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NC_008593_3
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NC_008593_3                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium novyi NT
RefSeq :
NC_008593 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_008593_3
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
Number of repetitions :
78
Begin Position :
1864520
End Position :
1870431
1864520
GTAGTATTACATCTCATGTTAATATTCATT
ATTTTTAAAATTCAAAAGTTAATTAC
1864575
1864576
ATTTAAATACATCTTATGTTAGTTGTTCAA
AAATAATTTTTTCTCTTTTATTATAACATAATTGCACCTCATACGAATATTAA
1864658
1864659
ATTTAAATACGTCTCATGTTATTGTTCAAC
TGAATTTACAATAGAACAAATAAAGTTTGTAGCTT
1864723
1864724
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
TTTAATTAAAAAAGATTATTCAAATATTTATAAATC
1864789
1864790
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
AAAGCCCCGTTATAACTTGAATAAGCGTTATTAAAG
1864855
1864856
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
TTTCAGGCGGAAACATGAACAAAACAGTAAACATAA
1864921
1864922
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
TTGCAATTCTTTATTAGTTAAAGCAATTCTTTTCGCC
1864988
1864989
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
ACAAACCTCACCGATATATTATAGTGGTCAGATGA
1865053
1865054
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
AAAACAAGCTGGTAAAAAGAAGAATGATAGTATAAG
1865119
1865120
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
ATTTATGTCAACAACCTGTCCTATTAAAGCGTCCAA
1865185
1865186
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
AATTGCTCTTCTTTACTTTGAACCTTTTTATCTTTG
1865251
1865252
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
CTTAATAAATTCAAGGAAATCATTATTTCCTTTAC
1865316
1865317
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
GTGAAGAAACAACAAATTTAACTGCAGCTGAAAA
1865380
1865381
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
TTGCAAATTGTATAAGCAAGTGTGAATTTCTTACTTT
1865447
1865448
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
ATTACAAGAAATGGTTAAGGAAATAAAAGAAAATAT
1865513
1865514
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
TTTAATTTTTAAAATATTTTTATCTTTACAATTCTA
1865579
1865580
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
CAAAATAATAAAGCATTACTAAGTACAACAATTAG
1865644
1865645
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
TTTCTACTCAAATGGGATTCGACAAATCAGAATCGG
1865710
1865711
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
CGAAACTTTTCCAAATGGAAATTACAAGTATAGAGA
1865776
1865777
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
ACATTTAGCAAGAAAGATGATATAACTGTAAAAGT
1865841
1865842
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
GAAATTGCCAACACTAAACTATTCTATTCTACGGA
1865906
1865907
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
AATCTAACGATTAGTGAGATAGACAAAATGAGCG
1865970
1865971
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
TTAGAATTTTTTACTCAGCATAGGCATTTAGGCTT
1866035
1866036
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
GTTGATAATAATTCTTATAATAGGAATTTAATTTT
1866100
1866101
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
TGACCGACTGATTCTTCATATACTTCATAATCACCATG
1866168
1866169
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
CGTTAAATGCTCCTGTTTTGTCGTTTGTAGCTTTG
1866233
1866234
ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC
CATAGTAAAATAGCCATTCCTTATTTTCATTATACCCTTGGAAGCATTGAAAATAAAGACTTTCGTTGATTTTTTTCCAACCGATTTTGATTATTTAATTTTTTCACTTAAAAACCTTATCAAATCTTTTAAAATTAGGATGTATAGACACTTTTACTTTATGAATCGGTTGGGAAAATATTTTTTATAATATTAAGTCTTCTGCTGTTTCAATATCTATTTTTATAACTTTAATTTATCACTTATGTTAAAAATAAATTCAGGTTCATCTACTTCTGGATATTCTTCATATATTACAAACGGATCTATATCTAAACAAGTTGATTCATCATAGCTATCATCTAAACTCCATGCTAAAGTTCCATTAAGTACAGTACATTTTTCCTTAAACAAGTTAATATCTTGGAGAACTTTAAAAACTCCATTTTTTATTAAATAACTTGCATCATATAAATGAATAGAACCATCATCAAAATATACATAAACTTTAAAATTATCTGTAGGAATAACTTGTATAACCTCAGGCATATATTCCATAATCATCCCTCCTAAGAAAGTGGTGCAATTCTATATAATGGTTGATGACTTCTTGCAAGTTCCCAATTTTGCATTAACTCATCCTTGTGTATCTCAGCCCATGCAAGAATTAATTTTAGTTGTCTTTTAGGAAAAAACCCTTTTATTACTTTACAATTTATAATATCCACCAAAACTTTATTTCCATTATATTCAGCATGAAAATGTGGCGGAACATGATCGTTATAATTTATAGTAACTCTTATTCCAAAAAATAAACTTATTTCTGGCATATAATCACTCCCTTAATAAATTTATATAAAAAACTCTATCATGAATTA
1867120
1867121
ATTTAAACACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AAGCTTGTATTACCAAACTTAAGTTTTTGAACTAT
1867185
1867186
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
ATTTTTTAATAATTTGTATCTATTGTTTATATTTAC
1867251
1867252
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TATATTTGGTGTAGGTACAAATGTACCGATTTGT
1867315
1867316
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AGTATTAGAAAAGGATAAAAACGGGGATAATGACGA
1867381
1867382
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AGGTATTCTTTGTCCTGTACGCTTGTCATATTTCCAC
1867448
1867449
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AGCGATATGGTATATTAAAAGGGAACTAAAGAATAT
1867514
1867515
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
GAATTGGCACATTATCTCCATTATTTAAATTACAA
1867579
1867580
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AGGCATTTTTTTCATGGAAAAGATAGATTTTGAAAA
1867645
1867646
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
ACCATACCCTATAACAGAATATAAAATAGCTTGTTG
1867711
1867712
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TGTGTGTGGACACATAGAAACTGGACAAGATTTTTT
1867777
1867778
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
CTAAACCCTATATCGTGCTTAAAGCCTTGCGTATC
1867842
1867843
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AGATTACTGGCCTCTTTAACGAAAATTGACGGAA
1867906
1867907
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AAGAAACACAGGAAGATAATGCGATAGATTATTC
1867970
1867971
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TCCCATTGCTAATATTGCAATGGGAATTATAACGGA
1868036
1868037
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
CAAAATGGCAAGGTACTATACGCTACGGTAACAGA
1868101
1868102
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TAAATAGTGCGTTGGAAAATGTTCAGCTCGAATTTA
1868167
1868168
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TTCTTTTAAAGGTGCATTACTTCCGTTAACCGAACG
1868233
1868234
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TGCGACATGAATTTTAAACAGCTCTCTTGGCTATC
1868298
1868299
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
GGGAACAAGAGGCTTTTAACGATATGGTATGGAA
1868362
1868363
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AGCTATAGGTCTTGGAGATATGAAAGACAACTCTAT
1868428
1868429
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
GTTGAACGTTTGGAACAACCGCAAATGACTTTTAGTT
1868495
1868496
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
CAGAAGGTCCAGGAGGTGTTCCTAGTGGTTTAAG
1868559
1868560
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
GTCTAGAAGGTGCAGAATATTTTAAAGAGTTATC
1868623
1868624
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
ACTAATAGAGGGTACTCTCCACATATTTTATTATTA
1868689
1868690
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TCTAACATATCTACACGCTCTACAGTTTCCATTTTC
1868755
1868756
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
CTCTTAGAGGATAACTTAAGTTTAGCGAATTTTGCT
1868821
1868822
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
CCGAGAAACCTGTCGAAGATGGTACAAGCATGAT
1868885
1868886
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
ACGGTGACGGAATTATTTTAAACGCCGGTTACAA
1868949
1868950
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AATTGTATATCTCCTTAACCCTTGCGTTGCCGATTC
1869015
1869016
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TTTTTTCTTTTTCTTTTACCTTGTTAGGTGTTTCGTC
1869082
1869083
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
GGCATTAAAAATATCTTCAAAGGCATATGGGAAAGCA
1869149
1869150
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
GGTTATCCAAAAATCTATGCATTGGATAGTCAAAA
1869214
1869215
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TACAAACACAAGATGTAGAAGGGCTACAAAAATGGT
1869280
1869281
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TTAAAGGATTTTGAGGCGGAATCTGTGGCTTTCAAAA
1869347
1869348
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
CATAATCCACCGCATTATCTTCCTGTATCTCTTTTT
1869413
1869414
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TAGGTATCACCCGCATTTACATTGTGCGTTTGTGTT
1869479
1869480
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TGATTCGTTCTTTTATTTCTCAAGAACGTAAAGTG
1869544
1869545
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
ATGTAGCGGATTATTTCTTATAATTGGAAAAACTAT
1869610
1869611
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
CTTCTGTTTTTACTATTCTTGCTCGTGTTAAGAG
1869674
1869675
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AGGCAAACAGGCTTTTAAGTGGACTGCTAAAGGCTT
1869740
1869741
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
CCTAAGTTTTCTACTAATGGTAAGGTTGTAACTTTA
1869806
1869807
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TTTTTTCTGTCCTATTACAGAAATTTTGGCTATTGG
1869872
1869873
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TATAATGACTAATAGGAAGTTTAATTTTACGATTGA
1869938
1869939
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TTACTTGGAAGATGGTGAGTATAGTGTGGAGGATA
1870003
1870004
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
ACATATTCAATCCCACAAAATCCCGACGCAATTCC
1870068
1870069
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AAGGTACACAAGCAAAGAAACCTAAAAAGGCGAAAA
1870134
1870135
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TTCTTTGTTTTCGTAGTTTCTGGTGGCTATTCTTCCAC
1870202
1870203
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TATAATTAATATATAAAGAAAACAGGAGGTAACAAAA
1870269
1870270
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
ACAAAATGGAAAGGTGCTATACGCTACGGTAACAGA
1870335
1870336
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
CCCTAGTGAGGAAGATGTTGCAAAAGCATTAGAGGT
1870401
1870402
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
1870431
Left flanking sequence : Till position 1864520 (length
bp)
TAAATCTCCTTTTTAAATAATTTTATTAATAATTAATTCTATGTAATGTTTCATAAGTTTATTACTGATA
ACTATAACAAATACTACGAAAATTTTTTCC
Right flanking sequence : From position 1870431 (length
bp)
TACAGTAAAATAGCCATTCCTTATTTTTATTATACCCTTAGAAGCATTGAAAATAAACACTTTCGTTGAT
TTTTTCCCAACCGATTTTGATTATTTAATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp