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CRISPRs details
NZ_CP013019_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP013019_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium pasteurianum GCF_001856695
RefSeq :
NZ_CP013019 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP013019_2
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
Number of repetitions :
38
Begin Position :
2831683
End Position :
2834144
2831683
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GGTGGTAGTTTAGATACAGATATAAGTCAATATGTA
2831748
2831749
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TGATGCTAAAGTTGCATTAACAATCATTTTTTGTGC
2831814
2831815
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ATGCAATTTTATACCAAATGCCGCAGATATTTGT
2831878
2831879
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATACTTTTATAATTTCATCCTTTGTAACACCTTCC
2831944
2831945
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CATAGATAAATTCACCTACCTTTCTATTTTTGTTTT
2832010
2832011
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GTAGAAGAATATGAGCTCTTTACAAGTTCATTAATT
2832076
2832077
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CATCTCTGCCAGTGCTATGTTTGCAATTGGTAAAGA
2832142
2832143
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATTTAACTTCTGAACACTCTTCAATCCATATTAT
2832207
2832208
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CCACTAAATAAATAAACTCTATCGCCATCTTGTTTGG
2832274
2832275
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ATTTAGGTGATTGCCAAGTTCCGTTGGAGTTCCAAG
2832340
2832341
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTTATATTCAAAACTAATTCCTTTTTAGTCATTACT
2832406
2832407
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TACAAATAAATTCAATTCTTCCGTAGAAAATGAAA
2832471
2832472
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TCAATACATATCTCTTTGGTATAATTAGCTTCTC
2832535
2832536
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ACATATGAGTATGGTCTTTATCACATTCTATTGCAA
2832601
2832602
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAAAACAAGAAACAAGTCTTATCAAATATGAAATGTC
2832668
2832669
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TGATTTTTCATCGCCAAGATCAGCATACCAAATTTGC
2832735
2832736
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GTACTATTAGCAACTGCAACATCTTCTTCAACTTTT
2832801
2832802
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATAATGTATGCTTTGGTATTGCACCTATCCTATTT
2832867
2832868
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ACTTTTTCTATCTCAGTCCAATACACAGTAATAAT
2832932
2832933
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTTCTTCATCGCAATGAGGACAATCAAATTTTAC
2832996
2832997
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAATCACTTCAACTTCCTCACTGTTTACAGTTACAA
2833062
2833063
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CCTTTTTCTGTCAAGTTCTTTTTTTATTTTTTCACA
2833128
2833129
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CAAACTGGCTAGAAGAAACGAAACGGATGTAATAA
2833193
2833194
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAGAAGTGATTCTTCATCCTGATAATTCCACTTAGT
2833259
2833260
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATCTATTGTTACTGGTGTAGCTTTACCTGCTAGC
2833324
2833325
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATTCTTTAAAATGTCTTTTGTGTTTAATACATTAT
2833390
2833391
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAACAAAGGTTAATAGCTTAGCTTTTGTTTTGAGG
2833455
2833456
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTACCTGTTACACTAAATTCATCAACCAAGATTTT
2833520
2833521
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTACTTTTTCTCTGCTGTTAGACGGTATATCAACGCA
2833587
2833588
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CAGTTTGCCTTTAATTCTTGTTTCTTGCCATTCACT
2833653
2833654
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ACTAGATGCTCTCTACAAGATATTGAGTTCACATAT
2833719
2833720
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GGTAAGGAGCATAAGAGCATAGATAAAGATGACTG
2833784
2833785
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CCAACTATACCATCTACAGGAAGATGCAATATAGTC
2833850
2833851
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GCTGACTGGCATTTAATTTTTTAGCAATTTCGACCTG
2833917
2833918
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CTGTGGTACTTACCTTTAAAGCAATGCTGTTACTCAA
2833984
2833985
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GGAGTAAGACCACCAGTAATTGCAATCCCTGTCCA
2834049
2834050
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TAGAGCAAGGTAATGTAATTTAGATACTTAAAATT
2834114
2834115
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
2834144
Left flanking sequence : Till position 2831683 (length
bp)
AATAACTCTGTTCTATCCATAATAAAATCCCATCCTTAATTTAAATATTAGATAATTAATATTATAACAT
ATTTATTAATCATTTATCCTTTATTTTAAC
Right flanking sequence : From position 2834144 (length
bp)
TACTTAAAACTAGCCATTCTTTACTATAATTATAATGCTCTATTCATTAAAAATAAAGGATTTAGCAAAA
ATTTTACCAGCTATTTTTAGTCTTACGTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp