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CRISPRs details
NC_007796_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_007796_3                                                                                                                 
top
Strain :
Methanospirillum hungatei JF-1
RefSeq :
NC_007796 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_007796_3
DR consensus (36 bp) :
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
Number of repetitions :
38
Begin Position :
852826
End Position :
855462
852826
GGTGGAATATACTTCTAATTTCGGGTCTCTTGCAAC
ATCGTAATGACTGCGCGAACGATCTTATGAGTTA
852895
852896
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
TGGTACTTGTTCAACCCAATAACGGGTATGGTGG
852965
852966
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGACACTTGCAAC
CTACCCAATATTAACCTCATACATCTGTATACCA
853035
853036
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
TATGTAGATCATTATGGTGATATATCGAGTGTAA
853105
853106
GTTGCCATACCCTTCTATTTTAGGGTCACTTGCAAC
AAGAAAACCCCACATTAAACATTTACATAGATGTA
853176
853177
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
ATTTTAGGGTGACTTGTAACTTACAAAGGTCAGTG
853247
853248
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
AGGGTAGGTATGGCACATTATGGACCGATTATA
853316
853317
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
ACGTAAGGATGAGTGATTATGGTACGGATACAGA
853386
853387
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
ATTAGATAGAGCCACATTACATGAGGTCTATTAT
853456
853457
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
AGGGAATGTTCGAGAAATGAAATAGAAACAACGTC
853527
853528
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
TAACATGCTTGACAAAATAGTGGAATGATTTCCTG
853598
853599
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
TGAACTCATGGAGCTTATCCGATTTCTGGATAA
853667
853668
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
CAGGTGCTGCACAGGGCAACTGGTGGTATCAGGA
853737
853738
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
GTTAATGATACGTTCTGCGATTTGTGCGGTAAA
853806
853807
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
TGTGTACTCGCGTTTCCATTTGCCGTCTGTCCCG
853876
853877
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
ATAATGGATCATGTTATGTTCCCGCCTTTCATG
853945
853946
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
CTCAAAATAACCCATAATGAGATCTTTGATTCTG
854015
854016
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
ATAATGGATCATGTTATGTTCCCGCCTTTCATG
854084
854085
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
CTCAAAATAACCCATAATGAGATCTTTGATTCTG
854154
854155
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
GAACTGGCAGAATAATGATCCAGCCCCAGTATGT
854224
854225
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
ATCTCACTCTCTTATAAGTGAGATGAATGAGGATGA
854296
854297
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
AAGAGTCTAATGAGAAGTATAAAAAAATTGTAAA
854366
854367
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
CAGGTGCACAACCTGATGGAAGAACAGAGGGAAA
854436
854437
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
AGGTTGCTGCAGGTGTTATAGATCTCCCTGATGTA
854507
854508
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
CTGCCTCCGTTGGTGCTGCAAGGCCCTGCATGAGGTT
854580
854581
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
TACATTCTGCTTTTAGGTTGGAAAGGGGCTTCCAA
854651
854652
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
TATATCACACTAAAGTAAAAAACAGATGAAATCAG
854722
854723
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
AGCCACACGCGGTCCTATCCTGTAACCTGATAAC
854792
854793
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
CGTAAGACTGCGTAAACATGACGTAACTATATCCGT
854864
854865
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
TTACACTTGACGAGATTGAAGCCGCTAAGGACTT
854934
854935
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
GAAATACCACAAAGGAGCGTGGTTAGATGATGCCCC
855006
855007
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
TTTAAAGCGCGCCGAAATTGAGGCGCAGTATAAGA
855077
855078
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
TATTAAAGATGAAATAAAAATTCTATTGTATTAA
855147
855148
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
ATTCTAGAGGGCTTCTGATTATCCTCAAAGCAT
855216
855217
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
TGCGTATGACAAGTTAACCTTATTAAACGCTAAG
855286
855287
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
AAATCAGATACTAGAATAACTATATGGTAAATATC
855357
855358
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
CCCGATTGAGCTCGTACAAGCGGGCGCGGGCGT
855426
855427
GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC
855462
Left flanking sequence : Till position 852826 (length
bp)
TTTCACCGGTGTATTGGATTAACGTTTAATCTGGGTGGTATGCAATGTAATATTTTTTTTAATTTAATAG
AACAGGGTTTTATTCAGATTTCATTAAAAT
Right flanking sequence : From position 855462 (length
bp)
CGCCACTTTTTTCGCTTAGATTGGCTCAAAACCCATCTTTCCATCCCCCGATTTTCAGGGAACCTACCTG
GATCGATTTTGAGCTTTCAGTATTTAAAGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp