Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_006448_1                                                                                                                 top


Strain : Streptococcus thermophilus LMG 18311 RefSeq :NC_006448 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_006448_1
DR consensus (36 bp) : GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACNumber of repetitions :34
Begin Position : 629901 End Position : 632113

629901GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACGAGCTACCAGCTACCCCGTATGTCAGAGAG 629966
629967GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCGTTCCTTTTTTCAAGGTAATCTTTGAAAG 630032
630033GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAAGTCCGTAAGCACCAGTTCCAATCGTCAT 630098
630099GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTGAATACCAATGCCAGCTTCTTTTAAGGC 630164
630165GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAACCTCATACATGGGGAAAATTGGTAAGTA 630230
630231GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTAACTTCATTAGTGTAGTTGTAATTAGCAT 630296
630297GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTAGCTACCCAAATATCTTCTGTTTTCCAA 630362
630363GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACGAGTTTTCAATATTGGCACAGGAGACAATT 630428
630429GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTGATACTATTTTAGTCAGATATGAAATATC 630494
630495GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTCATCAATGTTTAAAGCCCAACAATACATGA 630561
630562GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTAGATTTAATCAGTAATGAGTTAGGCATAA 630627
630628GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAGGAAAATAGCATGAGCGTACAACAATCTA 630693
630694GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTGTCTATCACGCTTCCTAAGTGCATGAAAA 630759
630760GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACATGTCACCAATCACTAAAGAACCTACGCTG 630825
630826GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAACATCTTCCTCTCCGATTGCAAATAGTGC 630891
630892GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCATATTTGGTGCCCGTTCGATAAAGAGTA 630956
630957GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCATTAAATCGCTTGAAGCAGACATTGAAGC 631022
631023GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACGACTTATCTTGGAAGGTAGTGAAGGCACTT 631088
631089GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTCCTTGCCATCTGCACTGTAAGCCCAAGCA 631154
631155GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTAGTACGCATAATCAATTCATCAAGCTTGA 631220
631221GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACGTAGTGACCCAAAATTCTATGACCTTGAAA 631286
631287GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAGATTGTGGTGCTTACGGAAAATTCCTTGT 631352
631353GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTGGCAAGAAGTGTAAGAGATGCAATGGATA 631418
631419GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTTATTATCATTATTCTTCTTCCCAAGCGT 631484
631485GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTTTATAGAATTTGGTGGTGAACTTTTTCA 631550
631551GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAATGGGTCACAGATTGCCATAATAAGGAG 631615
631616GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCCGAGGTCACTTTAGAACCCACAAAATAAG 631681
631682GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACATGAGAGAACACAGTATAGACCCTGATACA 631747
631748GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCAGTATTAATGAGGTTTGGGTGGTCATTCC 631813
631814GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCCATACTCTCTATCAGTTCATTTAATTCTTC 631880
631881GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTAATATGTCGCTCTACTGATTCCAAAACGG 631946
631947GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACATGAATTACATTCATGATTTTATCGAGTTT 632012
632013GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCGTGCCATTGTTTCGGTCGGACGTGGGCA 632077
632078GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAGT632113
Left flanking sequence : Till position 629901 (length bp)
AGGAACTATTACAGAAATTTTTAGAAAGTAAGGATTGACAAGGACAGTTATTGATTTTATAATCACTATG
TGGGTATGAAAATCTCAAAAATCATTTGAG
Right flanking sequence : From position 632113 (length bp)
TTGATTCAACATAAAAAGCCAGTTCAATTGAACTTGGCTTTTTAAAATACACGATAAACATAAGGATTGT
CAGGCTGACTAACCTCTTTAATCTCAGTCA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp