Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_007796_3                                                                                                                 top


Strain : Methanospirillum hungatei JF-1 RefSeq :NC_007796 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_007796_3
DR consensus (36 bp) : GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACNumber of repetitions :38
Begin Position : 852826 End Position : 855462

852826GGTGGAATATACTTCTAATTTCGGGTCTCTTGCAACATCGTAATGACTGCGCGAACGATCTTATGAGTTA 852895
852896GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACTGGTACTTGTTCAACCCAATAACGGGTATGGTGG 852965
852966GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGACACTTGCAACCTACCCAATATTAACCTCATACATCTGTATACCA 853035
853036GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACTATGTAGATCATTATGGTGATATATCGAGTGTAA 853105
853106GTTGCCATACCCTTCTATTTTAGGGTCACTTGCAACAAGAAAACCCCACATTAAACATTTACATAGATGTA 853176
853177GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACATTTTAGGGTGACTTGTAACTTACAAAGGTCAGTG 853247
853248GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACAGGGTAGGTATGGCACATTATGGACCGATTATA 853316
853317GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACACGTAAGGATGAGTGATTATGGTACGGATACAGA 853386
853387GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACATTAGATAGAGCCACATTACATGAGGTCTATTAT 853456
853457GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACAGGGAATGTTCGAGAAATGAAATAGAAACAACGTC 853527
853528GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACTAACATGCTTGACAAAATAGTGGAATGATTTCCTG 853598
853599GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACTGAACTCATGGAGCTTATCCGATTTCTGGATAA 853667
853668GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACCAGGTGCTGCACAGGGCAACTGGTGGTATCAGGA 853737
853738GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACGTTAATGATACGTTCTGCGATTTGTGCGGTAAA 853806
853807GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACTGTGTACTCGCGTTTCCATTTGCCGTCTGTCCCG 853876
853877GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACATAATGGATCATGTTATGTTCCCGCCTTTCATG 853945
853946GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACCTCAAAATAACCCATAATGAGATCTTTGATTCTG 854015
854016GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACATAATGGATCATGTTATGTTCCCGCCTTTCATG 854084
854085GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACCTCAAAATAACCCATAATGAGATCTTTGATTCTG 854154
854155GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACGAACTGGCAGAATAATGATCCAGCCCCAGTATGT 854224
854225GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACATCTCACTCTCTTATAAGTGAGATGAATGAGGATGA 854296
854297GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACAAGAGTCTAATGAGAAGTATAAAAAAATTGTAAA 854366
854367GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACCAGGTGCACAACCTGATGGAAGAACAGAGGGAAA 854436
854437GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACAGGTTGCTGCAGGTGTTATAGATCTCCCTGATGTA 854507
854508GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACCTGCCTCCGTTGGTGCTGCAAGGCCCTGCATGAGGTT 854580
854581GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACTACATTCTGCTTTTAGGTTGGAAAGGGGCTTCCAA 854651
854652GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACTATATCACACTAAAGTAAAAAACAGATGAAATCAG 854722
854723GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACAGCCACACGCGGTCCTATCCTGTAACCTGATAAC 854792
854793GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACCGTAAGACTGCGTAAACATGACGTAACTATATCCGT 854864
854865GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACTTACACTTGACGAGATTGAAGCCGCTAAGGACTT 854934
854935GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACGAAATACCACAAAGGAGCGTGGTTAGATGATGCCCC 855006
855007GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACTTTAAAGCGCGCCGAAATTGAGGCGCAGTATAAGA 855077
855078GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACTATTAAAGATGAAATAAAAATTCTATTGTATTAA 855147
855148GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACATTCTAGAGGGCTTCTGATTATCCTCAAAGCAT 855216
855217GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACTGCGTATGACAAGTTAACCTTATTAAACGCTAAG 855286
855287GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACAAATCAGATACTAGAATAACTATATGGTAAATATC 855357
855358GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAACCCCGATTGAGCTCGTACAAGCGGGCGCGGGCGT 855426
855427GTTGCCATACCCTTCTATTTTCGGGTCACTTGCAAC855462
Left flanking sequence : Till position 852826 (length bp)
TTTCACCGGTGTATTGGATTAACGTTTAATCTGGGTGGTATGCAATGTAATATTTTTTTTAATTTAATAG
AACAGGGTTTTATTCAGATTTCATTAAAAT
Right flanking sequence : From position 855462 (length bp)
CGCCACTTTTTTCGCTTAGATTGGCTCAAAACCCATCTTTCCATCCCCCGATTTTCAGGGAACCTACCTG
GATCGATTTTGAGCTTTCAGTATTTAAAGA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp