CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP019468_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP019468_3                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium perfringens GCF_002018235
RefSeq :
NZ_CP019468 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP019468_3
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
Number of repetitions :
35
Begin Position :
1236434
End Position :
1238672
1236434
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTTCAATTGTATCTTTGTCAATCTCTAACTCTTTTT
1236498
1236499
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AAGGAAAATAATGCAGCTAGAACGCTTTCTGAATCTC
1236564
1236565
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TGTACTAAAACTGGATAATCTCCAATATCTAAATTA
1236629
1236630
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ATTATTGTAAAGTAATACTAAGAAATACTAAGTATA
1236694
1236695
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTATTTATAATCTTAAAAATAAAGAGGGAAGCTATGG
1236760
1236761
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AGTTGATATTTGGAGTAAAGATGGAATTGAAGCTAG
1236825
1236826
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AAGAAGAACTTTACAATGCATTAAGAGAAGAATGTA
1236890
1236891
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ATGTTAGCTTTGAAAATGCTATAATTGGTACAAGTA
1236955
1236956
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TAAATATTTAATAATTGTTTAAATATACTTTCAAAA
1237020
1237021
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TATAAATTTGTTAAATATAATCCTTATACGATAGAA
1237085
1237086
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TCCCTTCTTCTTTCCACATTTTATATCCTGTAATGG
1237150
1237151
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TGTACTAAAACTGGATAATCTCCAATATCTAAATTA
1237215
1237216
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTGGTATTACTAGCTTTGAAGCACTTACAAGTAAAA
1237280
1237281
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
CTCCTAAATCACAATCTTTAAAAGACAATTCC
1237341
1237342
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
CTTATAGCTGCATTGATAGGTGCTTTAATAACTCCT
1237406
1237407
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TGTTAAAGTAGGATATTTTAGAGAGTTTGGAACTAT
1237471
1237472
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AGTAATGATAATAGATTAGATGATAACTTAAACTGT
1237536
1237537
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AAAGAGTAAAGGCAGATACTTTTGTTTCTCCTTTGC
1237601
1237602
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ATTACCATATTTTTCTCTTAATCTTAAAAGTTCTTCG
1237667
1237668
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
CTTATAGGTGATGAACCTGATGAACTTGTAGCATTA
1237732
1237733
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTTTAATAGTATAGGAGATGAATTAGAATGAGAAAG
1237797
1237798
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTGTCTGAACGAATATCTATGTTATAAACTTTATTA
1237862
1237863
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ACGAAACCAAAAGAACAATAATACTTTTCCATTTT
1237926
1237927
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TGTTAAAATCATCTTCATTCATGATTTGGAAAGCCT
1237991
1237992
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AACATTGGTGTACATTTAACACTTAAAGATTTTAAC
1238056
1238057
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AATGTTTGTGTCCAATCTCTACTAAATGCTCCTTTG
1238121
1238122
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ACTAATTTCATTGAAATACCTCCTAATAACTAACGT
1238186
1238187
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TGTAATCTCTACATGTACTATGACACCCAACAATTC
1238251
1238252
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
GGAGTTTTACTTTTCTTTATATCTTTTCTTTTCCATG
1238317
1238318
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTGGTATTACTAGCTTTGAAGCACTTACAAGTAAAA
1238382
1238383
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AAAAGTTATCAACAAGAATTAAGGGATATATCTCAA
1238447
1238448
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TAGTTTTGGTAAAGTTAATAAGATATTAAAGAAACA
1238512
1238513
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ATTTTTTGCTCTAACCCTTGCCTTCCCATTTAAGCG
1238577
1238578
ATTTTATCTTAACTATGAGAAATGTAAAT
TCATCTGATAAAACTCTTAAAATAATATATTGATTAC
1238643
1238644
GTTTTATATTAATTATGATGGGTGTAAAA
1238672
Left flanking sequence : Till position 1236434 (length
bp)
AAAACATTACTGATGGTCTACTGCAAAATTTTAATATTTATGATAAAATTAACAATAGAGAATGAGTCTA
TTACTAGCTTTTAGCATTTTGAAATTTAGG
Right flanking sequence : From position 1238672 (length
bp)
AAATAAAAAAAGCATCTTAAAAAGATACCTTTAAACTTAGAATTTTTTGTTTCAATAGCAAGTGCACCTA
ATGCAGATATATTTCCAACAATGTTTTGGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp