Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP019721_7                                                                                                                 top


Strain : Veillonella parvula GCF_002005185 RefSeq :NZ_CP019721 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP019721_7
DR consensus (35 bp) : GTTTCCGTCCCCTAATGGGGATCATTTAATTTAACNumber of repetitions :15
Begin Position : 565150 End Position : 566267

565150GTTTCCGTCCCCATCAGGGGATTATTTAATTTAACGAAAAAGTAGAGGGTAAAGAATACAAAAAAATGGTATTC565223
565224GTTTCCGTCCCCCAATGGGGATTATTTAATTTAACCATTAGCTGTAATTTCAATGATGACAACAGGAGTTGTCTTTG565300
565301GTTTCCGTCCCCATCAGGGGATTATTTAATTTAACTTAAGGAGGACGAGGAATAATGGGCTATATGTTAATTG565373
565374GTTTCCGTCCCCCAATGAGGATTATTTAATTTAACTAGCACGATTCAAGATGTTTAATGTCATGTTGAATGGTAACGT565451
565452ATTTCCGTCCCCATCAGGGGATTATTTAATTTAACAATTCATCAATATGATGCGTTCATTTACAACGATGAACACAGT565529
565530GTTTCCGTCCCCATTAGGGGATCATTTAATTTAACACAAGTCCAGGTGATTTAAAGATCGGAGACGCTACTCCGTTAAT565608
565609GTTTCCGTCCCCTAATGGGGATCATTTAATTTAACGTTAGACCGACTAAATCGCTGATGCGGAGACCAGAGTTAATTC565686
565687GTTTCCGTCCCCTAATGGGGATCATTTAATTTAACATACATCAAATTTCTTTTATTGGTGTCAAGTTCGCCATAAAAA565764
565765GTTTCCGTCCCCTAATGGGGATCATTTAATTTAACTGTTTCTTCAATTTGTTTATTCATATTAACTACCTTTCTATT565841
565842GTTTCCGTCCCCTAATGGGGATCATTTAATTTAACTATATGGAATATACATATAGAACAATTCAAGATTATTTCTACAA565920
565921GTTTCCGTCCCCTAATGGGGATCATTTAATTTAACACGTTTACATAGATTTCTTTATCTGAATAGATTCTAGAAACTA565998
565999GTTTCCGTCCCCTAATGGGGATCATTTAATTTAACGTACTTCTAACAATAGCTTCTTGATATTCATTATCTACCAT566074
566075GTTTCCGTCCCCTAATGGGGATCATTTAATTTAACTTCAAATATTGTATTCCATAATATCAAATCAGAAATAGATGTAA566153
566154GTTTCCGTCCCCTAATGGGGATCATTTAATTTAACGATAAAACGTGCGTATAAATCATTAGTTTTATTAAAGGAAGAAA566232
566233GTTTCCGTCCCCTAATGGGGATCATTTAATTTAAC566267
Left flanking sequence : Till position 565150 (length bp)
AAACTAGCGGCCAAGAAAAAGGGGTTCCGTCCTCATCAGAGGTTTATTTAATTTAATAATCACGTAGTAT
GAACGCTAATGATTATTGCTGGGTTTTATG
Right flanking sequence : From position 566267 (length bp)
CCTGTCTTTGAAACAACAGATATTTACTGGTTCTAAAATGCCAAAAACGGCGGAGATTGTAAATCTTCTC
TAAAAAGCACTTTAGTAAACTAAAATAATG
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp