CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_007955_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_007955_2                                                                                                                 
top
Strain :
Methanococcoides burtonii DSM 6242
RefSeq :
NC_007955 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_007955_2
DR consensus (29 bp) :
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
Number of repetitions :
65
Begin Position :
610799
End Position :
614731
610799
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ACTGGCTATCTACACCTGAAAAAGATAAAGGT
610859
610860
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ACTCGTCATCGAACGGGTTTCGGAGTAAATAT
610920
610921
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GTCGTGTGGACATTGTATGCAAGACTCCATTT
610981
610982
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TACTAAGTGCAATATTGCTGATGTTATTCTGT
611042
611043
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TTTCCTCCGGCATTGATGTCACCGATAGTAGT
611103
611104
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ACTGTACATCATTGTATTCGAATGAGCACCAC
611164
611165
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ACATTGGATACTAAGAGGAAACTCGCAGAATA
611225
611226
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GGACACTTACTCCGAAACCCGTTTGATGATGG
611286
611287
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
AATACCCTCGCATGTCTGCAACATAAACGAAT
611347
611348
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GGACAGTTGTATTGAGTTCTCTCCGTAGGGGT
611408
611409
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GTCTCCAGTGGTGCTATTGTATCACATAGGCA
611469
611470
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ACACTAAGTTTTTCAGGTCCTCTAGTGTATGA
611530
611531
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GCGGGCGCACAGGGCGTAATCATCGGAAACAT
611591
611592
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
CTTCTTTCATCTTAACATATTTCGGCCAAACA
611652
611653
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
CAGGAATGGACCCTCAATATATCAAATGGTTA
611713
611714
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
CATTAGATAACCTCCTGGATCTCATGCTCTAA
611774
611775
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TAGTGAGAGAGATCACTATAAACAAAGCAGCA
611835
611836
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GCCCCCAAAGTATAAACGTTCAGTTTCTAAGT
611896
611897
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ATAATGGGGTGATTGAAGTAAACGAGACCGAA
611957
611958
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GTTATCATTAACATTCTGTTTCGATCCCGGAC
612018
612019
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TGACCCAATCAGTGCAAAATGCCAACGGTCAG
612079
612080
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
CTTAATAAATCTAATTGCCTTACCGCATCCAT
612140
612141
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ACCCCTTCATTAAAAATGGATCAACTTTTTAA
612201
612202
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TCTATGAGAATTGGCAGCGATATTTTGATAGG
612262
612263
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GTTATTCCGGTTGTTCGTTTTGTCCCTGCTTT
612323
612324
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TTGTATCAGGCATTGATAGCGTGGATAGTTCT
612384
612385
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
CCACTTATTGAAGCTGGAGCTTCAAAGGTCGT
612445
612446
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TAATCTCCGCGATTACGTTACCATCACGCAGC
612506
612507
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
AAACCATTCGGCAGGAGCTATTAAAGCACACG
612567
612568
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TGACGCATTAGAATAGCTCACAGTATACCGAT
612628
612629
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
AATACAATCCATGCATCTTTATTTGAGGCATT
612689
612690
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ATACGGTCCTTATCGGGGGTCCCCTTGCGTAT
612750
612751
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
CCAATCGTCTATTGTTCCTTGTTGTGTTTGTC
612811
612812
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GTAGCAGTAATAAAAAAATCAGAACATCTGTC
612872
612873
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GCCTTTTCAGCTCTCTTTGATATAAGAGCTGT
612933
612934
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TAAGAACCGCCAACTGGGTACATATATCCATC
612994
612995
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TACACATCATTCTCACTGTCGTACACCGTCAC
613055
613056
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TTAAACAAGATTCTCCTGATAATATGTCCTTG
613116
613117
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TCGATGTATATAATGCAGCGCGCCAACGAATG
613177
613178
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ACTATTCGTTTTCTGACTGGGCGTTTATAAAA
613238
613239
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ACAATTATCAAATACAATACGGGAATACACTT
613299
613300
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TATTGATTTCTTCTCCAGCATCGCTCATAACA
613360
613361
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TTAAAATTGTGTCAGTGTTGTTATTCAGTATT
613421
613422
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
CTTTATTACAACGTCACCTTGAGATGAATTAG
613482
613483
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GTGAAGAACCATGAACTATCACGACCATTTAT
613543
613544
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
CTTAGTTTGTCACGGAATAGCTGAGGAATGAT
613604
613605
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
CCCCCGAAATATCTACCCAGCCAGTATTTATT
613665
613666
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ATAGAGAAGTGTTAAAACCTTCAGACAGTAAA
613726
613727
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TTTGTGAAAGATATTCCGGTAACAAACAAGAC
613787
613788
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GGAACCGTTTTCAACATCCGAATTCTTTCATT
613848
613849
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
CCAAACTCTATACATCTTGAACCTACGCAGGA
613909
613910
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ACAGATGAACAGCATCGTATCTGGTGGCACAA
613970
613971
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TAAAAATCACGAAAACTATCGCACTGTATCGG
614031
614032
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GGAGAACGAGGTGACGGAAAGAATCGGCACTA
614092
614093
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ATCCTGTTTTAGGTCCTTGAGAGGAAGGTTCT
614153
614154
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
CTGTAAAAGCTGACCCTCGGCATGTCCGGGTA
614214
614215
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TCATCTTCTGCTTCGACGATAGTTTCAGCGGG
614275
614276
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ATATCAGCGATATCAAGTATGACGGTGGTGCT
614336
614337
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
TCGATATAAACACATACGCCCGGACTCAATCG
614397
614398
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
ACCCTGACCTTCTCTGAGATCAAATGGGCCAA
614458
614459
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GTAATTGTTCATTGTTGGCTACAAATACTGTT
614519
614520
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
GTATTGGTGATTATCTTGATTTGGGTAATCAT
614580
614581
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
AAAGCAAACACGAGGAGCTCACCAAATCAAAA
614641
614642
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
CCAACACACATCACACTTTAAGAACCAACACC
614702
614703
GAGTTCCCCATGCATGTGGGGATAAACCG
614731
Left flanking sequence : Till position 610799 (length
bp)
GTCTTCAATGCACCAATCGTTCATCAGGATAATTGCAATATGTTTTTAGTCTTTGGATGCCGGTAAGTGA
TTGGTGTATTGTTTCCATATATATGGAACA
Right flanking sequence : From position 614731 (length
bp)
AACTTCATTGAGCGCGTCTATGCGCCCATGAAGATTTCCGGCGGTAAAGTGGTGAGACAGAAAGAAACTG
TGATGGAAATTGGATACTATGCTGAGATAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp