Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP011304_23                                                                                                                 top


Strain : Microcystis aeruginosa NIES-2549 GCF_000981785 RefSeq :NZ_CP011304 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP011304_23
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACNumber of repetitions :27
Begin Position : 3610677 End Position : 3612581

3610677GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAGAGCGTCTAGGAGGGCTGCTTATGGCGTAATC3610747
3610748GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACACTCGCTAAAGTCTTTGGGGGGAGATGTAGAAAT3610818
3610819GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATGGGTTAGTCTGTGGGGATAGTATAGAGAAAACTG3610891
3610892GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACACAGACTCAACCTTATCAGCAATCTCAACGGTATT3610963
3610964GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAGATCGATCTGATCGAGCGATCATCTTCTTTCTT3611035
3611036GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATTTAGTGGAATTGGCTAATCAAGCTGGTGATG3611105
3611106GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTGCGCTTTTGATCTCAATAACTCAGGATTTAATAG3611177
3611178GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGAAACCGAAGATTAATTTTATCAGACTCAAACCT3611248
3611249GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTGCCGAAAGGCAAATTCGCAACTTTTGCGGATTT3611319
3611320GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAGCTTTCTTTCAGTACCCGGCTCACAAGCCTGA3611390
3611391GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTATTTGATTCCGATAAGCTATTAGAGCAGTTACAA3611463
3611464GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTTCTTGTCTGAGGATACTAAATAATCTAGGTTTT3611535
3611536GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAACGGACGCGATCGGAACCGTAACGGGTGAGGGAAT3611608
3611609GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAAAGACAAGCTTTTGGGGACTTGGCAAAAAGCCAA3611681
3611682GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGACTTAAGGCCGTCATGGCAGACCGGGATGTAAAT3611753
3611754GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGCATTAGATGATTTACTGCAATCCCTTGAGGGATT3611825
3611826GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGCCGTCAAGGCTCAACCCTGCTAACTGGTAAACTC3611897
3611898GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAGATGGTTTTTTAGGGTGTCTAGAATACTGTTTAG3611970
3611971GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCTTCCTTGCTTTAAGCTTGGCAGCGTACTTGTCT3612042
3612043GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTTAATAGCGAGTCACCCTTGTCGGGGTTAGTCATT3612115
3612116GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGGAAATTTCCCCACTGAGAAAGCAGTCCATTAGC3612186
3612187GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCGTTGACGGCTGCCGTCCGGGAACCGGCGATGAGA3612258
3612259GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAGTCTTCTGGCAATTAGGCCGCGCCCTAAAATTGT3612330
3612331GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCTCACTTTTATACGATTTTATTAATCAATGCCTA3612402
3612403GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAATTACGGTTTTTTCTGGATCGGCGCGAAGGTT3612473
3612474GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGAGATCACTTTTACTAATATCCTACTCCAAAAAA3612544
3612545GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC3612581
Left flanking sequence : Till position 3610677 (length bp)
AACAACTAAAGCTTATGCTTGTAGCTAAGTGAAATCATTGATTAAGAGACCTGTACTTTTCAATGACTTT
TTCAGCAAACCCTAATTACCAGCAATAGAA
Right flanking sequence : From position 3612581 (length bp)
CGCCCAGTGGTAAAAGCCATACGCTATGGGATTTTCAAGGTTCGTATGCGCCGCACCTGCAATAAACCAA
TCATACAGCAAGTGACCCAGTTCTTCAAGA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp