Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_000916_16                                                                                                                 top


Strain : Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H RefSeq :NC_000916 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_000916_16
DR consensus (30 bp) : GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATNumber of repetitions :47
Begin Position : 1472442 End Position : 1475513

1472442GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATGGTGAAAATACTAACACCCGTAGAAGCCCTTGAAGA 1472507
1472508GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATATTACAATCGTAAGCATTATGGTGAATCGGCTTGT 1472572
1472573GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTGAAAACTACGGAATGGTATAAGAATGGTGAGAGAG 1472638
1472639GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATGTAAATGCGAACTATTACTATAATAATAACCTTTAT 1472704
1472705GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATATATTTACAATTCTAATTTGATTTTTATTTCCCATGAAA 1472773
1472774GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATACTGGAGGAGATGGAAAAGTGCAGCACGAGTGACATC 1472840
1472841GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATATGGAGGTGAAAGGAATGGTAGTGAATGAAAAAATGA 1472907
1472908GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATGAAGCAATGAGCTACGCAGTAGGGTGAGAGAGCAGG 1472973
1472974GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTTATCGTGAAATACTTATTCTTAATCGGTTTTAGGT 1473039
1473040GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTTTATATATAATTTTAACATATCCACAAAATAGTACCTAT 1473109
1473110GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTTACAAACATCTCTATGGTTTCCAGTGCCATGACGA 1473175
1473176GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTAAAGCTTCATTTGATTTACCGTCCATTACAAACAT 1473241
1473242GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATCCAGGAGAGCATCAATGACATGACCAACCGCCTCAAG 1473308
1473309GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTTATGCTCTTAGGAGCATAGCGACGTAGTCATACAA 1473374
1473375GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTTATAAAACCAAGAATGGAAGTAATGAATAGGCCATA 1473441
1473442GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTGGGATGTCCTCGATAGGCTGCGAGAGAGCGCAGC 1473506
1473507GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATAAAGGGTGGCGGAGAGTCGGTAGAAACGATGTGCAATGT 1473575
1473576GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATATCAAGCAAATGGTGATCATTATTTCCAGTACTCTTC 1473642
1473643GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTTTATTTGGACTGGTTTGCCGTCGAGGAAGAATTC 1473707
1473708GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTATTGGTCTCTGTCTCATCCACCGTAACGGTG 1473769
1473770GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTTTTTTATTACCCAATATTTTTCTTCAATTCTTTCCA 1473836
1473837GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTGGACTGATTTAAGCCCAATGGGGGCTCTCAGGGCGG 1473903
1473904GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATACTGGAAAAAAAGAGTACACCACAATCTACACGTAATA 1473971
1473972GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATGAATGCGAGGAGGCTTAAAGCCACATTCAAGG 1474033
1474034GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTATTGGTCTCTGTCTCATCCACCGTAACGGTG 1474095
1474096GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTTTTTTATTACCCAATATTTTTCTTCAATTCTTTCCA 1474162
1474163GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATGCTCAATAAGGGTCGACGTGGCCCCGGAGGCCACGT 1474228
1474229GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTACTGTGCGATCCACAGCTGACAGTGTAATTAAAA 1474293
1474294GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTGGACTGATTTAAGCCCAATGGGGGCTCTCAGGGCGG 1474360
1474361GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATACTGGAAAAAAAGAGTACACCACAATCTACACGTAATA 1474428
1474429GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATGAATGCGAGGAGGCTTAAAGCCACATTCAAGG 1474490
1474491GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTGAAGCACTGTGTTGGCTCAATGCTGTCTAAGTGCTT 1474557
1474558GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATGGGAATACCTGAAGAAGATAAACGCATAGAGTTTGCCGA 1474626
1474627GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATGCTAGTTCATGGCAGATGAGTTCAGCGAGACCATAC 1474692
1474693GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTAGATCACGCCCCCAAGCCACCTTAACCCGTCCGC 1474757
1474758GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATGTACATTTCGGTGGCGATTTTTTTCATTTCACCACCGA 1474825
1474826GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATATCCGAAACATCTCAGTAGCGATTTTTTTCATTTCGC 1474892
1474893GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATGAGTATGGAAATAGCTATGGATGGTGGTTTTCAATTGA 1474960
1474961GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTGGCGATCGTAAGGGCCCTTAACCTGCGACTGG 1475023
1475024GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTAGGAGGGAGGAGTGATCCTCCCCTTTCTTTCTCA 1475088
1475089GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTTCTATCACCTCTTATTTTTCTCTCTGGAGCCGT 1475152
1475153GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATCTATTTTTTCTTTGTCCTCTGTGGTTCTTTTGGATTT 1475219
1475220GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTTCTATTTTTCTTTTCTTTCTTTTGTCTTTCTTTCTAT 1475287
1475288GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATAAAATAACACTATCTAAATCATCAAAATCATTTA 1475351
1475352GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATTTGAGGATTTCATATGCTTCAAAGGGGCTTTTTCCTT 1475418
1475419GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAATGGACACGCGTATAGCCTGAAGACGACCCTCAGCAG 1475483
1475484GTTAAAATCAGACCAAAATGGGATTGAAAT1475513
Left flanking sequence : Till position 1472442 (length bp)
TCCATATAAATGGAGTGCATTATCAGGGATCGACAAATTTATATGTCTGAAAGGAGAAATTTCAGAGCGA
TAGAGGCCAAATAAAGAAAAAATTGGCCAT
Right flanking sequence : From position 1475513 (length bp)
TCATTCTTGGTAGCTTCCACTGTACTTTCCTGATCCCTCCACCGGGAATACCACGGCCTGTACTATCCTT
TCACCCCTCTTTAGTGTATACTCATATTCT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp