CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP019041_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP019041_1                                                                                                                 
top
Strain :
Acinetobacter junii GCF_001941805
RefSeq :
NZ_CP019041 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP019041_1
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
Number of repetitions :
122
Begin Position :
2665411
End Position :
2672701
2665411
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ACGCTTACTTTTATTGGTCAATATTGCTTTAT
2665470
2665471
TTTCTAAATGGCGTGTGCCGCCATGAAC
ATTCGCTAATAAAACCCATACCATGAATTGCT
2665530
2665531
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TACTATACCCGCAGCACATCCCTGCGCTGTAA
2665590
2665591
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATTCAGCTTTATTTTTGCCACCCGTTGAATCA
2665650
2665651
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AATGTCGGAGGAAATTACAAAGTCGGGGTGAA
2665710
2665711
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TATCGTTTTGCTTACTCACATCACCCCCGAAT
2665770
2665771
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CCCACCCGACATGGCTTAACATTAGCCTGTAC
2665830
2665831
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CTTTTAATTTGGTTTTGGATTCAGGTCAAACA
2665890
2665891
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TAAATCGTTTTACCCACCCAATAACACTAGAT
2665950
2665951
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTGAGGGTATTCGATTAAATGCTTATGACGAT
2666010
2666011
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AAGATGCTCGTTTAGAAGCAACTCGCTTGCGT
2666070
2666071
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTCTTGGTTCGGATGAAGATTGTGTGATTGAT
2666130
2666131
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GTGTGGCATCGGCGCACAAATTAAAACTTATC
2666190
2666191
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATTGTTATGGCGAGAACTGTAAATGAATTGCA
2666250
2666251
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ACACAACAAACAGGCTACTTATCTGCTGAGCA
2666310
2666311
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ACCACCAAGCAAAAAACAAATTATTTCAAGTA
2666370
2666371
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TGCAGAATTATTTGTCTTACTCTCGCCCTACT
2666430
2666431
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TGTAGCTAAAATTTGGCTTCTCGCTCCTTCTT
2666490
2666491
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CTCATTACCATGTCATGTGGTGGATTCCTAAA
2666550
2666551
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATTAAGTGCTAAATGGCCCTTTCTCAAATATA
2666610
2666611
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTTCTCAAAATCAGGCGATTGTACATCGTTAA
2666670
2666671
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CGATGAACTTTTTAACTCGTTCTGCAGTGCAA
2666730
2666731
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TCACTAGTAATTACTGTTGCTCGCTCTGATTG
2666790
2666791
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATTCGCATGGATTCAGAACGCTTCCACACCAT
2666850
2666851
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CCAATGTTGATGCAGTGAATCCAATTTCTATT
2666910
2666911
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CTAACGTAGTCGATCATATTGTTCCGCATAGA
2666970
2666971
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATAGATAGCCTGAATCAGTTTTAATCCTTAAA
2667030
2667031
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GTCCATTTGGTTCGGATGCTAAAGCCGTACTA
2667090
2667091
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AAGTTTCAAAAGTTTTAAAGGCTGGTGCTGCT
2667150
2667151
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATGATCTAATCACTTCAAATGATGCTCTCTAT
2667210
2667211
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTTCTCAAAATCAGGCGATTGTACATCGTTAA
2667270
2667271
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CGATGAACTTTTTAACTCGTTCTGCAGTGCAA
2667330
2667331
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TCACTAGTAATTACTGTTGCTCGCTCTGATTG
2667390
2667391
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATTCGCATGGATTCAGAACGCTTCCACACCAT
2667450
2667451
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CCAATGTTGATGCAGTGAATCCAATTTCTATT
2667510
2667511
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TACAGAGGAAATGCTAGGTTCAATTGCTCGAT
2667570
2667571
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTTCTCAAAATCAGGCGATTGTACATCGTTAA
2667630
2667631
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATCTCAGATGCGCGTAACATTGTATACATCAT
2667690
2667691
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTGATCTAATCAATAAGGGTGTAGCTAGCAAA
2667750
2667751
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATGAGCAATACTTCTTAAGGCGTCCTTGATAA
2667810
2667811
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TCGCCCCCTTTCCAATTAATCGGGGCTTTTAT
2667870
2667871
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ACTGAACAAGATCAAGAAAAGAAACTCTCACT
2667930
2667931
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AATAAAATGTCGCGCATCCAAGTGGCGGAGGA
2667990
2667991
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CTGCTCTCGTGTCCACGCTTGGCCGTTAATGA
2668050
2668051
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTTAATATTTCTCGCAACGATGTACAACACAG
2668110
2668111
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GATAAACAACAACTTGGTATTTATCTTCGGTA
2668170
2668171
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTTAATATTTCTCGCAACGATGTACAACACAG
2668230
2668231
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GATAAACAACAACTTGGTATTTATCTTCGGTA
2668290
2668291
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GTTAAAAATAAACTCGATGCTGTAGATCAATT
2668350
2668351
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GTAAGAGACCTGGAACCAGGGATAAAAACCCT
2668410
2668411
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TAGTAATTTTTTCGGGCTGTGGTTGGCTGTTA
2668470
2668471
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AGAATCCCATGATTGTCGACCTAACAACTCAC
2668530
2668531
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AGATATTGCGTTCTACTGGAGTTACTTCTACA
2668590
2668591
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GCATTGGCATTGCTCATAAGCGCAGCAGATAC
2668650
2668651
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATATAGTGCATATATACAAGGGCTTCGAGTGT
2668710
2668711
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TATTATTCACAACAAGAAATTAGAGAACTATT
2668770
2668771
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATGATGTTTTATAGACAATTTGATTGTTAGCA
2668830
2668831
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TGTAAATAGTGATGTGTCTGTGTCTGGTCTAT
2668890
2668891
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATTTCAAAATCATCACCCTTGTATTCCCTGTCA
2668951
2668952
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GTGACATTTTTCCATCGTTGTCGCAATACTCA
2669011
2669012
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GCGCAAGAACTTTCGAGACAGCACCAACCGTA
2669071
2669072
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ACATAGAGAGCCATCAACTGGGGCAGCCTTAA
2669131
2669132
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AACAGCACCACGATTGACATATTTTTGTAGAC
2669191
2669192
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AAGAAGTCATTGAATACACAAATGAAGTCTCT
2669251
2669252
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GAGAAAGATACAGAAGTATCTGTGATGTCGTC
2669311
2669312
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GCAGTAGAGCAATTGCTAGGCACTGTTGATTG
2669371
2669372
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ACGTCAGCCAAGTAGCAAAAGTTCTAAGAGGT
2669431
2669432
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CTACAACAACACTAGGCGGTTGGACTCTCGGT
2669491
2669492
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GTAAATCGGTTACTTGATTGGTTTCAGTATCA
2669551
2669552
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTGGCTTGGCTTTACTGCTGGGATCGCTATTT
2669611
2669612
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TGTTGTCAATTTCCCCACGACATTAACTAACT
2669671
2669672
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GTATATACAGAATTACGAGTATATTACCATCG
2669731
2669732
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CGCAAATGGTTATGTTGGGGAGTCCCATTATT
2669791
2669792
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AAGAACTAGCAGGCGTACAAACTGCTGTTGTT
2669851
2669852
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ACGTCATTTCATCGAGCGTGAATTGGGTGCTC
2669911
2669912
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTGAGTTTTTTGACCTGAATAGATGGCAGTAA
2669971
2669972
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GGAACGTGAAAGCGCCGTTATTGCCGCTGTTT
2670031
2670032
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GATACAATGCTGCATGAGTCAGGCTTTGTATC
2670091
2670092
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TAATTGGATTAATATTGTTACTCCGCTAATGT
2670151
2670152
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AATTACACCGCGAAGAGCAGTTGTCACAGTAT
2670211
2670212
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CGTCAGCAAGAATTTGTATTGCGCCTTTATGT
2670271
2670272
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTGAACATGGCGCAAACAGCGCAATCTATACA
2670331
2670332
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GAGCGGTGCATTCGCATTGCTCAAAGCTACAC
2670391
2670392
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TATCCGTGGTGGGATGACAAGAACTACCGCAT
2670451
2670452
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GGCTGCTTTCCAGCCCGACCAATGATCTCGAC
2670511
2670512
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATCGCATCGTATGGCCGTAGGCTCACCAACAA
2670571
2670572
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TATCAACCGTTGCAGCGCCGAGACTTCCGATT
2670631
2670632
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TCATTGGCCGTCAGGCTGCGGTCATTGCATAC
2670691
2670692
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AAGCAGCTCTATTAAAAATCATGCTGTCGTAA
2670751
2670752
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTTAGGCGCTTGTTTCATAAAATTTCCTCGTA
2670811
2670812
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GAAGCTCCTGCAGCGCCGTTTTAATTTGTTCA
2670871
2670872
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CAAAGAATTCCTTAAACATGCTCACCTCATTC
2670931
2670932
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TGCATGAAGCGGCTAGAATCGTCTTCGCACTCA
2670992
2670993
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CCTAACACGGCGGCAGTTGGAACAACTCCAGA
2671052
2671053
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TGAGGATGTGCCTGTATACATTGATGGTTATA
2671112
2671113
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AAATAATCGTTTAGTCACCGTTCGTTGATTTC
2671172
2671173
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AGTAAAACATGTTCGGTCATATCGCCGATGAT
2671232
2671233
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TGGTGAAAGAAAATGCAACAAGGTGAGTATGT
2671292
2671293
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TCGGTACTGAATTAGAGAGCTTTGATGTTAAA
2671352
2671353
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
ATCATTCATGGCAATATTCTCGATTACCAACC
2671412
2671413
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TGCACCATTAGGCAATCTGAAAGCACCAACAA
2671472
2671473
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AGGTTGCGCTAGTACAGGCTCTAAGAGTGCAT
2671532
2671533
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TCCTCAACCTTCTCCACTCTTGAAAGGTTTGT
2671592
2671593
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TAACTGATGAACCGCATCAATAATTTCATCTT
2671652
2671653
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GTCCAGATGGATCAGGTTCAACTGCCTATATC
2671712
2671713
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TGTTGTTAGCTATTTAGCTACTCGTTGTTGAG
2671772
2671773
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CAACTAATAGCGTATGCCCTGTCACTTTCACA
2671832
2671833
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTATTAAAGCAGGTACAGGATGCTCCTGGAAT
2671892
2671893
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTTGCAAAGGCTCTCAACAACTCCCCTTTGTC
2671952
2671953
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TTTGATTGCTGCGATGGCCGTTTCTTCTGAAA
2672012
2672013
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GTCAACGAGGTTACAAACCAATGCGATCTGTGG
2672073
2672074
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
CTGTGGTTCTACATACCATTCTGGCAATTGTT
2672133
2672134
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GTACTTCATCATAAATAATAATTGAGCCGTCA
2672193
2672194
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AACATGGCAAAGGTCTGTGAAATCGTCAACGA
2672253
2672254
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TCTAGCACGCATGCTTGATTGGTCAAAGGCTT
2672313
2672314
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
AGCTTATCCAGTTCTAGCACGCATGCTTGATT
2672373
2672374
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TAAAAAATACGTAGCTTGTCGGTGAGGTGCGA
2672433
2672434
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TATTCGCTATGTACTGTCTTATTCGTGAAAAA
2672493
2672494
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GTAACACGTTTAAAACAAGGTGCTGTTGTTGC
2672553
2672554
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
TAACCGCCCTACTTTCTCCACATTCCCATTGT
2672613
2672614
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
GTGAAACTGCATAAAGGGTTTTTCCTGCACCA
2672673
2672674
TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC
2672701
Left flanking sequence : Till position 2665411 (length
bp)
CTTATTAATTCTTAAAATAAATTCCGTAATGAACACACAGAACAAATGCCAATCAAGACCGTTACATTTC
TAAATGGCTCATATGAATAAATCACATGTA
Right flanking sequence : From position 2672701 (length
bp)
TATAAAATTATAGTAAAAATATAAGTTACAACAAGTATTTATGATGGTTTTTTAGCAATTTACCCAATCA
AAAAACGACTTGATGTAACTTATTGATTTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp