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CRISPRs details
NZ_LN554847_1
Flanking alignement tool
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NZ_LN554847_1                                                                                                                 
top
Strain :
Aliivibrio wodanis GCF_000953695
RefSeq :
NZ_LN554847 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_LN554847_1
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
Number of repetitions :
41
Begin Position :
1058738
End Position :
1061169
1058738
TTAATATGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC
ACCATGGAATATTTGCGGCGTTTGCCTGGGGC
1058797
1058798
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAC
TTGTGTTTATATTTACACCATCAATAACGAAA
1058857
1058858
TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC
AGCTATACCTTTAACAGCTAAGGTGTGGTGTG
1058917
1058918
TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC
ATTTTTTGAATACCATTTACCCGGGCGGTGTT
1058977
1058978
TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC
CTCTGTTATTTACTATAACGGTTCGAATAACT
1059037
1059038
TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCTGTGAAC
TAGAAGATATTGAAACCAATACACTTAAACTA
1059097
1059098
TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC
ATCACTAAGAATGTGGGTCTTGCTGCTTCTGC
1059157
1059158
TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC
ATGTGGTCTAGCTTAGCTAGTCTTACTATGGA
1059217
1059218
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
TTCAATTACTTGAGTAGCCATACTGATACAGT
1059277
1059278
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
CTTATCACTCTTCGTCAAATTTAAGGCATTCA
1059337
1059338
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
AGCAAATGAGATTACGCGCTCTTTTGCTAATT
1059397
1059398
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
CTCTTTTAACTCTTTAGTTTGCTGCTTGATTT
1059457
1059458
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
CGATAAACTATAAAGAAAGTTTTAAATGTAAA
1059517
1059518
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
ACCTAGCCGCTCGAATGCTAATGACTCCCACA
1059577
1059578
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
ATGATCGCAGTTGCTAGAGGTAAGCGTAACGA
1059637
1059638
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
CATCATAAGGCTGTCCTGGAGTTTGAGACGGT
1059697
1059698
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
AGGAGGTCGATTTAACAGATGATTGATGAACT
1059757
1059758
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
TTATATGATAGCTATGGTCTGGTGAGATAAGA
1059817
1059818
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
CTCAACTTGCGTTTTCTCATCAACAAAACAAA
1059877
1059878
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
ATTTAGCGGTTGCCTGTTTTGCTTGAGCAAATT
1059938
1059939
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
AAACTATCTACGATTGGAACGATTGCCGCTACG
1059999
1060000
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
GAAACTTTAATTTTTTCTTGCTTGGATGAACT
1060059
1060060
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
TATTTAACTTCAATACCGCCAAACGTCAGTTG
1060119
1060120
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
ATGCAACAGCTTCATAGCTTTTTCCGCCACCA
1060179
1060180
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
AAATGAATAAAGAACTTTTAAGCGTAATTAAA
1060239
1060240
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
TATTCAACGGTCAAGTTTCCCCCGCTTTTGATG
1060300
1060301
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
AAGAAATCATAACATCATCACAAACTTGAGTAA
1060361
1060362
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
TTGCAAATGAAAATTTCGTAGTGGTTTCGTCC
1060421
1060422
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
AACCATCCGCAATCTCTCGACAGGTCTCTGGA
1060481
1060482
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
AATAGATTGAATAATTCGTGAATCATCAAATG
1060541
1060542
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
ATATAGAGGGATCATTAACTGGAATAGAAAAC
1060601
1060602
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
GGTTCTGTGGCTTTGGGTATTCCTCAAGCTAT
1060661
1060662
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
TATTAATCATATTATGAACCCAATCTAGTAAA
1060721
1060722
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
CTCAAAAGCTACTGCACACCAGTTACACTGTC
1060781
1060782
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
TGTAACGCCCCCACACTATCCATAATTTAATA
1060841
1060842
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
GATGAAAAAGGCGCAAAGAAGTACCGTTTTAA
1060901
1060902
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
ATTGCTCCTGATGGCTCTAAATGGGCTTGTGT
1060961
1060962
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
TTGTTCCTATTGACGGTTATATTGCTCCTGAT
1061021
1061022
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
GCACCTAGGGTTATTTTAGGATTATACTTATT
1061081
1061082
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
TTGATAAGGGTTTTTTAACTAAACGTTCTGGG
1061141
1061142
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
1061169
Left flanking sequence : Till position 1058738 (length
bp)
TATAATGAAAACGATTCGCATTCACCAGAATAAAAAAGTAAAGATTGTAAAGACGCATAAAATGTAAGGT
TTATTGTGATCAGAGAGGTGTTTTTAGGTT
Right flanking sequence : From position 1061169 (length
bp)
AATAGAATATCAGCACAAAAATAAGTTACAACAAGTAGATAAGTAAAAATACCCATTTTTACCTAATTTT
TCCTACCTATTGTAACTTACTGATTTTATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp