Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_008262_1                                                                                                                 top


Strain : Clostridium perfringens SM101 RefSeq :NC_008262 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_008262_1
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATNumber of repetitions :61
Begin Position : 1054741 End Position : 1058679

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1054806GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATAACCAACAAGACCCCACAAAGGAGCTAACATTAATTC 1054871
1054872GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTAATTAAATCAGCTCTATATTTAAAAGCATTGTCA 1054936
1054937GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATAGATAACACTATAACCTAACTTTCTATGCTGAGAAA 1055001
1055002GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTAGTAACTGCACCTTCATGATTTTGCAATTCAAGAG 1055067
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1055133GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTACCATTAAATTTACCGTTTAACTCTCCCTCCAA 1055196
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1055328GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATACCATAATTATAAGACTTACAAGACCTCTCTAACTC 1055392
1055393GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTGGTAATATCCCACGGAATACAAAATGGAAAAGCTT 1055458
1055459GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTTAATTGTAGATGCAATCATATCATTTTTATCCATC 1055524
1055525GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTACTATCATGAAGGTAGAAAAGTTCTTGATGAACAA 1055589
1055590GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATAAGTACAAAAACATCTTAGATTATAAGCTAGGGGACA 1055655
1055656GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATATATAATAAAGGCAAGTAAATAAAAGATACTTCTTT 1055720
1055721GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTGCATGCTAGGGTTACTATGGATTATATTTATTTAA 1055785
1055786GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATGTTTATTCAATTTAACTTTACTATTATAACTACCTA 1055850
1055851GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTATGATTCTGCAATTCGAGAGCTTTTTGAGTACAA 1055915
1055916GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTGAATTTACCATCAAGTTCTCCTTCTAAAGCCTT 1055979
1055980GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTTTCTTAACATCAAATACCTTATTTTCATCACCTT 1056044
1056045GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTTAAAGGCTACGCTTCGCTATGTCTGCGACGCCAC 1056109
1056110GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATCCATTACAACCAATAACAGTCACAACACAATAAGTA 1056174
1056175GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATATACAAACTATAAAAAAATAGCTAAGATTATTATTAT 1056240
1056241GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATAGCAAGTAAACTTGCTATATGATGTTTTTTATCTTC 1056305
1056306GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTATCATACATAATATTACCGTCATTATCCAAGTTAC 1056370
1056371GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATCAGAAAAAATTAAAGAGCATACGAGACCAATAAAAA 1056435
1056436GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTAAAAAAGAAATTAGCTATATTCTCCGCAGTCTTA 1056500
1056501GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATGTTCACGATTATCAATGACAACTGTTAAGTTACTTAA 1056566
1056567GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATGAACTTATAAAGAGTGGTAAGAGTGTCGGAGATATA 1056631
1056632GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATACAAATTTCAATATCATTAAATGGTAAATCAGTTGA 1056696
1056697GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATACAATATTCATCAACATTAACACTATTTTTCATACC 1056761
1056762GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATAACCTAAAAATAGGAGATACAGTATAAAGAGTAGAT 1056826
1056827GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATATTTTGCGTTAAAAGTGTAAGAAGTTCTACAGGGAA 1056891
1056892GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATAATTACTATTAACAGTTTTAAGCTCATCAAGTTCTT 1056956
1056957GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATACGCATAATGACACTATATACATAATACAAAGCAAC 1057021
1057022GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTTTCTATAAGCTGTACTTTTAGCTCCACCCATAA 1057085
1057086GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTGAAAATGTAATAACTCTTATTTTAAGAGAATATT 1057150
1057151GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTAATATTGGAGGAATTAATGAGATATAACTTTACGG 1057216
1057217GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTCTAGGAAAGGTTTTAAAAGTGCAGAAGAAGTCCA 1057281
1057282GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATAGAATAGAAACAATAATTGGTGCAAGTTCTTGTTCT 1057346
1057347GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATACAAATCATATTTTCAAAAAGGTTCCTGTAGCTCA 1057410
1057411GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTCTAGGAAAGGTTTTAAAAGTGCAGAAGAAGTCCA 1057475
1057476GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATCTTTTTTTTAGCTCTGCAAGAAGTAAGCAGAACAAC 1057540
1057541GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATAGAATAGAAACAATAATTGGTGCAAGTTCTTGTTCT 1057605
1057606GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATACAAATCATATTTTCAAAAAGGTTCCTGTAGCTCA 1057669
1057670GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTAAATTTTAGCCAATAGTAGTTAGAATCTTTATAAA 1057735
1057736GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTAATTTTGCCAGAGTAATTGATTTGATTTTTACAA 1057800
1057801GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATATTTTATTTTACCTGCTAGCATATTCATTTTAGATG 1057865
1057866GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATAACGATAACGCAGATTACATGAGTGTTGTAATAAAT 1057930
1057931GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATAAAGTTTTTCTAGTAGCTTCTGCTACTCCTATATATT 1057996
1057997GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATACTGTTGAATCAGGAATTTTAGACAATGCTTCTAAA 1058061
1058062GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATCTCATATCAGTTGGGTAGGATGGGAATCTATTACAAA 1058127
1058128GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTCAGAATTTTTATTAATTTCACCTGAACTTTCTTCTA 1058193
1058194GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATGTTATTATTTCAACTTTTCTTTTTATCTCTTCATCCC 1058259
1058260GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATAGAAAGAAATCATTGACCCTATAGGGAAAAGCCAATT 1058325
1058326GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTATTCCCTAAAGCGTTCTTATTCCCTTTAGGAGC 1058389
1058390GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTATGTAACTAAGATTACAACTTTTATGAAATGGT 1058453
1058454GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTTATAATGCTCTCGTTGATCATCTGTTAGTTCAAAC 1058519
1058520GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTTTGATTTAACTCTACAAGCTTTAAGCAACTCTCT 1058584
1058585GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAATTTGCTTTTTAAGACACATTCTAAATATGTGCCTTCAT 1058650
1058651GTTTTATATTAACTATGGAAAATGCAATA1058679
Left flanking sequence : Till position 1054741 (length bp)
AAAACATTACTGATGGTCTACTGCAAAATTTTAATATTTATGATAAAATTAACAATAGAGAATGAGTCTA
TTACTAGCTTTTAGCATTTTGAAATTTGGG
Right flanking sequence : From position 1058679 (length bp)
TATATATAAAGCATCTTCAAACTTAAAATCATACTTTTAAACTTATAATTTTTTGTTTCAATAGCAAGTG
AACCTAATAAAGATATATTTCCAACAATGT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp