Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP013131_7                                                                                                                 top


Strain : Porphyromonas gingivalis A7A1-28 GCF_001444325 RefSeq :NZ_CP013131 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP013131_7
DR consensus (30 bp) : ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACNumber of repetitions :64
Begin Position : 1960677 End Position : 1964875

1960677ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTCGCCTTGGATCACATTCGTTTCGTTGAGTTACTGAA1960743
1960744ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTCGATACGCATCTGTGCGAGGGCGTTCTGCAGCTGT1960809
1960810ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACAATTTTGCGGTAATTTCGTCCGCATTCGTTTCACGC1960875
1960876ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACATTAGTACGGCCTTGTATGACGTTCCCTTTATTAA1960940
1960941ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGAGTTGAGTTTTTGTAAGCTTCGTTATAGCTCTGGGCA1961008
1961009ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACACTTCCCATCATTAAAGCGACACAACATCAGCGCATA1961075
1961076ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACATATGTTAAGATTATGAACGAGCAAACAAAGATCAA1961141
1961142ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACCTTTATTAGACACCTTGACGGCGAGTTCGTCGCCGG1961207
1961208ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACCTTCTAATTTCTTGATTACAGCGTCGCGCATATCGTA1961274
1961275ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTATCCAGTCGCAGGGCGTTAATCTCCTCGAGGGTGT1961340
1961341ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTGCTCAGCTGCAAAGGGGCGGGCGCGGCCGCGGGG1961405
1961406ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACCGACGTTGTCGGGGTTGTGGTCGTTGATGCGGTCAA1961471
1961472ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTGCTGCAAAAGTCCACTATTCCGCGCGCAAAAGAAA1961537
1961538ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACCCCACGAAATTCTCACGAAACTACGTCAAGTGATGA1961603
1961604ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGGACGGGCGCCCGTTTTTGTCGAGTATATCGACTCGG1961670
1961671ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACATCAGTAGAAAATATGGCAACACAAACTACAACCC1961735
1961736ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTACGTATCATGACTGACCTCCTTCTGTTTTCGTGAG1961801
1961802ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGAATAGCCGACTTCGAAAGCAAGATCGAGCGCGCC1961866
1961867ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGAGCGACGGGGGGCGATACCGCAATACTGGTCTGTGG1961933
1961934ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACAGCGTGAACCCTGCCTCCAGCAGGGCATCATGTACG1961999
1962000ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACCAGGGAGAGGGGCAGAGCAAAGCAAGAGCGATTTG1962064
1962065ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTTCTGCGAGATATGCGGACGCAAAGCTACTGATGCGG1962131
1962132ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGTGGGTGTTACTCCTTTTTCCGCTCTTGTGACCCAACA1962199
1962200ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACATAGAAGCATGATCTCCCTCCAACATAGCCAATTGTT1962266
1962267ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTTGGGGGAAGCGGGAACACGAATCGATTGTTATACACA1962334
1962335ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTATGGCCAAAAAGGAAAGGAGGTGTAATCAATGACT1962400
1962401ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTGCAAAAACAGATAGATGGGGAGGTAAGCCATTATAA1962467
1962468ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACAAATTCTTTATCGATCGCTTTAGCTCTCTTCGGC1962531
1962532ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACATCGGACAATGGGTAAACAAGTCCGTTAGATTCATAT1962598
1962599ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGTTGGTGGTTTTGCTCTAAATTTGATTTCTCTTCTCA1962665
1962666ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACAGGGATATGGTTTCCAAATTCTACGAGTATTGGTC1962730
1962731ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGACTTCCATTCTCTTTAATAAAAGTGGCAAAGCAA1962795
1962796ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACCAAACTCATGGCTGAGAAGTCCTTTCTTGTTTTCATA1962862
1962863ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTAGGCAATAGCACCTATGGCAAATACTCTACCCCA1962927
1962928ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGGAGTTATTGTTTGAATAATTCCAAGAGGATTTAAG1962993
1962994ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACCATTTGAAGAACTAGATTATAAAAACAGCACAAGC1963058
1963059ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGAAAGTTCATAACCTTATCCCAATTTGAAATAAGA1963123
1963124ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACACAGCAACAAAGATCGTAGCGACTATGCTGACGAT1963188
1963189ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGTACATACTTCCGCTTTCAGAAGTAAAGTCTGGTTG1963254
1963255ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTTAGTTTCGGCATCAAGAGTCAATATTACAACTTT1963319
1963320ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACACCCAATATAATCCAGTCTTCGATAGTTCTCCTTAAATA1963388
1963389ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGAGTCAGTACGGAAGAGATTCGGAATGTACTGTTCTA1963455
1963456ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGTAGTAAGTTTGAAGCTGCGTCGGACAGAGGTTCTA1963521
1963522ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTTCTTCTCCTTCTTTGCTATTACGTGAACACGAATAG1963588
1963589ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGATAAAACTCTATTGGTTCCCTCCATGCTATTTCAGA1963655
1963656ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACAAGGGAACCGGTACGAAGTTAAGAAGTGATGATGT1963720
1963721ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGGCGTGTTGATGCCGTGCCCGTTGTCGATCAGAAT1963785
1963786ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACACGAGCGTTTTGTCCAGATCCCACTTAGCGATCATG1963851
1963852ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTTTTATGCGCCCAGGTTTGAGTGCGGATTTCGGCC1963916
1963917ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGAAATCACCTCGTTCAACAATGCGATGGGAGCTGC1963981
1963982ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACACGCTCGCGCCACGCCGGCGCGCCCGGACAGGTCTCG1964048
1964049ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACGCAAAAATTCGGACAGGATTATTTTTTTCTCCTTCCG1964115
1964116ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACAGTCGGAGCCGTCTGCTTTTTTCCACTTCCCTGTTGC1964182
1964183ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTCGTCTGATATGCGGGGTATTCCTGATCCCCGATGC1964248
1964249ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACAGTCTACTCCCGGATGACGGGAAGATTTACACCCT1964313
1964314ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACCTCAAATGTGGATTTGCTGACCCCAACGTGCGAGA1964378
1964379ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTAGAAAAAACGTGGCTTACAAGCTCCGAAGCCATATT1964445
1964446ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACACGTGCGAGATAAACAGCAAGATTCTTTCTTTAAG1964510
1964511ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACTAAGGCATCTGGAGGCCGGGGTAAAGACAGCAAATG1964576
1964577ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACAGCTTGCGACGGAAAACCAGCCGCTTTTCGAGCAGG1964642
1964643ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACATAAGAAAGAATACAACCGCTATTATTATAACAAGCCT1964710
1964711ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACATAATTTTTCAGAACTGAAAGAAAGAATCCTCGCAAA1964777
1964778ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAACATTCGGGCGTATGAGGCGTGCGACAGCAGGTTCCGATT1964845
1964846ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAT1964875
Left flanking sequence : Till position 1960677 (length bp)
CAGGCGGCCTCCGATGCCGCTGTGGACTTTTTCAGCCAATCGGGATTGCATAGATCAAAAAGGTTAAAAG
CCCTCCGATGCCGCTGTGGACTTTTTCAGC
Right flanking sequence : From position 1964875 (length bp)
GTATCCATTATACTACTCCCAAAAACTGACAACTAGTTTCGGGGTTATTTGGCTTGTTTTTTAGGTATAG
AGACCTTTGCACGGCAATTGGTGTGTATTT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp