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CRISPRs details
NZ_HG004426_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_HG004426_1                                                                                                                 
top
Strain :
Campylobacter fetus subsp. venerealis 84-112 GCF_000967135
RefSeq :
NZ_HG004426 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_HG004426_1
DR consensus (30 bp) :
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
Number of repetitions :
25
Begin Position :
684618
End Position :
686228
684618
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
CCGTAAGCTACATTGTAAGCTAAGTCTTCAAAGACT
684683
684684
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
TATAAAGGGACCTACGAACTAAGCTAGAACCCTTTT
684749
684750
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
GTGTAAGCAAGATGGCAAGAGACTATCTCCTGTTGT
684815
684816
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
CGGGGAGCAACGTTAGCAATCTCATTTCCGTCCAT
684880
684881
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
TGGGGATTCGATGAAATTTTTAACTATATAGCATTC
684946
684947
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
TTTTTATAAGGCTCATTTTTGAAGATATTATGCTGC
685012
685013
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
CGGGGAGCAACGTTAGCAATCTCATTTCCGTCCAT
685077
685078
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
TGGGGATTCGATGAAATTTTTAACTATATAGCATTC
685143
685144
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
TTTTTATAAGGCTCATTTTTGAAGATATTATGCTGC
685209
685210
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
TCCAGAGCTAATAAGGGATTTAGAGCAGCTAAAAACT
685276
685277
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
CGCAAAAAGAGTTGAAATATATAGATAATAGGTTAA
685342
685343
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
AATCCAACTTAACAAAAATGTTATATAAAATCACC
685407
685408
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
TAAACTATTTCGTTATCCTGGTTGATACCGCTTAAA
685473
685474
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
ATGAGTTTAAATTTGATAGATCTGAAAAGATTATTC
685539
685540
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
CTTGATACTTTTTGCTTGATTAGCTTTGCATTTTTA
685605
685606
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
TTTGAAGTGCACGACGCTATAACTAGAACACGGATC
685671
685672
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
ATTAAAGCCGAATTACTCCCATTTTTTTTGACTTGG
685737
685738
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
TGTATGTTGGTAGCTTTTATGGTTACTTTACATAAC
685803
685804
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
TCACCAAAAAAACCAGGAATTAAATAAAAAGTAAAA
685869
685870
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
AATCCAACTTAACAAAAATGTTATATAAAATCACC
685934
685935
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
TAAGCAAGGCTTATAAGCTCTTTACAATGCATTTTT
686000
686001
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
AGAACTGTTTTAACCTCACTTCCATCAATCTCTTTT
686066
686067
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTTAAAC
CAGTATGCCATTTGATTCTAGTTCGCCTATAGCTCT
686132
686133
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
CATCCTCCTTTTAATTTATTACATTTAAACAATTTA
686198
686199
GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC
686228
Left flanking sequence : Till position 684618 (length
bp)
TAACAAATAATCTATTTTTAATAGTTTTAGATAATATCTTTTAATTTATTTTTTATCTTAATTGCTTTTT
TAAATTTACTTAGATGATGAGTTTATTATA
Right flanking sequence : From position 686228 (length
bp)
AAGAGCAAACATGGCAGAGACCTTAAAAGAGAAGTTTAAAGGCGTACTAAGTGCAAATACTAGCTATTTT
GAAGGAGTGAGCGACCACATTATAAGTCAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp