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CRISPRs details
NZ_CP019870_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP019870_1                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridioides difficile GCF_002007885
RefSeq :
NZ_CP019870 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP019870_1
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
Number of repetitions :
27
Begin Position :
752098
End Position :
753834
752098
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
TGGAAAACTTGTCAAAAATAGCATCAAAGCATTTATA
752163
752164
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
GGGGCTTTTGGGGACATGAGTGTTACAGATGCACTAA
752229
752230
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AGCCCCCTAATGCTGGAACAGTGAGGACACACAAAC
752294
752295
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
GAACTTTTAAAAGATTATGCTAGGAAAATTCATGTTGCTG
752363
752364
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AAGCCAAAAGCTACGAATTTGAACTAAAATGCGTGG
752428
752429
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
TGCCTAGGGAACCCCTCCAGCCCCTAACCATGCAACA
752494
752495
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AACAAGAAAAACCAACAACAAAACCAACAACAAAAAG
752560
752561
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
CTTTCCATAAAATACCCCCTACTTCATTTTTATTTA
752625
752626
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AAGACCAAGCCACTTCCGCAATTGCATCTTCTAACAT
752691
752692
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AAATATTTTGTTGACTTATTTCAAACTTTAGAGGAC
752756
752757
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AGTGTATTTTTATCATTCTATCTACTATACCAAAAAA
752822
752823
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
GCATACCTGTAACCTGCATCATTTTGTATCTATCTT
752887
752888
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AAAAGATTGTAATGAGTACGAGACAAGATTTATTGT
752952
752953
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
TATATAAATTTTCTTTTTCTTCTATTTCTAAGTTCA
753017
753018
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
GTTGTATAGCTAGTACTTCCTGCTTTAAATCCTTTTC
753083
753084
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AAGACAAGGTTCTTCTTTTAAGTGGCAAGCTATAAAA
753149
753150
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
CGAGTAAAATAACAATTATCTGGAATGTGAGAAGTT
753214
753215
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
TACACATAATTACAACCCAGTTTACTTTTTGCTACAC
753280
753281
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
TATGAATATATTACATAATCATAAAGATTTACAAATG
753346
753347
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
TCTCTAAATCCATCTATAACGTTACCAGCAAAATCA
753411
753412
ATTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AAGAACTTTTCATGAACGTGGAAAATATTGAGTTCA
753476
753477
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
TTGTCATTTACGACTACCATTTCTCTAGCATTTATAT
753542
753543
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
GGGAAAATATGGGAAAAGTTAACTAATATAATGCAAA
753608
753609
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
GAAATTTTTAGTGCTATTGCAACTACTCTTGTTTGT
753673
753674
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
GCATAACCAAAAACTTCAAAATCAAGACCTCGAATTT
753739
753740
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
TGCGCAATAACATGCTGAAAACTGCAATTTCGAAGT
753804
753805
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
753833
Left flanking sequence : Till position 752098 (length
bp)
ATTGCACTACTGCTCGCTCACTGCAAATTTTGATGTTTTTATTGAATTATAATTGCTTGATTGAAGTGTT
TTCAATGTATTCAAATATACCTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 753834 (length
bp)
GGATAAAGAAAAGACTCACACAAGGCACAGTGTCAGGTTTTATATCAACTAAGGGTAGATAAGTAGAATA
TTAGCAATATCAACGAGTATTTAGAAACTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp