CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_008262_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_008262_1                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium perfringens SM101
RefSeq :
NC_008262 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_008262_1
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
Number of repetitions :
61
Begin Position :
1054741
End Position :
1058679
1054741
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TAATTATAAGATTTACAAGACCTTTGAAGTTCAACA
1054805
1054806
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AACCAACAAGACCCCACAAAGGAGCTAACATTAATTC
1054871
1054872
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTAATTAAATCAGCTCTATATTTAAAAGCATTGTCA
1054936
1054937
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AGATAACACTATAACCTAACTTTCTATGCTGAGAAA
1055001
1055002
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTAGTAACTGCACCTTCATGATTTTGCAATTCAAGAG
1055067
1055068
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
GCTTAAAATGTTAGATAATAATACTACTAGTTCGGT
1055132
1055133
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTACCATTAAATTTACCGTTTAACTCTCCCTCCAA
1055196
1055197
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTATAGAAAAAGTATAAACAAATTTAGGCTCTATAGA
1055262
1055263
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTCATTATAAAGATAGAAGAAAACTATCTATTTATT
1055327
1055328
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ACCATAATTATAAGACTTACAAGACCTCTCTAACTC
1055392
1055393
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTGGTAATATCCCACGGAATACAAAATGGAAAAGCTT
1055458
1055459
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTTAATTGTAGATGCAATCATATCATTTTTATCCATC
1055524
1055525
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TACTATCATGAAGGTAGAAAAGTTCTTGATGAACAA
1055589
1055590
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AAGTACAAAAACATCTTAGATTATAAGCTAGGGGACA
1055655
1055656
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ATATAATAAAGGCAAGTAAATAAAAGATACTTCTTT
1055720
1055721
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TGCATGCTAGGGTTACTATGGATTATATTTATTTAA
1055785
1055786
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
GTTTATTCAATTTAACTTTACTATTATAACTACCTA
1055850
1055851
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTATGATTCTGCAATTCGAGAGCTTTTTGAGTACAA
1055915
1055916
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTGAATTTACCATCAAGTTCTCCTTCTAAAGCCTT
1055979
1055980
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTTTCTTAACATCAAATACCTTATTTTCATCACCTT
1056044
1056045
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTTAAAGGCTACGCTTCGCTATGTCTGCGACGCCAC
1056109
1056110
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
CCATTACAACCAATAACAGTCACAACACAATAAGTA
1056174
1056175
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ATACAAACTATAAAAAAATAGCTAAGATTATTATTAT
1056240
1056241
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AGCAAGTAAACTTGCTATATGATGTTTTTTATCTTC
1056305
1056306
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TATCATACATAATATTACCGTCATTATCCAAGTTAC
1056370
1056371
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
CAGAAAAAATTAAAGAGCATACGAGACCAATAAAAA
1056435
1056436
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTAAAAAAGAAATTAGCTATATTCTCCGCAGTCTTA
1056500
1056501
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
GTTCACGATTATCAATGACAACTGTTAAGTTACTTAA
1056566
1056567
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
GAACTTATAAAGAGTGGTAAGAGTGTCGGAGATATA
1056631
1056632
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ACAAATTTCAATATCATTAAATGGTAAATCAGTTGA
1056696
1056697
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ACAATATTCATCAACATTAACACTATTTTTCATACC
1056761
1056762
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AACCTAAAAATAGGAGATACAGTATAAAGAGTAGAT
1056826
1056827
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ATTTTGCGTTAAAAGTGTAAGAAGTTCTACAGGGAA
1056891
1056892
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AATTACTATTAACAGTTTTAAGCTCATCAAGTTCTT
1056956
1056957
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ACGCATAATGACACTATATACATAATACAAAGCAAC
1057021
1057022
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTTTCTATAAGCTGTACTTTTAGCTCCACCCATAA
1057085
1057086
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTGAAAATGTAATAACTCTTATTTTAAGAGAATATT
1057150
1057151
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTAATATTGGAGGAATTAATGAGATATAACTTTACGG
1057216
1057217
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTCTAGGAAAGGTTTTAAAAGTGCAGAAGAAGTCCA
1057281
1057282
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AGAATAGAAACAATAATTGGTGCAAGTTCTTGTTCT
1057346
1057347
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ACAAATCATATTTTCAAAAAGGTTCCTGTAGCTCA
1057410
1057411
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTCTAGGAAAGGTTTTAAAAGTGCAGAAGAAGTCCA
1057475
1057476
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
CTTTTTTTTAGCTCTGCAAGAAGTAAGCAGAACAAC
1057540
1057541
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AGAATAGAAACAATAATTGGTGCAAGTTCTTGTTCT
1057605
1057606
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ACAAATCATATTTTCAAAAAGGTTCCTGTAGCTCA
1057669
1057670
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTAAATTTTAGCCAATAGTAGTTAGAATCTTTATAAA
1057735
1057736
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTAATTTTGCCAGAGTAATTGATTTGATTTTTACAA
1057800
1057801
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ATTTTATTTTACCTGCTAGCATATTCATTTTAGATG
1057865
1057866
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AACGATAACGCAGATTACATGAGTGTTGTAATAAAT
1057930
1057931
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AAAGTTTTTCTAGTAGCTTCTGCTACTCCTATATATT
1057996
1057997
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
ACTGTTGAATCAGGAATTTTAGACAATGCTTCTAAA
1058061
1058062
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
CTCATATCAGTTGGGTAGGATGGGAATCTATTACAAA
1058127
1058128
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TCAGAATTTTTATTAATTTCACCTGAACTTTCTTCTA
1058193
1058194
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
GTTATTATTTCAACTTTTCTTTTTATCTCTTCATCCC
1058259
1058260
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
AGAAAGAAATCATTGACCCTATAGGGAAAAGCCAATT
1058325
1058326
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTATTCCCTAAAGCGTTCTTATTCCCTTTAGGAGC
1058389
1058390
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTATGTAACTAAGATTACAACTTTTATGAAATGGT
1058453
1058454
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTTATAATGCTCTCGTTGATCATCTGTTAGTTCAAAC
1058519
1058520
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTTTGATTTAACTCTACAAGCTTTAAGCAACTCTCT
1058584
1058585
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTGCTTTTTAAGACACATTCTAAATATGTGCCTTCAT
1058650
1058651
GTTTTATATTAACTATGGAAAATGCAATA
1058679
Left flanking sequence : Till position 1054741 (length
bp)
AAAACATTACTGATGGTCTACTGCAAAATTTTAATATTTATGATAAAATTAACAATAGAGAATGAGTCTA
TTACTAGCTTTTAGCATTTTGAAATTTGGG
Right flanking sequence : From position 1058679 (length
bp)
TATATATAAAGCATCTTCAAACTTAAAATCATACTTTTAAACTTATAATTTTTTGTTTCAATAGCAAGTG
AACCTAATAAAGATATATTTCCAACAATGT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp