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CRISPRs details
NZ_CP011057_8
Flanking alignement tool
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NZ_CP011057_8                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus solfataricus SULA 98/2 GCF_000968435
RefSeq :
NZ_CP011057 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP011057_8
DR consensus (25 bp) :
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
Number of repetitions :
71
Begin Position :
2134671
End Position :
2139133
2134671
ATTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TTGAAGATAGAGTTAAATGAACTTTTGATGACACAAAA
2134733
2134734
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GTCTACACCTCTTGCGTCTATTATGATATCATATTTGTCAA
2134799
2134800
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAATACGTTTTCTCCATTGTCATATTGCGCATAAGTTGA
2134863
2134864
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ACCAAGTGAAACTTGGAATATATAACCAAAAAGATAT
2134925
2134926
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GATTCTTCAATAAAGCTGGTAATATACTTTGACAGAAT
2134988
2134989
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AGTAATAGAAACTCATTCAGAGTCTCTTCCAACCCGTACA
2135053
2135054
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CGTGGTAGTGGTGGTAGTTGTTGTTGTTGTAGGCG
2135113
2135114
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TAGTATAGTGTTACAGTTAAACGCTGTACCGAATAATGG
2135177
2135178
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TAGTATAGTGTTACAGTTAAACGCTGTACCGAATAATGG
2135241
2135242
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAAATGTTTAATATTGGTGGAGTAGTTGATTTCGATAATAT
2135307
2135308
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAGGGTAATAGAAAGCATGCCCATATCAGCAAGTTCTAA
2135371
2135372
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GTAAAATCCCCAACGCCACATACGTTATAAGGGAAGATA
2135435
2135436
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CTAGTGTTAAAATATATTTCAAGCCTTACGATGAGAA
2135497
2135498
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CATGCATCAGTTCATCGTAGTTGAACTCAGCATGGAT
2135559
2135560
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAAATCCATTCGAGGAAGTGTTAGAAGAGGTGTATGGTGA
2135624
2135625
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAGAGGGAAAAAGTTTGCAGGAGATTTCAAGTATTACA
2135687
2135688
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAATATTAAATATTAGTGATTTGGTAATAACGAAAATAAA
2135752
2135753
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GAGTGAGACCATGATCATTAACACTGATATTACGGTAAG
2135816
2135817
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AACAAAACTTCACCAGTGATGGAACATTTGAATGTAA
2135878
2135879
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAACCGCAAGCAATAATGTACTTACGATAAGGGTGATACT
2135943
2135944
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ATATGATTATGAGCGATAAGAATGATGCAATATTAGATATAT
2136010
2136011
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GAATATACAGAGAATAGAGAATAGAGAACAGAGAACGG
2136073
2136074
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CCGTGATCAGATACAGTAACAGTCATGTTTTTATCT
2136134
2136135
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CATGGAAACGGGAGGAGGGTGAGACAATGAAGGTTAC
2136196
2136197
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CACATCTTTAGAGGCGAACTACAGGGGGTACAGCAACT
2136259
2136260
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GTAGTGTGAGTAGTGTAGTAGTAGTGGCCTGAATAAGTAG
2136324
2136325
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAATTCTGCAAAGGTAACACAATTGACGAGGTAAA
2136384
2136385
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CGGTTACGGGGACGTTTGGACATTTAGCAGCGCATCCCAA
2136449
2136450
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TCCCTTCCTCTCTTTCCGCTTTTGCTCGCTTCGTTTAACT
2136514
2136515
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GGCATAACCGCTGCTTTCGGCTGCTGCTGCTAATTGGTCTC
2136580
2136581
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CCTTCAGCAAGTTGAAGATCTTAAGCGTTTCTTCATCTT
2136644
2136645
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ACGCTGAACGACGTAAACAAGCTCGCACAGAAGAAAAT
2136707
2136708
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAGTCACTGAATTGTTGGACGAACTAACTGAAAAAATTAG
2136772
2136773
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GGCATTAGAATATGGGTAAAAACTTATAGCGACGAAGA
2136835
2136836
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TGAAGTACTTGTTAATGTTTCACCTCTAAAGAAGAT
2136896
2136897
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TTTACCACCGCTCAGACTTCTTGAGATGTTTAAAACC
2136958
2136959
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GAATTCTATCAAGTATTGCGGAAGTAAATACTTCATATTTATCA
2137027
2137028
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TCCACTTGGCATATCTTTGGCTGAAGTTCCTTGGTGTG
2137090
2137091
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CTTCAAGTTGATGAAGTTATAAAAATGTTTGAAGCT
2137151
2137152
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CACATTAGCAAGAATCGTGCTAGCTACAGTTGGATT
2137212
2137213
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AACTTGGAAGAGTTTAGTGATAAAATCATGGAAATGTTC
2137276
2137277
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TGTTAATATTGCCGGTTCGGCTAGTGATATAGTGTGGTTCT
2137342
2137343
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GGTAATGGTCTGTATATTGTCTTTAAGTATTTAT
2137401
2137402
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AGCACTAATTGCGAGATTTGAGGATGCCATCAGAAGTAA
2137465
2137466
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAAGCTAAGATTGCGAGTACAAGCGATCACTTACACAAAG
2137530
2137531
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ACGCCGTTTCTCTATAGTTATTGAACCATGCAATATCATT
2137595
2137596
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ATTAGCTAAACCATTTCAAAGGCTAACATCTTCTATGT
2137658
2137659
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATAAATCCACAAAGTGGCCGTTCAAAGCAAAGAGTTTATT
2137723
2137724
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TGATATTTATTTTCTCGTGAAAAGTGGAGGGCCTAGAAC
2137787
2137788
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATTATATCATGGAGACCCAGGTGCTGTGACTATCAA
2137848
2137849
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AATTAGCCAGCGTGCCATCTGGGTAAACGTGTATTTTGGTTAA
2137916
2137917
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATAATATATTTCGTTCCAACTACACCTAATGGATTCGGG
2137980
2137981
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TAATTGTCTGCCCTTGAGTTCCACTGAGAGAAACGC
2138041
2138042
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAAAGACGTACAAATATACATCGCACCGAACGGACACAT
2138105
2138106
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GGGTGCGTGCCCCACAGGTCGCGGGTCTACCCCTTGC
2138167
2138168
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TTATGTCGTTATCTTCTTCGTTTTTGCTGCGTTGTTT
2138229
2138230
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GATAAAATATTAAATTCTCAAATTCCATTTAGAG
2138288
2138289
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAAATTTGAAACAATATCGCATCTTGAATAATTAT
2138348
2138349
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GCTTCTTCCCAACGCTGTACGTACTCTTAGGTGTCACA
2138411
2138412
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AATTACAGGAAAAAGACGAACTAAATGAGGAAGAAATG
2138474
2138475
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TACTCAATTTGTGCGCAGTTTTTCATTGAGGGAGACTT
2138537
2138538
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAAAATTCTGAGTGCAATGTATAATGAAAATATGGATAATA
2138603
2138604
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TGTTGTCCAAATAAATGCTGTACCGACTAACAATAATGTA
2138668
2138669
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CAGGAGTTGGAGGTATTATCGGAGCATTGTTAGCAT
2138729
2138730
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATGATTTGAAAATAGATGAAGAGCTATCTAAACTCATTCC
2138794
2138795
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ACCACATTATGAAGGTACTCCAGAATTCTCTAAGAT
2138855
2138856
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TAGATCTATTCGCAGAGTTTGCATCAACACATAAGTAC
2138918
2138919
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATAATATGGTGAAAATTGAAGGTGAATCATTAGCAAA
2138980
2138981
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AATTTTTTGTTTAAAGATGATTCAGTGGAAGAATATTA
2139043
2139044
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CAATCCCAAAAAGTAAATCCCCAATCTTCAAATAATATGG
2139108
2139109
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
2139133
Left flanking sequence : Till position 2134671 (length
bp)
ACATTGGCTTTGGAGAGGTAGAAGTAAAATCACTTAATGGTTAATGAAACGCTATTTTCTCACTCTAATG
AGGATTATTTTACTTAGACTCTATTGCGTA
Right flanking sequence : From position 2139133 (length
bp)
TGTTGTGTTTTTATACTTCCTATTTTTCTTTTCTCCTTTCTTACTTATAAATCTTCATGACTACCCTTTA
CTCTTCATGCGACCAATTTTAGTTGTAATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp