Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_003552_15                                                                                                                 top


Strain : Methanosarcina acetivorans C2A RefSeq :NC_003552 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_003552_15
DR consensus (30 bp) : GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACNumber of repetitions :31
Begin Position : 4523522 End Position : 4525551

4523522GTTTCAATCCCTCAAAGGTCTGATTTTAACCGTGCGTGGACTCGGAACCGTCTCCCATTTACATTTATT 4523590
4523591GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACCTAACTTTAATGGGAACGTCTGCGGCTGCTGTTGCTGC 4523658
4523659GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACCGGTTGCAGGAGCTGTAGCGAATGGCTTCATGCAAACC 4523726
4523727GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACTGCATATACTTTCACGCTATCATACCTTTCAAGCGG 4523792
4523793GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACATCCTTTGAATCATGGTTAAAATCCTCAGATATGACC 4523859
4523860GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACCTATCAGGATGTCAATTGGTGTCCTGATGATATCCA 4523925
4523926GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACAGAGTTTTGAGGTCCTTGAACCTGAAAAAAGAATCG 4523991
4523992GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACATTCAAAAACAGTTGCATGTTACACCGGTGCAGATGTG 4524059
4524060GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACTCGGCACAGTAGCCTCTAATGGTTCATACATAGT 4524123
4524124GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACAGTTTTGTTTTGTTGCTATAAAAAATAATAGTGC 4524187
4524188GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACAACGACATTCATCACAATGTAAGGAATGCTAGTGAT 4524253
4524254GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACAGAATCAAGTACGGCTGATGTGTCTTTCCAAGATGT 4524319
4524320GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACAAATGCACGAGCCGCAGCCGTAATTATATTGACGAC 4524385
4524386GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACTATATTTTTTTGTTGACTCTCAAGAAATCAAGCTGT 4524451
4524452GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACCTTATACCTATAAGCCTCCCGTAACCATAGAGGACGACGAG 4524522
4524523GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACGCTCAGGAGATTCAGCAGGGGTAGCTAACGTCATAAACTA 4524592
4524593GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACAATCTTTCCATTCGTATGGTTTCTCATCTTTTTTA 4524657
4524658GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACGATTTCTTCAGGAGCAGGGACCTGGACAACACCGAC 4524723
4524724GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACTATCATAGGTTGAGTTCTCGGTATGAGATGGATGTTAGAA 4524793
4524794GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACTTTGTAAGTGAGCCTTCGATAGATGCCTCTAAGCAGTT 4524861
4524862GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACTTGAAGTCTAAGCTAACTCCTGAGATCCAGGAGAAAAT 4524929
4524930GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACAGCCTTACATTCTTCGCATCGAGTTCATATTCAAG 4524994
4524995GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACACTTCAAGAATGCCAGGTAAACCGCATCTGAGACC 4525059
4525060GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACCTGCTGAAACTTCATATTGTTTCATGTTCTCTCCTT 4525125
4525126GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACATAATCCAACGGGGCATAGTGTCAGGCAGTATGA 4525189
4525190GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACAAGTTGCAGAGGACTATCGAAACGAAACTGAAGATATGC 4525258
4525259GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACTACATCTTCATATTCATATATATACACTTCAGATAT 4525324
4525325GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACGTTGAATGCGAACGCCTGCGGGGATTTCCGGATAAC 4525390
4525391GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACATGCTATGCTCGGAGCCACTCCGAAAATGAGAGAG 4525455
4525456GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAACATTCCACCGCGACAAATAATATATACGTGGATCTCA 4525521
4525522GTTTCAATCCCTCTAAGGTCTGATTTTAAC4525551
Left flanking sequence : Till position 4523522 (length bp)
TAAAAAAAGTTAAATATCTATTTAAGTAGGATTTTACTTTAAGAACTAATTTTAACCATTGGCTTTAAGG
ATCCCTGTGATCCCTGTAATACACTTAATC
Right flanking sequence : From position 4525551 (length bp)
CAAGGAAATTTCCCCCGAATTTATGCAAATTAGATGCATGATCTTTTCAAACGAAAGTTGAAGAATTCGG
GGTTATGATGCTGTTTTTAGGCAATGTTAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp