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CRISPRs details
NZ_CP013018_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP013018_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium pasteurianum DSM 525 = ATCC 6013 GCF_001856645
RefSeq :
NZ_CP013018 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP013018_2
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
Number of repetitions :
38
Begin Position :
2832672
End Position :
2835133
2832672
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GGTGGTAGTTTAGATACAGATATAAGTCAATATGTA
2832737
2832738
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TGATGCTAAAGTTGCATTAACAATCATTTTTTGTGC
2832803
2832804
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ATGCAATTTTATACCAAATGCCGCAGATATTTGT
2832867
2832868
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATACTTTTATAATTTCATCCTTTGTAACACCTTCC
2832933
2832934
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CATAGATAAATTCACCTACCTTTCTATTTTTGTTTT
2832999
2833000
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GTAGAAGAATATGAGCTCTTTACAAGTTCATTAATT
2833065
2833066
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CATCTCTGCCAGTGCTATGTTTGCAATTGGTAAAGA
2833131
2833132
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATTTAACTTCTGAACACTCTTCAATCCATATTAT
2833196
2833197
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CCACTAAATAAATAAACTCTATCGCCATCTTGTTTGG
2833263
2833264
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ATTTAGGTGATTGCCAAGTTCCGTTGGAGTTCCAAG
2833329
2833330
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTTATATTCAAAACTAATTCCTTTTTAGTCATTACT
2833395
2833396
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TACAAATAAATTCAATTCTTCCGTAGAAAATGAAA
2833460
2833461
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TCAATACATATCTCTTTGGTATAATTAGCTTCTC
2833524
2833525
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ACATATGAGTATGGTCTTTATCACATTCTATTGCAA
2833590
2833591
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAAAACAAGAAACAAGTCTTATCAAATATGAAATGTC
2833657
2833658
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TGATTTTTCATCGCCAAGATCAGCATACCAAATTTGC
2833724
2833725
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GTACTATTAGCAACTGCAACATCTTCTTCAACTTTT
2833790
2833791
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATAATGTATGCTTTGGTATTGCACCTATCCTATTT
2833856
2833857
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ACTTTTTCTATCTCAGTCCAATACACAGTAATAAT
2833921
2833922
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTTCTTCATCGCAATGAGGACAATCAAATTTTAC
2833985
2833986
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAATCACTTCAACTTCCTCACTGTTTACAGTTACAA
2834051
2834052
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CCTTTTTCTGTCAAGTTCTTTTTTTATTTTTTCACA
2834117
2834118
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CAAACTGGCTAGAAGAAACGAAACGGATGTAATAA
2834182
2834183
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAGAAGTGATTCTTCATCCTGATAATTCCACTTAGT
2834248
2834249
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATCTATTGTTACTGGTGTAGCTTTACCTGCTAGC
2834313
2834314
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATTCTTTAAAATGTCTTTTGTGTTTAATACATTAT
2834379
2834380
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAACAAAGGTTAATAGCTTAGCTTTTGTTTTGAGG
2834444
2834445
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTACCTGTTACACTAAATTCATCAACCAAGATTTT
2834509
2834510
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTACTTTTTCTCTGCTGTTAGACGGTATATCAACGCA
2834576
2834577
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CAGTTTGCCTTTAATTCTTGTTTCTTGCCATTCACT
2834642
2834643
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ACTAGATGCTCTCTACAAGATATTGAGTTCACATAT
2834708
2834709
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GGTAAGGAGCATAAGAGCATAGATAAAGATGACTG
2834773
2834774
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CCAACTATACCATCTACAGGAAGATGCAATATAGTC
2834839
2834840
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GCTGACTGGCATTTAATTTTTTAGCAATTTCGACCTG
2834906
2834907
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CTGTGGTACTTACCTTTAAAGCAATGCTGTTACTCAA
2834973
2834974
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GGAGTAAGACCACCAGTAATTGCAATCCCTGTCCA
2835038
2835039
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TAGAGCAAGGTAATGTAATTTAGATACTTAAAATT
2835103
2835104
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
2835133
Left flanking sequence : Till position 2832672 (length
bp)
AATAACTCTGTTCTATCCATAATAAAATCCCATCCTTAATTTAAATATTAGATAATTAATATTATAACAT
ATTTATTAATCATTTATCCTTTATTTTAAC
Right flanking sequence : From position 2835133 (length
bp)
TACTTAAAACTAGCCATTCTTTACTATAATTATAATGCTCTATTCATTAAAAATAAAGGATTTAGCAAAA
ATTTTACCAGCTATTTTTAGTCTTACGTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp