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CRISPRs details
NZ_LT549890_4
Flanking alignement tool
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NZ_LT549890_4                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus solfataricus P1 GCF_900079115
RefSeq :
NZ_LT549890 (chromosome linear)
CRISPR id :
NZ_LT549890_4
DR consensus (25 bp) :
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
Number of repetitions :
63
Begin Position :
1343786
End Position :
1347729
1343786
ATTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TTGAAGATAGAGTTAAATGAACTTTTGATGACACAAAA
1343848
1343849
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GTCTACACCTCTTGCGTCTATTATGATATCATATTTGTCAA
1343914
1343915
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAATACGTTTTCTCCATTGTCATATTGCGCATAAGTTGA
1343978
1343979
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ACCAAGTGAAACTTGGAATATATAACCAAAAAGATAT
1344040
1344041
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GATTCTTCAATAAAGCTGGTAATATACTTTGACAGAAT
1344103
1344104
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AGTAATAGAAACTCATTCAGAGTCTCTTCCAACCCGTACA
1344168
1344169
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CGTGGTAGTGGTGGTAGTTGTTGTTGTTGTAGGCG
1344228
1344229
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TAGTATAGTGTTACAGTTAAACGCTGTACCGAATAATGG
1344292
1344293
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TAGTATAGTGTTACAGTTAAACGCTGTACCGAATAATGG
1344356
1344357
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAAATGTTTAATATTGGTGGAGTAGTTGATTTCGATAATAT
1344422
1344423
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAGGGTAATAGAAAGCATGCCCATATCAGCAAGTTCTAA
1344486
1344487
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GTAAAATCCCCAACGCCACATACGTTATAAGGGAAGATA
1344550
1344551
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CTAGTGTTAAAATATATTTCAAGCCTTACGATGAGAA
1344612
1344613
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CATGCATCAGTTCATCGTAGTTGAACTCAGCATGGAT
1344674
1344675
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAAATCCATTCGAGGAAGTGTTAGAAGAGGTGTATGGTGA
1344739
1344740
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAGAGGGAAAAAGTTTGCAGGAGATTTCAAGTATTACA
1344802
1344803
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAATATTAAATATTAGTGATTTGGTAATAACGAAAATAAA
1344867
1344868
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GAGTGAGACCATGATCATTAACACTGATATTACGGTAAG
1344931
1344932
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AACAAAACTTCACCAGTGATGGAACATTTGAATGTAA
1344993
1344994
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TGTTAATATTGCCGGTTCGGCTAGTGATATAGTGTGGTTCT
1345059
1345060
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GGTAATGGTCTGTATATTGTCTTTAAGTATTTAT
1345118
1345119
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AGCACTAATTGCGAGATTTGAGGATGCCATCAGAAGTAA
1345182
1345183
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAAGCTAAGATTGCGAGTACAAGCGATCACTTACACAAAG
1345247
1345248
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ACGCCGTTTCTCTATAGTTATTGAACCATGCAATATCATT
1345312
1345313
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ATTAGCTAAACCATTTCAAAGGCTAACATCTTCTATGT
1345375
1345376
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATAAATCCACAAAGTGGCCGTTCAAAGCAAAGAGTTTATT
1345440
1345441
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TGATATTTATTTTCTCGTGAAAAGTGGAGGGCCTAGAAC
1345504
1345505
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATTATATCATGGAGACCCAGGTGCTGTGACTATCAA
1345565
1345566
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AATTAGCCAGCGTGCCATCTGGGTAAACGTGTATTTTGGTTAA
1345633
1345634
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATAATATATTTCGTTCCAACTACACCTAATGGATTCGGG
1345697
1345698
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TAATTGTCTGCCCTTGAGTTCCACTGAGAGAAACGC
1345758
1345759
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAAAGACGTACAAATATACATCGCACCGAACGGACACAT
1345822
1345823
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GGGTGCGTGCCCCACAGGTCGCGGGTCTACCCCTTGC
1345884
1345885
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TTATGTCGTTATCTTCTTCGTTTTTGCTGCGTTGTTT
1345946
1345947
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAAATTTGAAACAATATCGCATCTTGAATAATTAT
1346006
1346007
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CAAGATATATAATGGAGGTGGAAAAGATGAGTGGAGAAAT
1346071
1346072
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GGAAATTGAAAATTATGATGCCATTTGATGAATATTG
1346133
1346134
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GAAGATCTATTAGAACTGTTAGACAGCTATGCAATGA
1346195
1346196
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CTCTGCATCTTATCTAAATCGTGGTACATCTTTAGTAGTC
1346260
1346261
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GGAAGAATGTAAAATTGTGGAATTAGAAGATAAAAG
1346321
1346322
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TGTGCATCACTTCACCACTAAACTTCTCATAGAAGG
1346382
1346383
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CTTAAGACAATTGCAATTGCGCTATCTCCAGGTTTGAAATATAC
1346451
1346452
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATGATGTAACATGATGGTGACAGTAGAAGAAGAAGTGTT
1346515
1346516
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAGGATCTGTATAGTACAGTCACAAAGGAAGAAAT
1346575
1346576
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AATTAGGAAATTTGTGGATCAACTGCCAGAATCTGA
1346636
1346637
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CAGAAATTCTATACAATTTGACGATATCATCAAAT
1346696
1346697
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TTTGGCAAGGAGAATTCAACATATAAAAAATGTTGCAAA
1346760
1346761
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AATAGAGAAATATACAAGGGGAGATCTTTATGATAAAAT
1346824
1346825
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CCAATATCGTGGACGCTGGATAGATTTGCATCCCCTGATGT
1346890
1346891
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CATGAAAGAGATCTCTGATGAAATGATGTCTACTTTGAA
1346954
1346955
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAAGAAGAAATTAAAGTAAATCAACTTCAAATAGAAA
1347016
1347017
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TTCATCAGTGATTTGTTGGTGAAGTATAGTTGAAAATC
1347079
1347080
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CATCTGGACTCGAGGGGCAGGGACAGAAAGCAAATCGG
1347142
1347143
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GTGCGTCCGGGTCACCGATTTTGTTCAATCCATATGCT
1347205
1347206
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AACGCATTTATCAATAAGAACCGAGCGGTGGTGAAAAG
1347268
1347269
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TTGAGCTGAAAATCAACACTACTACCAGGATATGATGTG
1347332
1347333
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GAAAACTGCGCCTGGAGATTACCTAGTCGAATTTTT
1347393
1347394
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAGTATGCATTTCCAGGATTTGTTACTCCACACCAGCC
1347456
1347457
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CTAATGTATCACTCACATCTTTTGATATAATGATACT
1347518
1347519
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CTTGACAACTTGGCTATGGAACTTGCAACCGTAGATGA
1347581
1347582
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CGAATAAAGATACGCAACGCCAAGAGGAAGACTAA
1347641
1347642
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AATGTCCATATGGTGGCCCCCCAATTTCTCTAGAGTAG
1347704
1347705
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
1347729
Left flanking sequence : Till position 1343786 (length
bp)
ACATTGGCTTTGGAGAGGTAGAAGTAAAATCACTTAATGGTTAATGAAACGCTATTTTCTCACTCTAATG
AGGATTATTTTACTTAGACTCTATTGCGTA
Right flanking sequence : From position 1347729 (length
bp)
TGTTGTGTTTTTATACTTCCTATTTTTCTTTTCTCCTTTCTTACTTATAAATCTTCATGACTACCCTTTA
CTCTTCATGCGACCAATTTTAGTTGTAATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp