Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP013019_2                                                                                                                 top


Strain : Clostridium pasteurianum GCF_001856695 RefSeq :NZ_CP013019 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP013019_2
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACNumber of repetitions :38
Begin Position : 2831683 End Position : 2834144

2831683ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGGTGGTAGTTTAGATACAGATATAAGTCAATATGTA2831748
2831749ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTGATGCTAAAGTTGCATTAACAATCATTTTTTGTGC2831814
2831815ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACATGCAATTTTATACCAAATGCCGCAGATATTTGT2831878
2831879ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTATACTTTTATAATTTCATCCTTTGTAACACCTTCC2831944
2831945ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCATAGATAAATTCACCTACCTTTCTATTTTTGTTTT2832010
2832011ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGTAGAAGAATATGAGCTCTTTACAAGTTCATTAATT2832076
2832077ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCATCTCTGCCAGTGCTATGTTTGCAATTGGTAAAGA2832142
2832143ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTATTTAACTTCTGAACACTCTTCAATCCATATTAT2832207
2832208ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCCACTAAATAAATAAACTCTATCGCCATCTTGTTTGG2832274
2832275ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACATTTAGGTGATTGCCAAGTTCCGTTGGAGTTCCAAG2832340
2832341ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTTTATATTCAAAACTAATTCCTTTTTAGTCATTACT2832406
2832407ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTACAAATAAATTCAATTCTTCCGTAGAAAATGAAA2832471
2832472ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTCAATACATATCTCTTTGGTATAATTAGCTTCTC2832535
2832536ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACACATATGAGTATGGTCTTTATCACATTCTATTGCAA2832601
2832602ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAAAACAAGAAACAAGTCTTATCAAATATGAAATGTC2832668
2832669ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTGATTTTTCATCGCCAAGATCAGCATACCAAATTTGC2832735
2832736ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGTACTATTAGCAACTGCAACATCTTCTTCAACTTTT2832801
2832802ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTATAATGTATGCTTTGGTATTGCACCTATCCTATTT2832867
2832868ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACACTTTTTCTATCTCAGTCCAATACACAGTAATAAT2832932
2832933ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTTTCTTCATCGCAATGAGGACAATCAAATTTTAC2832996
2832997ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAATCACTTCAACTTCCTCACTGTTTACAGTTACAA2833062
2833063ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCCTTTTTCTGTCAAGTTCTTTTTTTATTTTTTCACA2833128
2833129ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCAAACTGGCTAGAAGAAACGAAACGGATGTAATAA2833193
2833194ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAGAAGTGATTCTTCATCCTGATAATTCCACTTAGT2833259
2833260ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTATCTATTGTTACTGGTGTAGCTTTACCTGCTAGC2833324
2833325ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTATTCTTTAAAATGTCTTTTGTGTTTAATACATTAT2833390
2833391ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAACAAAGGTTAATAGCTTAGCTTTTGTTTTGAGG2833455
2833456ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTTACCTGTTACACTAAATTCATCAACCAAGATTTT2833520
2833521ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTTACTTTTTCTCTGCTGTTAGACGGTATATCAACGCA2833587
2833588ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCAGTTTGCCTTTAATTCTTGTTTCTTGCCATTCACT2833653
2833654ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACACTAGATGCTCTCTACAAGATATTGAGTTCACATAT2833719
2833720ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGGTAAGGAGCATAAGAGCATAGATAAAGATGACTG2833784
2833785ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCCAACTATACCATCTACAGGAAGATGCAATATAGTC2833850
2833851ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGCTGACTGGCATTTAATTTTTTAGCAATTTCGACCTG2833917
2833918ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCTGTGGTACTTACCTTTAAAGCAATGCTGTTACTCAA2833984
2833985ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGGAGTAAGACCACCAGTAATTGCAATCCCTGTCCA2834049
2834050ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTAGAGCAAGGTAATGTAATTTAGATACTTAAAATT2834114
2834115ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC2834144
Left flanking sequence : Till position 2831683 (length bp)
AATAACTCTGTTCTATCCATAATAAAATCCCATCCTTAATTTAAATATTAGATAATTAATATTATAACAT
ATTTATTAATCATTTATCCTTTATTTTAAC
Right flanking sequence : From position 2834144 (length bp)
TACTTAAAACTAGCCATTCTTTACTATAATTATAATGCTCTATTCATTAAAAATAAAGGATTTAGCAAAA
ATTTTACCAGCTATTTTTAGTCTTACGTAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp