Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP011304_21                                                                                                                 top


Strain : Microcystis aeruginosa NIES-2549 GCF_000981785 RefSeq :NZ_CP011304 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP011304_21
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACNumber of repetitions :79
Begin Position : 3601305 End Position : 3606945

3601305GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAATTCAGGGTATTTTGGCTTAAATCCCCAAAATT3601376
3601377GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAGGGTGTAAAGAGTCGATACATAGCACATATCCC3601448
3601449GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACACGGTTCAACCGACCTAAAACAACTATTAGCAGGGG3601521
3601522GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTTTTTCGGCTATTTTTAGCCCAATTCTGTAGGA3601592
3601593GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAGTGGAATTAATGCTTAAAAATACTGCTGAATTG3601664
3601665GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAGGTAACTGACTAGGGACGGTATCAGGCGAATTA3601735
3601736GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCGGAACACTCAAGGATGCCCTAATCTCGTTGTTT3601807
3601808GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTATTTCTAGAGATTTTAGGGTAATTTCTAGGATCG3601879
3601880GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACACCCCGCAGCACTCGGATCGATTTACGATTACCT3601950
3601951GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTGTATCGTGCCGTCGATTTCATCCCCATAGAT3602020
3602021GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCCGTTGCCAGTCAGGTCTGTCGCGCCTGAAACT3602091
3602092GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAATCAGCAAAGTGTTAAGGCTAGAATGGCGCGAT3602162
3602163GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTTGTTTTATTTGGTATCCACTCGATAATATCGTT3602234
3602235GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTTCTTTTTCTTTCGATTGGGGCCGGGAGTGTCTAG3602307
3602308GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCGGGACGGACGGTTATCTACTCAAGCTATCTAT3602378
3602379GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCGATCGCCGCGTCGATCTTTTCCTCGAAGTTGGGC3602451
3602452GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCGGATCCGAGTCGGTACGACTGCCAGAAAACTT3602522
3602523GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAGTGAGGGTCATCCCTACTACGCGCCCGTTAAGGA3602594
3602595GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTGGGAAAATACCATTATGTTTGGTGATGAAGTCGATGG3602670
3602671GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTTTGATACTGCAATTATACCTATTTGTGATTAT3602741
3602742GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTATAGACGTTCCGCGAATACTACTTTAGCCCGTG3602813
3602814GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAAGTCCATCAACACATATATGTGTTGATTTTCG3602884
3602885GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAAAGGCCAGGATTTTACCCTATCTGTACTCGAT3602955
3602956GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACACTTTATACAAGATACTTATACATACTTTATACAA3603027
3603028GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCGAGGGTCGCTGGTAATATAAAATAAATCCGT3603097
3603098GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATAATTTAGAAGACTCGATCGATATCCAATCGCT3603168
3603169GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATCTAACTGTGACACTTTGAGAATTGGCACTCGAT3603240
3603241GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAGAATGATGATGCTTCTTTTCTGTTTTTAGCCTT3603312
3603313GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCAGGTCTAATAATTCAAGCCCTGTCTCGTTAAG3603382
3603383GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGAAAAAGGGGTGAACCCGAAGGTAACTCGTGGGATTTT3603457
3603458GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAACCTACTCTTTCCATATTTCTTCTCAAGCTGGT3603529
3603530GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAGAATTTTTTCGAGATTGGGAGAAATAGGAAGT3603600
3603601GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTTTCCTCTGATGAGGAAGCGGTGGTTTTTTATGA3603672
3603673GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCAGGATCAAAAGAATTGGGATTAAGATGTAAAA3603743
3603744GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATCAATCAAGAAACTCAAGAAAGCAATCAAGAAA3603814
3603815GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAGGTGAGATGCTGAAAAATAAACCCGTCTCTATCT3603887
3603888GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATTGTTCCCGTTGCCGGTCAAGTCTTTTGCCCCG3603958
3603959GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTGCTAATTTAGCGACTCCTTTAAATGGTATCGT3604029
3604030GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCGGTAGCAATTAGAACTTTACTAGAATCCTCTTTA3604101
3604102GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCAGTACACCGGCGATTATATCATTTACAGAATTGTC3604174
3604175GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAGTACAAATAAAAGATTATGTAACTTTTATTAGT3604245
3604246GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCGTTTTTAACGGTTTTGGGTTTCGTATCCTGATCGA3604318
3604319GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAAAAAACCATTATTTAGAAGCAAGAAAAAATGCCT3604391
3604392GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCTTTACCAGACCGGCATAATTCAAGGAATTGGC3604462
3604463GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATTGGGTGCGATACCCGTATCCTTGATAAATCGGTA3604535
3604536GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTACCCTGGAATCATCGGGATTTGAAATCAAAGGCGG3604608
3604609GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGGTTCAACCGACCTAAAACAACTATTAGCAGGGG3604679
3604680GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTGGATAGTTTACATCGCTTTTATCTATCAGAAA3604749
3604750GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATGGTGTTTTTTGTAGTCCATATTTTGATATTTCT3604821
3604822GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGAAAAAGAATTTGAGAGAAATAAGAGAAGATTTG3604892
3604893GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTATCAGAAAAACTGTTTTATCTGTTGCCACTAA3604963
3604964GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTGTATAGTGTCAAGAGTTTTATTCTAAGTAGTG3605034
3605035GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATTAATACTATCTTCTCTATTTCTTTTTGAATTTTGT3605108
3605109GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTGTTTTTTGCTTGCCAGACCTTAATGCAACTGT3605179
3605180GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTCATGGCACGTCAAACTATTTATTAAGCAATGA3605250
3605251GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTTATTAGATTTTTTTTGTGCTATCATAGTAGAAT3605322
3605323GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCTCGCTGGTTTCCTTTAGTTTTTTGATGTTTTCC3605394
3605395GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCCCCCTTCCCCCTCCGGCCCGACCGGCGATCGA3605465
3605466GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAGCATTAAAGGGGGATAAGGTTATCCCCCCAGCGA3605537
3605538GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATGGCGCGGCCGATGATGCTTTTTCCTTCCCCT3605607
3605608GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAACATAAAATTCCCATCGGTTCCATCTTCTACT3605678
3605679GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTATTCCCGTCGCTATGTGATTAAGAACAGTCCCTT3605750
3605751GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAATCAGGAAACTGTAGAGACTGACTCAATAGATG3605821
3605822GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCGAAAAAGAATTTGAGAGAAATAAAAGAAGATTTG3605894
3605895GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAGCATTGACTCGATTTGTTCATACTTAAAATCG3605965
3605966GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTTTTGATATTGAAAATAAGGATAATAATTGTTATCT3606039
3606040GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTCTGAAAGTCTTGCTAGAAGCAAGTTTCAAAAA3606110
3606111GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACACGCTACCTACTGCATAACCCAGATACCCTAAA3606180
3606181GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCTCTTTATGAAGGGGAATCGGGCATCTTAATCAA3606252
3606253GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTTCCGTCCTCTACTGACTGTTTAAAAGTGTCACT3606324
3606325GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTGGAACGACCGATTACCTCTCTCTCATGAAACCTTACGGA3606402
3606403GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCCACTGATAACGATAGAATTAATATCATCTAAT3606473
3606474GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAGCAATGGCTTTAATATGTGGGCATTCAAGCCG3606543
3606544GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGCGATCGCATGGCTGATCGTCTAAATCGGACTATT3606615
3606616GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTGCCCATCAAACATTGTTTGCTGGCGGTTTTATT3606686
3606687GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCTCAGAATAATGTGGCGGGTGCGGTCAATCTTCTTCAAC3606763
3606764GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTGATAGTCTGATCCTGGTACAATATCATTAGTCAC3606836
3606837GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTGACTAACGTGATTGCGTTAGGCAATGTCCCTT3606907
3606908GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC3606944
Left flanking sequence : Till position 3601305 (length bp)
TATTGTTTTATTGGTCAGCAATAATTGTCTGTTTTTTTTTAATTTTACATGACAAGTTCGGAAGAGCCAA
CATCTATTGATACTCCCGTCTCGATTACAG
Right flanking sequence : From position 3606945 (length bp)
GTAAAGCTGGTACAACCTTTTTTCGCTCGATCCATGTTCTGGGAGGGGGACAAGCCAGCTAGAAGGTAGA
TAGAGCAAGCGATATAGCTCTTTGTCCCTT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp