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CRISPRs details
NZ_LN614756_17
Flanking alignement tool
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NZ_LN614756_17                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridioides difficile GCF_000953275
RefSeq :
NZ_LN614756 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_LN614756_17
DR consensus (29 bp) :
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
Number of repetitions :
20
Begin Position :
3412704
End Position :
3413979
3412704
ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGT
GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA
3412767
3412768
TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAAT
AAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT
3412832
3412833
ACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAAC
CTGACACTGTGTCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT
3412898
3412899
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CGGTCGTAACGTGTCAATCCTATTGGGTTTTAGATA
3412963
3412964
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AAGAAAGAGCTATTGAAGCATTAAACAGAATACAGG
3413028
3413029
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CGTCTACTGTTGCATCATTTAGTGACCTAGCACTTTG
3413094
3413095
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ATTTATATAAGTATGCAGGTGAGGGGATTTTTTGATA
3413160
3413161
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TATTAAAAAATTACTACCTTTAAGTTGACCTTTTAAA
3413226
3413227
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AAATATTAGATAGAATAGGGATAAATGAAGAATATG
3413291
3413292
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CAGAGATAGAAATTATTTTTATTATACGTTTTTTTGT
3413357
3413358
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TAATTTGTTCTATTTTTTTATCTAGTAACTTAATTGG
3413423
3413424
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AACTACATATAAATAAATTCAAAGCCATGAAATTCG
3413488
3413489
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ACGGATACTTTCTTTTCTTGCATCAGCATTTTGTTTCA
3413555
3413556
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TATAATATAATGTTTAGTATAACTAAATAATTTTGA
3413620
3413621
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CTTATGGTACTCTTACAAGAGTAGAAGGTGTATACCT
3413686
3413687
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AGAATAAGATAACAACAATAGAATATAAAAATATCGT
3413752
3413753
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TATTAAAATCTGTGAAAAATGCTTGGATGCCAACTCG
3413818
3413819
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
GTTATTCAGATGCATATAAAAACGCAGGTCAAACCTT
3413884
3413885
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AAATTGAAGTAATAAAGAAAATAAGCTATGAAGCTAA
3413950
3413951
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
3413979
Left flanking sequence : Till position 3412704 (length
bp)
TGATTTTATTTATATCTTTACTGTTTAATTTCTTTATCATAAATTTTGTTTCACCTCATTTTTGTATTGA
TTTTATAATGTTTGTAGGTAAGTGTATTTT
Right flanking sequence : From position 3413979 (length
bp)
CCCAAAATAGGTATATTTGAATACATTGAAAACACTTCAATCAAGCAATTATAATTCAATAAAAACATCA
AAATTTGCAGTGAGCGAGCAGTAGTGCAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp