2135543
2135544
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAAATCCATTCGAGGAAGTGTTAGAAGAGGTGTATGGTGA
2135608
2135609
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAGAGGGAAAAAGTTTGCAGGAGATTTCAAGTATTACA
2135671
2135672
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAATATTAAATATTAGTGATTTGGTAATAACGAAAATAAA
2135736
2135737
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GAGTGAGACCATGATCATTAACACTGATATTACGGTAAG
2135800
2135801
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AACAAAACTTCACCAGTGATGGAACATTTGAATGTAA
2135862
2135863
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAACCGCAAGCAATAATGTACTTACGATAAGGGTGATACT
2135927
2135928
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ATATGATTATGAGCGATAAGAATGATGCAATATTAGATATAT
2135994
2135995
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GAATATACAGAGAATAGAGAATAGAGAACAGAGAACGG
2136057
2136058
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CCGTGATCAGATACAGTAACAGTCATGTTTTTATCT
2136118
2136119
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CATGGAAACGGGAGGAGGGTGAGACAATGAAGGTTAC
2136180
2136181
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CACATCTTTAGAGGCGAACTACAGGGGGTACAGCAACT
2136243
2136244
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GTAGTGTGAGTAGTGTAGTAGTAGTGGCCTGAATAAGTAG
2136308
2136309
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAATTCTGCAAAGGTAACACAATTGACGAGGTAAA
2136368
2136369
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CGGTTACGGGGACGTTTGGACATTTAGCAGCGCATCCCAA
2136433
2136434
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TCCCTTCCTCTCTTTCCGCTTTTGCTCGCTTCGTTTAACT
2136498
2136499
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GGCATAACCGCTGCTTTCGGCTGCTGCTGCTAATTGGTCTC
2136564
2136565
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CCTTCAGCAAGTTGAAGATCTTAAGCGTTTCTTCATCTT
2136628
2136629
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ACGCTGAACGACGTAAACAAGCTCGCACAGAAGAAAAT
2136691
2136692
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAGTCACTGAATTGTTGGACGAACTAACTGAAAAAATTAG
2136756
2136757
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GGCATTAGAATATGGGTAAAAACTTATAGCGACGAAGA
2136819
2136820
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TGAAGTACTTGTTAATGTTTCACCTCTAAAGAAGAT
2136880
2136881
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TTTACCACCGCTCAGACTTCTTGAGATGTTTAAAACC
2136942
2136943
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GAATTCTATCAAGTATTGCGGAAGTAAATACTTCATATTTATCA
2137011
2137012
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TCCACTTGGCATATCTTTGGCTGAAGTTCCTTGGTGTG
2137074
2137075
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CTTCAAGTTGATGAAGTTATAAAAATGTTTGAAGCT
2137135
2137136
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CACATTAGCAAGAATCGTGCTAGCTACAGTTGGATT
2137196
2137197
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AACTTGGAAGAGTTTAGTGATAAAATCATGGAAATGTTC
2137260
2137261
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TGTTAATATTGCCGGTTCGGCTAGTGATATAGTGTGGTTCT
2137326
2137327
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GGTAATGGTCTGTATATTGTCTTTAAGTATTTAT
2137385
2137386
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AGCACTAATTGCGAGATTTGAGGATGCCATCAGAAGTAA
2137449
2137450
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAAGCTAAGATTGCGAGTACAAGCGATCACTTACACAAAG
2137514
2137515
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ACGCCGTTTCTCTATAGTTATTGAACCATGCAATATCATT
2137579
2137580
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ATTAGCTAAACCATTTCAAAGGCTAACATCTTCTATGT
2137642
2137643
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATAAATCCACAAAGTGGCCGTTCAAAGCAAAGAGTTTATT
2137707
2137708
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TGATATTTATTTTCTCGTGAAAAGTGGAGGGCCTAGAAC
2137771
2137772
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATTATATCATGGAGACCCAGGTGCTGTGACTATCAA
2137832
2137833
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AATTAGCCAGCGTGCCATCTGGGTAAACGTGTATTTTGGTTAA
2137900
2137901
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATAATATATTTCGTTCCAACTACACCTAATGGATTCGGG
2137964
2137965
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TAATTGTCTGCCCTTGAGTTCCACTGAGAGAAACGC
2138025
2138026
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAAAGACGTACAAATATACATCGCACCGAACGGACACAT
2138089
2138090
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GGGTGCGTGCCCCACAGGTCGCGGGTCTACCCCTTGC
2138151
2138152
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TTATGTCGTTATCTTCTTCGTTTTTGCTGCGTTGTTT
2138213
2138214
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GATAAAATATTAAATTCTCAAATTCCATTTAGAG
2138272
2138273
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAAATTTGAAACAATATCGCATCTTGAATAATTAT
2138332
2138333
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GCTTCTTCCCAACGCTGTACGTACTCTTAGGTGTCACA
2138395
2138396
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AATTACAGGAAAAAGACGAACTAAATGAGGAAGAAATG
2138458
2138459
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TACTCAATTTGTGCGCAGTTTTTCATTGAGGGAGACTT
2138521
2138522
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAAAATTCTGAGTGCAATGTATAATGAAAATATGGATAATA
2138587
2138588
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TGTTGTCCAAATAAATGCTGTACCGACTAACAATAATGTA
2138652
2138653
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CAGGAGTTGGAGGTATTATCGGAGCATTGTTAGCAT
2138713
2138714
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATGATTTGAAAATAGATGAAGAGCTATCTAAACTCATTCC
2138778
2138779
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ACCACATTATGAAGGTACTCCAGAATTCTCTAAGAT
2138839
2138840
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TAGATCTATTCGCAGAGTTTGCATCAACACATAAGTAC
2138902
2138903
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATAATATGGTGAAAATTGAAGGTGAATCATTAGCAAA
2138964
2138965
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AATTTTTTGTTTAAAGATGATTCAGTGGAAGAATATTA
2139027
2139028
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CAATCCCAAAAAGTAAATCCCCAATCTTCAAATAATATGG
2139092
2139093
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
2139117
Left flanking sequence : Till position 2134655 (length
bp)
ACATTGGCTTTGGAGAGGTAGAAGTAAAATCACTTAATGGTTAATGAAACGCTATTTTCTCACTCTAATG
AGGATTATTTTACTTAGACTCTATTGCGTA
Right flanking sequence : From position 2139117 (length
bp)
TGTTGTGTTTTTATACTTCCTATTTTTCTTTTCTCCTTTCTTACTTATAAATCTTCATGACTACCCTTTA
CTCTTCATGCGACCAATTTTAGTTGTAATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp