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CRISPRs details
NC_004829_4
Flanking alignement tool
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NC_004829_4                                                                                                                 
top
Strain :
Mycoplasma gallisepticum R
RefSeq :
NC_004829 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_004829_4
DR consensus (36 bp) :
GTTTTAGCACTGTACAATACTTGTGTAAGCAATAAC
Number of repetitions :
72
Begin Position :
911020
End Position :
915741
911020
TGTTGTTTGCAAAACTACATCAAGCAGTTGAATGGG
ATTTTCTCTTGGAAAATTACCAATTATACC
911085
911086
TTGTAATCTTAGTTCCCCAAGATGCATCTAACACTC
CAAGATTTTAAATTCTGTTATAATCACCAC
911151
911152
TCATTATGGATAAGAACGCTAATCAAAAGTTGATTA
TTTTGCAACAGCTGGAATCGTTAGTGTGAT
911217
911218
TAATTGTTTCTTATTTAAATTCGTCAGCTACACAAA
TTTAAGTGCGCTAAAACAAACTTTTTGTTA
911283
911284
TAGCTTTAACAGCTTGTCCAGTAGGTGTAGCTCACA
TTTAAGTGCGCCAAAACAAACTGTTTGTTA
911349
911350
CAGCAACTAAAATGGGTTATCGAATCAAAGTGGAAA
ACGAATCAAATTATTATTTGAATACAATCG
911415
911416
TTAGTGAAGAAGAGATAAAGAATGCTGATCTAGTGA
TCGCGCGAAGAATAGTATAACACTTGTTTA
911481
911482
CACGCTTTAATCATAAGCGTGTGTTCCAAACCACAA
AATTTAAATATTTGTTTATAATTATTATGT
911547
911548
TAATTAATGAAGCTTTTAATAAAGCTACAACACTTA
TATAGAACCTGTTGCTCTATTTGCTTTTGA
911613
911614
GTCAAGATGCTAAACGCCCAGGGATCATGCGTCACA
TATTTTTTAAATGTGTAACCTTCTTTTTCA
911679
911680
TTGTTATCCTTGGTGGGATCTGTATTGCAATCGCCA
TAAATAATTTACTCGCATTAACTTTAGCTA
911745
911746
AATACAATGCAGTTGAAGGCGACTTCTTCTTTTATT
AGAATAAAGGGTTAGATAGTTCTTGTTTTT
911811
911812
TAATGATCGGTGCTCTAGGAGCATTTATAGCTAATT
TCCCATACAAAACCCGTCTTTGGACGGGTT
911877
911878
CATTTATTGTCTGTGTCTTGGCAAATACTCCTGAAG
AAAGCAAATAGAGTAACAGGTTCTATAACC
911943
911944
TTACAGCAATGGGATTCATTGGCTCAATCTTCTTTG
AAATTTAAAATTGCCTATTGAATTCGTGAA
912009
912010
TTAATACTTGAAGAATTAATAAAGCACTAGCACCAA
TTTTTGGTTTAAAAAAGAACCACAGGGTAA
912075
912076
TGGGATTGTTTTATGCTTTAATCGCTGTATTTGTTT
AGTTAACATCAATGTAATAAATTTGACCTA
912141
912142
AATTCATTAAGGCTCTTGAAGAAGCCTTTAGAAACG
ATGTTAACTCGATGTATCCTTACGTAATGA
912207
912208
TAGGGATCTTAATTGGAGCAATGACAGGATTTGATA
CTTTTTGTGCCAATTTACCGTACAAAGAGT
912273
912274
TAACTTGTGCAACCTTAATTACTTCAAATATCTATG
AAAAACGTCGTCAATTGCGCTAGATCAGCC
912339
912340
CCATTGCCCCACTTGGAATGGGATTATGTACCTTAA
CAAGTCGATATAATTAAGCTATTTGATCCTA
912406
912407
ATCACTTGGAATTAGTGCAATCCTAATGGGAACTAT
CGCCTAATAACCCACTACTAAACGCCACCC
912472
912473
AGTTACTGACCCTAAAAAAGCAATCATCTCAAACGT
ATTAAAATTTAAATTATAAAATTCGCCAGC
912538
912539
TGGTGCATTTGGTGTAACCTGTGCTGCAGCACACGG
CTACTTCATTAAATCTACCCTCTGGAATAA
912604
912605
ATCATCTAACCGACCACAAGGTTTAGCTTGAGGTTT
TTAAAAAACGCAATTGTATCGTTTTGACGA
912670
912671
TAGTTTAGTAACTTGTTTCATGTATGGTTTTTGAAG
CACACGATTGTCTTAAAGTCAAATCCTTCA
912736
912737
ACCTGTTAATAAATGAACTTTCTGAAGAAAGAAAAA
GTTGAGCTAATTGGACTTAAAGCAAATATT
912802
912803
AAAAAGAAGATATTTAAAGATCAAAAACAAAAAAAC
TTGTTGTCGTAAAAATAGTTGATTGTATCG
912868
912869
ACTTTAGTTGCTTTATTAATAGGGATTATTTTATTA
AGACTGTTTGGTGTAACTATTTATGTCGTA
912934
912935
GTAGCTAGAACTAGGGACTACTTAGTTTTACAAACC
CACACGATAGTGTTAAAAACAAACCCATCG
913000
913001
AATATGCAAGGTTTAATGCTAGGTAAATTTAAAGAT
TTGTTTGATTTATTGGGTCGGTATAAGTTG
913066
913067
CTAAACACAACTGTAGCTAAAATTATTCAAGACAAT
AAATCTGAATGTTTGGTAATCTTCATGGTG
913132
913133
TTTGCTTATGGGATCTTTATGGTTTTAGTTGGCATC
TCGAAGTAGGCAAAACTTAATATTACGACT
913198
913199
AACAGTACTTTTAATAAAAAATACCAAAAAGAAGAT
AATGAAGTAGATATCGTTAACTTCTTTTGT
913264
913265
CCATTTTGAATACCGTGTCTGATCTGGGGATAAGAT
GTTTTGTCAAAATTAAATGTTACGGACTTA
913330
913331
GATTGGTGAAGCTTGAATAATCTCAGCACTTGAGAA
TTTGTTGCTGGTTTTATAAACTAAACCACT
913396
913397
ATTATTACAGTTCTACCAAGATAAGGATAATGCTTA
AGTTGGTAAGTTAAACGTAGTTGTATTAGT
913462
913463
GTATCCTTTATTAGTTAAAATCATCGATGCTAAAGC
AAAAAATAATTGAGTCAGTGTCGCAATATA
913528
913529
TGCTTATGCCAAACAGTTTAACTCACTAGGTAAAAC
ATAAAAATTTATAAGATCGCTTATGTAGTT
913594
913595
AAATAACCAGATCGTTTTTGGTCATCAAGCTAAAAC
TTTGTATAGCTATTTATGTCATAGATATAA
913660
913661
TAAACAATGAAATGATCTATTACTAACTAAACCAAT
TTAATCTTAAAATAATAACTGTCTACTTGT
913726
913727
AAAAAAGCTTCATGCAATTAAAGCTGATACTTTAAT
TAAATGTGGACAAAACACTTGGAATGTTGT
913792
913793
CTATCGAGTATATGATTATGATCGTTTAGATCAAGG
TGTCCCAGTTTTTGGTGTTCTATTTAATGA
913858
913859
TTTTAATTTAGTTGATTGTCCAGATCTTGATTTATC
TAAAGTCCATTAAGCTAACAATTTTACTCA
913924
913925
TTTAGTTGCAAACAAGCTTTTCAATCTAATTAAGAT
TTGGGTCGGTATATGTTGCTAATTTATAAA
913990
913991
TGATGATGCTCAATGAGTTCAATTAACCGTGATTAA
GAATCAAGATAAAAACAAAGTCGTGATCTC
914056
914057
TAATCTATATGATTCGTTTATTATTGCTCACAATGA
ATCCATCACTAGAATTTGGTTAGCACGATC
914122
914123
TTTGATCTCGTATGTTAAATAGATAAATATAAAAAG
TTAATTTTCACAATTGCGGTTGATAGTGCT
914188
914189
TACTTTTATTAATATGTTGGTAGGTTAATAACGAGC
TTAAAAAACGCAATTGTATCGTTTTGACGA
914254
914255
CTAAGCGTTTGTTGTAGTCTCTTTTAATAAGATCTA
AAAAGCATATTGTAGAAGTTGTAAGTAACG
914320
914321
GAATATAACAAACTTATTATCAACTACAAAATCTAA
GTTTTGTCAAAATTAAATGTTACGGACTTA
914386
914387
ATTGCACTAGATATTGCTTTTATGATCAGAGAAATC
TTTGTTGCTGGTTTTATAAACTAAACCACT
914452
914453
ATTAATGATTAGTTCGTTAGGTTTATATAAAGGTAA
AGTTGGTAAGTTAAACGTAGTTGTATTAGT
914518
914519
TGACTTAAATAAATTAGATCAAGTATTTATTTAATT
AAAAAATAATTGAGTCAGTGTCGCAATATA
914584
914585
AATGTAACTATATGGATAAAGCGGCCTATAAGTTTT
ATAAAAATTTATAAGATCGCTTATGTAGTT
914650
914651
CAACAAAAGCATCATTAGTTGAATTCTAATAGGGGG
CTCTAATCACTCACGTTTAAGTGTTTTGCG
914716
914717
TTTTTGTTTTTAAAAGTTTATAAGAATCTGCACGAT
TACGTCGTTTAACTTTTTGGTTCTAAAGAG
914782
914783
CACAAAAACTTAAGACAGTTGGTAACACTATGAAAC
AATTTTTTCAAAAACTATTGACAAATTCAA
914848
914849
TATAAAATTTGAATTTTATGAATTTGTTATTGTTTT
AAGTGGTGTAGTTAGTTATAAAGGGTGGGT
914914
914915
TTAGCTTATTTATCTATCTAAAGTTCAAAATTTTGC
TAGAACAAATTAATCGAGATTTGCAACTTC
914980
914981
ACAGCTTAGCTAAAACCCCAGAAAGAGGATTATTAC
TTGACAATCTTATGATCTCAACTCACCCGC
915046
915047
CCAAACGTAGTTCTTGCTATTTCTTAGGTTTATCTT
CGTTCGGTTGAGCCGTAGTTTTCTGTCGTA
915112
915113
GTCTTTTGTTCATTTAATGTATTTTAGATGGTCAAA
ATATTTAAAGTTGTTAAATAGCTTAACGGT
915178
915179
TTGATACCTATAATTTTATTTATGTAATAAATAAAA
AAAAAGTTGATATTTTGGTTGCCCAAATAG
915244
915245
CTTTATTGCATATAAAAGCATATCCTCTAGGTGTTT
AATCCAACAAACGATACGGATGGTGTTAAT
915310
915311
ACTTTTAAGCGGTACTAAATTGTGATTAATATAACT
TTTGTATAGCTATTTATGTCATAGATATAA
915376
915377
GTCAAAATTTAGGTTATTAGACTCTCTTGAACTAGC
TAAATGTTGACAAAACACTTGGAATGTTGT
915442
915443
CTGACCACCAACAACCCCATTTAAAATCTTAACAAT
TGTCCCAGTTTTTGGTGTTCTATTTAATGA
915508
915509
AGTTCCTGAACCAACTGTACTTGGAACTGAGTCTAG
TTTAATGTGTATTTAGCGTTATGGTTTTTA
915574
915575
ACTAATCTTAGTGTTATTTCTAATCCTAAAAGGATT
AAAAATAGGTACAAAAAATTGTTTTAAGTT
915640
915641
AGAATCTTTTTTAAGTGCAGTATAGTTCAAAGCATT
ATAAACTGCAATTTTTTCTCGATGAACCA
915705
915706
AGATCGGAACTATCGTATTTAAATAGTTTTTTAATG
915741
Left flanking sequence : Till position 911020 (length
bp)
TACCAAGCTTTTTTAGCAAGAGAAAAAGAATCATCCACAGCTTTACCAGATCTGTTTGGCATCCCCCATG
CTAGAACTGCTACAGTCAAACAACCCGCAT
Right flanking sequence : From position 915741 (length
bp)
GACTGTATTCCATCATATTGTTCAGTTCTACATCGTACATTGGGCGATCTTCACTAAACATGACATATCT
GATAATAGCAAGATCACTATCAGGGCTTTC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp