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CRISPRs details
NZ_LN614756_6
Flanking alignement tool
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NZ_LN614756_6                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridioides difficile GCF_000953275
RefSeq :
NZ_LN614756 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_LN614756_6
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
Number of repetitions :
14
Begin Position :
1440053
End Position :
1440936
1440053
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAGCTTTCATAGCATCCTCTTCTGAACATTCATCACT
1440118
1440119
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TAGTAAGTTAACTCATACATACCACCTTCCCCATAAA
1440184
1440185
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TATTATAAATCTTTAAATAGCCTTCTAAGCGTCTACTA
1440251
1440252
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ACATTATCAACATCATCTAATTTTTTTGTCACTGTA
1440316
1440317
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TAAGAATTAACTAATGTGAATTTTTTAGACATGTCAT
1440382
1440383
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ACAAACAAGTGTAGGATAAACTTTCCTTGCCCAGTATA
1440449
1440450
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TAACAAAATTTGCGAGTACACTTATTTCTAATATATC
1440515
1440516
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ATAAGAGTGGTTTAAGAAAATAAGTTATTTTTCAAA
1440580
1440581
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TGACTCGTGCTATTTTTTTTACACGCCTAAGAGGTA
1440645
1440646
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CGAAAAATCTAGGAAAAACTATTGTAAAAGCGTTTA
1440710
1440711
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTTGATTACATGGGCAGTTTTTTATTATAGAGTGTTA
1440776
1440777
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAAAATCTTATTAAAGATTATTCAAAGTCTTTTGATT
1440842
1440843
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT
1440907
1440908
GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG
1440936
Left flanking sequence : Till position 1440053 (length
bp)
GGTATATGATAAATATTATCATTTGCACTACTCGTGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAATTGTATAGATGT
AAGTGTTGGAAATACTCAATTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1440936 (length
bp)
ACAGATATAATGTCAAAATAAGGTTAGGACTTTTAAAAGCATAGCCATATCAGTAAAAATTTAATTATCA
TTTAAAAATAAATTTTTATTTAAAGAATAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp