CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP018900_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP018900_1                                                                                                                 
top
Strain :
Campylobacter coli GCF_001936355
RefSeq :
NZ_CP018900 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP018900_1
DR consensus (36 bp) :
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
Number of repetitions :
15
Begin Position :
1471055
End Position :
1472013
1471055
ATTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
TCCATTCTCATGAAATATTTAGCCATTATT
1471120
1471121
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
TGTTTAACGCTATAAATGTGGTCTCTTATA
1471186
1471187
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
GTTTCTTTCTTATTTACTCTATACTCTAAA
1471252
1471253
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
GAAAAAAATTTTTTGTAGACCTTCCACAT
1471317
1471318
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
CGCCTTCGCTTGAAACTTGACAAAACATTG
1471383
1471384
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
ATATATAAATTTGGTTATGAGGCTTTAAGT
1471449
1471450
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
AGATAACGAGTTATATTCAGAAATACCAAA
1471515
1471516
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
CTCAAACTTAGATAGTGAAAACAAATTTAC
1471581
1471582
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
AAAATAAATCCTTATATTGCCAAAGATTTT
1471647
1471648
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
CACGAGATACTAATGCTAGCATGTTAGGCG
1471713
1471714
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
CTACCCCTATCCACAACCGCCAAGTGATTA
1471779
1471780
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
AAAAAGCGTTTTAATTATGTAGATTTTAAC
1471845
1471846
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
GGATCAGATTGTAATATATGTAATTGAGAT
1471911
1471912
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
AATCGGGTTATAAGGCATATTGTTAGCTAG
1471977
1471978
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
1472013
Left flanking sequence : Till position 1471055 (length
bp)
TTTCGATTTTAATCAACCCTAAATTTCAATAAGTTTCAAATTCGCAACCTCCTTTTAGTGGAGTAATTAG
CCCTAGCGGAGTTTCAATCCACTAGGGTTT
Right flanking sequence : From position 1472013 (length
bp)
AGATATTTACCAGATAATGAAAATTTCGGGGTTTTTTCATGAAAAATAGCAAAAATTATGCTATAATCTC
ATAAGAAATTTAAAAAGGGACTAAAATAAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp