Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP012889_11                                                                                                                 top


Strain : Porphyromonas gingivalis 381 GCF_001314265 RefSeq :NZ_CP012889 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP012889_11
DR consensus (30 bp) : GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATNumber of repetitions :120
Begin Position : 2205469 End Position : 2213348

2205469GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAACGAAATGAAAAAGACAACAAACAGAAGACCCTC2205534
2205535GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGTGCCAGCTGCAGGGGGATGACATAGCCATTGACGA2205600
2205601GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGTGCCAGCTGCAGGGGGATGACATAGCCATTGACGA2205666
2205667GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCCGCGCCGCGAGGTGGAGACCCTGCCGGAGGCGAA2205732
2205733GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCTGAGAAAGAGGGGAGGGAGGAGCGATAGACGAAGT2205799
2205800GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGAGAATCTATTGAGTAGCGAAGTCGTCACAAAGAT2205865
2205866GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGCCATAGCTCTTCAATTTCAATTTCTTCTTTTAAT2205931
2205932GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGAAAATAACAAAAATAGATATATTTATAAAAAAGA2205997
2205998GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATACTCTTATCATCTACTATCTCAAAAGCTCTTTTT2206061
2206062GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCGCTATAACCCTATGTGATTCAGGAATCGGCTTGCTA2206129
2206130GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGAAACATTCGAGCCGTATTCAATTACGCCATCAATG2206195
2206196GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCACCCATTGTGCCGCCGTCCTGACCGAAAACTTCTTTA2206263
2206264GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCGCTATAACCCTATGTGATTCAGGAATCGGCTTGCTA2206331
2206332GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGAAACATTCGAGCCGTATTCAATTACGCCATCAATG2206397
2206398GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCACCCATTGTGCCGCCGTCCTGACCGAAAACTTCTTTA2206465
2206466GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCGCTATAACCCTATGTGATTCAGGAATCGGCTTGCTA2206533
2206534GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGAAACATTCGAGCCGTATTCAATTACGCCATCAATG2206599
2206600GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCACCCATTGTGCCGCCGTCCTGACCGAAAACTTCTTTA2206667
2206668GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTTCTTCATCTCGCGCTTGCTCAAAAGCGCGTTCA2206733
2206734GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGCATCAAGTCACGAACTTTCTGCGAGATGGAAA2206797
2206798GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCGTCTCGAAAAAATATCGGGACGTTTTTGTTTTCT2206863
2206864GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCTCCTTCACTTTGTCGACAATGTGCACTGTATTTG2206928
2206929GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGGCGGAGTATCTCTTTGCCACCCAGTCCGCGCGCA2206994
2206995GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGTAACCGCCTCGGTAGACCGCTCCGCACGGTCGTT2207060
2207061GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGTGCATTCCGGACAGCTTTCGCTTAAAAAGTTAGCGG2207127
2207128GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAGAACGAACGCCTGCGCGATAAGCACCGCGAGCGTA2207194
2207195GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTTACCTGCAGACTTGTGCCCACCCACTTGATAGA2207260
2207261GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGGTCACGGAGCGATACCATGAGTGTTTAGTAGATG2207326
2207327GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGGAGGAGATCAGCTATGCGGATGATACCACCCGTG2207392
2207393GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCAGAAAACTCGCGTCCATCTGATAGATGTACACGA2207458
2207459GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTAAACGATCGAGGCGCGGAGACCCTCCTTGCCAGTA2207524
2207525GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCGTTCAGGAAAAAGTAACCGAGCTGAAGACCATGCT2207591
2207592GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGGTGCTATCGCAGGACTGCAGGACATCCTCAATC2207656
2207657GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGCCGCTCGACTTGACGCCATGCAAAAACAGATAGA2207722
2207723GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCTGCGAGTTGTGAGAGGCAATAAACTGCTGGGAGC2207788
2207789GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTGCTGTTAATTCTGTCATCTCTTATTTCTTTTA2207853
2207854GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCTATCTGCGTATAGCCCTCGCCGTCCACGCCCTG2207918
2207919GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGGGAAGCTGCTTTGCTCGCTGAGATAGCAGCACTTCA2207985
2207986GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTTATTGACGCCACCCCGCCGACGAAAAAAAATCAT2208051
2208052GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTTCGGTCTTTACGTTTGTCGCCACGGATACATGCT2208117
2208118GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTGTAAATAAATTACATGGCTATTGAAAAACAAATT2208184
2208185GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGATTGTACGACTTTGCTATAAAGTCTGAGTTATTAA2208250
2208251GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTATCAACAATCACCGTCATATGTGTAATATACTTGA2208316
2208317GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGGGCAGGCGTATTGCCCCACTTCTCCCCGAATGCAT2208382
2208383GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGAGGAATCATATCAGTGTTTATTTTTTCATCGATT2208448
2208449GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGGAAGTGGGTAGAAGAAAGCCCCAACGTGTTTAAG2208514
2208515GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCATGACAAAGAGACGGTTATCGGTAGAGGACAGGCA2208580
2208581GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGCGTGGAAGGGGCATGTACACTTGTAGTTCGCCC2208645
2208646GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGACAGGCCCTGCAGCGTGTGAGAGCGGAAATGC2208709
2208710GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTTTCAATCATGATATTTTATTTTTCCTGCAAACGC2208776
2208777GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCGCATGTGGGAGCGCGGCGGTCTCTGCTTTACGAA2208842
2208843GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCAGCGTGATGAGCGCTTGAGGCTCCTCCATCGAGT2208908
2208909GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAGGATGATTTGGAAAATTTAGTAAGATAGTTGATA2208974
2208975GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTCTTGGAGAAAGCGAAGACCATGAACCTAAGCGTCG2209041
2209042GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGGAAATATAGTTATTGTATCTACTAAAAGACATAGT2209107
2209108GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATACCCCATCTTGCAGAGTATATGCGAGCAAAATTT2209171
2209172GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTAGTTAGCACAGTTGCTACTATCGTAGTAGCTGT2209235
2209236GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGATAAACTTTCTTCTCGAATTAAGAAAATCGAGA2209300
2209301GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCGCGGCCATCGAGGCCACCGCCTCCGTCCTCCGCG2209366
2209367GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTATGAAAACAGAAAAGAACTTCTCAGCCCTGAGTTTG2209433
2209434GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCAAACTCAATGATTATCTGTCAAGAAGCAAGAAACGA2209500
2209501GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGTAAAAATTACCCTAGATGCCGAAACGGACGGCCTT2209567
2209568GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCAGAATTTGCACGAACAGTATGATGTTCGTGTTCTT2209633
2209634GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAGCGCGAGACAGGCCGAGCCGGCACAGCTTAGTGC2209699
2209700GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAAACGGCGATAAAATAGCGTTCGAGATTTTCCGCA2209765
2209766GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTAGTTGTAGCGATTGTCTCAGTTGCATTACTCCTTAC2209832
2209833GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAATAACGAGAAAAAGAATGCTTAAATTGTTCTTCGT2209899
2209900GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGAAGAGGGTAAACTATTTGCTAATCTTGAATGCTT2209965
2209966GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCTCAATATCTTTCATAGCTACTAAAAATTTACGAA2210031
2210032GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTGCTGTTAATTCTGTCATCTCTTATTTCTTTTA2210096
2210097GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCTATCTGCGTATAGCCCTCGCCGTCCACGCCCTG2210161
2210162GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGCCCCCTCACCCATCTAACCTCGAGCCGTTGAGCC2210227
2210228GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGATTACATAATGATAGACGACAGAGATTGTGCAGAA2210293
2210294GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGTACTGATAATTACGCTGCAAGGTCAGACGGTGAT2210358
2210359GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTGCCAGGGCTTGCTGATGCGCGCGCTCCAGCTGCT2210424
2210425GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATACAGAACCAGCTCCGTCAAATCTCCCGCTTTTTGTC2210490
2210491GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGCCCCCTCACCCATCTAATCTCGAGCCGCTGAGCC2210556
2210557GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTATTCATTCGCTCAAGCGAGGGCATCCTGCTGCAGC2210622
2210623GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCTCGCGGAGGGAGAGGGTGCCGGTATCCTGCCTCC2210688
2210689GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGAGTCTGTATGTGAAAGTGTAGTTCGAAACATTAT2210754
2210755GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGAATACTTTGAAGTTGTATTCAATTACTTTGAA2210818
2210819GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCGTTGTGACAGAGCTGCGCCGTCGTGGCTATGATG2210884
2210885GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGAAAGCCCGAAGATAATCTACACGCAAGATTGTTA2210950
2210951GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGTCATCAGGTGGATATTCTTACTGCTATCCACGA2211015
2211016GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCGTCTGCGACGTATCGCAGCTCTGCCAGCTCCGCG2211081
2211082GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCATCTTCGCAGGAAAGAAGAAGGCTCCGTCCTCGA2211147
2211148GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAACAGTCAAGGGGGAGCCGACCTCTCCGGCGGATTT2211213
2211214GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCAGTGCGGCCGACAAGGCTAACCTCGCTCAGCTGA2211279
2211280GTTTTAATTTCTGTATGGTGCAATTGAAATAATCCATGTTCATGAGGAGAGGATACGAGTTCTATT2211345
2211346GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCTTTTGCTATTGCAGCAAACATATACAATAATAA2211410
2211411GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATACTTCATGGATTTAGCGAGATACTCATTATAATTAA2211476
2211477GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCTTCAAAGATAGTTGTTATCAAATATCGCGCTGAA2211542
2211543GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATCTTCAAAGATAGTTGTTATCAAATATCGCGCTGAA2211609
2211610GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCTCAAGCGTCCAAGAAAGTTCAAGAAATTGTACTA2211675
2211676GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTACTATGGTGTCTGCATTTGAGATACGCAAATAGCAA2211742
2211743GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCTCAATATCTTTCATTGCGACGAGAAATTTGCGAA2211808
2211809GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAATCTATGATGATATAGAAGAAGACGACTTGTTGTT2211874
2211875GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTAATGATTTTCTGAAATAAAGAAGCAGTTGCATA2211940
2211941GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCTCAATATCTTTCATTGCGACGAGGAACTTGCGAA2212005
2212006GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCCCGTGGTAACTCATACCACCGACTATTCCACCGT2212071
2212072GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTTGAGTAATCATCGAATAATTATCGATTAATCATT2212137
2212138GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTATATGCATCATATTCTTAAAGTATTTTATTTGAA2212203
2212204GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGACGAATACGGCGTTCATCATCGATAGTCGCGATGC2212269
2212270GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGGGCGGCCAACCGGTCACAACAAGAATAGACCGAT2212335
2212336GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTCCTTCCAGTCGCAGCTTAAGATACTGCGACTAC2212400
2212401GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAATTTTCATCAGAGCATAAAAAAGGGCAAACTTTTT2212466
2212467GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGATACGAGCACCAAGGCTGCGATACCGATTGCGTA2212531
2212532GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCTCGAGCAGATCTTCCTGCTCTTTGATGAGTGAGG2212597
2212598GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCAGGTTGATTATAATGTTGAAGATGCTTTAAGGG2212662
2212663GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCTCGTATCGACTTTCAAGCAGGCTGGAGTGCAGCCT2212728
2212729GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAATATGAGATCGGAAACAATTATAGTTGCGTCGATAT2212795
2212796GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCACAATAACCGACAAAATGTCTCGCGTAACGTACAA2212862
2212863GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGTCGCCTGTTTTCTTGAACTCCTCACTGATTCGTA2212927
2212928GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGATGGTGTCGACATCATACGACAATAGATCGTCGA2212992
2212993GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGATGGTGTCGACATCATACGACAATAGATCGTCGA2213057
2213058GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAATATTTTTTCAAAAATTGTAAAACTTATTAAGTCA2213123
2213124GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAGTTGCTGATTGTCTTAGAATGAAAGGTTATGCTC2213189
2213190GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATAATATTACATAATGGCACACTGATGGTAAACTT2213254
2213255GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCATGATGTACAAATATATCATGATCGTATACTAC2213318
2213319GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT2213348
Left flanking sequence : Till position 2205469 (length bp)
TGCTGTTTTTAATACTCAAATATACAAAACAACTCCCTATTATACAATGAATTAACAAACAAAATACACA
CCAATCGCCGTGCAAAGGTCTCCATATATC
Right flanking sequence : From position 2213348 (length bp)
CCGTTACAAATATAGGCTTTTCTGTTTGAATGTGAGGAGTTTACGAGAAGGTGAAACCCAAAATTCAGAC
ATTCATAGTTGTCGATGTCTGATTCTATGA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp