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CRISPRs details
NZ_CP012174_3
Flanking alignement tool
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NZ_CP012174_3                                                                                                                 
top
Strain :
Metallosphaera sedula ARS120-1 GCF_001266695
RefSeq :
NZ_CP012174 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP012174_3
DR consensus (24 bp) :
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
Number of repetitions :
56
Begin Position :
1097327
End Position :
1100889
1097327
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAGGCGAAATGCAGAAGATGTAGTAGCAAAGACAGCTGTGA
1097391
1097392
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CAACTCTCATGATTATAATCCCTCCATTTTAAAATGTATT
1097455
1097456
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAGTTTACTTCAGTTAATGAGCAAGTCAGCGCAGTGCTAA
1097519
1097520
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTATATTTACGGGTAAGACGGCGTTAACGAAGCGTTAGG
1097582
1097583
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AGTTTAAACGTTACAACTCTCGTTTCCAAACACCTCGTTTGT
1097648
1097649
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAAACGAGACCTTTGGCTAAATAAACCGCACCATAGATAT
1097712
1097713
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTATGAAATTGTCGCATTCGTATGCAAAATATTTCTGGATCT
1097778
1097779
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TACATATCCTTCAATTGTGATCTAGCGTATGCTGGTAGT
1097841
1097842
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATTTGGATTTTGATAATTTTCTTTTCTTTGTCATAATAAT
1097905
1097906
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TATAGTTAAGTCATTTTTTCTTCTTGTGGTGGTATTACCTAT
1097971
1097972
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TACCAATTTCTGCTAATAACGTGAACGTACTCTCGCTGAG
1098035
1098036
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TAACTTATCCCCTACATGATTGCGAAAAAACAACAAT
1098096
1098097
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TGTTTTTAAGGACCTGGAGGCAGTCCGCCATTTACCCCAC
1098160
1098161
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TGAGAACAGCTGTCTTCACTGCTGACCATCGAGCGACCT
1098223
1098224
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTTTCTTTCTCATACATTACTCTTATTAGTTTACTAACAA
1098287
1098288
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTTCTTGTTCTTCTCTCTGCTTTACGCCTTCTTGTTCTTCC
1098352
1098353
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCTGTACGTGGGTCAATAAATGTCACAATCGCGTACTTCTT
1098417
1098418
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATAATAATCAACGAGGCAAACTCCATGTTCTACAAACCA
1098480
1098481
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ACTAGGCAAACGATACTGAGACACAGCGGGACTGCAG
1098541
1098542
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTGGAAACACTCCGTATCAATCCTTTAGACTGCAACTCCTCA
1098607
1098608
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AACATTAGTGTAAAGCCTGCAGCGTTTGCTGGAAGCACGG
1098671
1098672
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCTCGTCCTTAAATTTCAAAACTTCCATGTAGCTCGCCCCCTCT
1098739
1098740
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTTATGTACACACCACCTGAGCTAAGGAGTGTCTTAATCT
1098803
1098804
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAATGGGACGATGAGGGTGTTCAACAGATACAACACCACAG
1098868
1098869
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATTATATATAATATATGAATAATAGCCCCCGTGCTTCGCGCCTT
1098936
1098937
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCTTTTGCACTATCCATTCCGACCACATCTCTCGGCTTCGATAC
1099004
1099005
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTGACGACGTGCTTACTCTTCTTTCCAGTTCTTGTTACTT
1099068
1099069
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTATCGATAAAATCGTAAACGATTTGTTGCCTTATTACGTGAA
1099135
1099136
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ACACCTCTACTAACTTTACCAAAGCCTATCATAGTCCCAACG
1099201
1099202
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CCTTTATTCTTGCTATTAGATCGAATAAATCGCTCGCG
1099263
1099264
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TAAGTGGACACTATTGATCACCTCAGGGCTAGATATATGCCT
1099329
1099330
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCATTGAAATACTCAGCAACTGTATCCCTTAACTCTTCCTTATTA
1099398
1099399
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AGTATACCTGGGAGTGCTGATGTAGATGCGTCACCGACCACGTT
1099466
1099467
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ACTACGGGTCTCAAGGTAGTCGGTGTTCTTCTAGTAGCTG
1099530
1099531
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATCGTACTTTGCGCTGTACCTTATGAACAGTGGAATGTCCC
1099595
1099596
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
GTAAAGGGGTTGTGTTTTACGTTTTGAGTGGTGTTTACGAC
1099660
1099661
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTAAACATATATGAGTTCATTTTTTCCGACTTTCCTAGA
1099723
1099724
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TAAAGTGATAGAATAAAAGCTATTATTCCAACTATTTCT
1099786
1099787
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
CCTTGGCAACTCGGACCCCCTCAAGCGTACGGAAGAGATT
1099850
1099851
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AAACTCTCGATCAAGACATTTATTGTCTCTTCATCTATCT
1099914
1099915
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TCTAAGGAGGATAAAGAGGAAGATTGGGCATTTTGTTCTGT
1099979
1099980
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TTAGTGTTTACGTATGCTCTTTGTTGAGCTAGTTGTTGAT
1100043
1100044
CTTAATCTCCTATGGAGTTTTCAC
GAGGATGATTATAAGCTCAGGGAGAAGATTGT
1100099
1100100
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
ACGTAACCTGTAGATGTGTAACCAGGCTCAGACGAGAA
1100161
1100162
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GAACATCCGCCTTATCGTTATCTTTCTTCTTGAACAGGAAC
1100226
1100227
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TCAATTTATCATACCTACCTAGTCTTACTAAAGTACAGT
1100289
1100290
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GTTGGACTACCTGAAGTAATCGAGCTCAGTGGAGGCA
1100350
1100351
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GTTTTCACGTGATACTTTATGATGTCGTTGCATCTATCGA
1100414
1100415
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AGGACATAAGGCCTTGGCCATGGTCTCAATATCCCATTCTT
1100479
1100480
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GCACTGACGTTTACTATCTGCAGCCCACTTGGTGACTG
1100541
1100542
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAT
ACACTGCCTTGATGAGCGGGATGCTTCCAATTCTCCCTCT
1100605
1100606
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AGGATTCTTCTAAATGCTGTGACAAATGTTAGAATTAGATA
1100670
1100671
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
CAACGAAGAAAGAGTCGAGAAACTAAGCAGAGTCGAGCACT
1100735
1100736
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TATTCGTCGTACGATTCCACTTCAACAGAGTTCACAATAA
1100799
1100800
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AGTTGCTCTAGCAGGAGAAGATCCTGCTCTTCGATTTTGAAT
1100865
1100866
GTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
1100889
Left flanking sequence : Till position 1097327 (length
bp)
GATTTCATGACTTGGGATAAAAATTGATGATCGTAAGAAGAGAAAAGTATATAAGTTGGGGAGAAAATGG
TAGATGTGTTGAAGAACACAAAAAGTTTCA
Right flanking sequence : From position 1100889 (length
bp)
ATTACACTAAATACTACGTAATATGAATAGGTACTGTGAGACGAGAGTGGACTTTTACCTTTGCGGACGG
TGTTAAATTTCAGAATCAGTATCCTCTACT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp