Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_009089_17                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile 630 RefSeq :NC_009089 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_009089_17
DR consensus (29 bp) : ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACNumber of repetitions :20
Begin Position : 3455483 End Position : 3456758

3455483ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGTGGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA 3455546
3455547TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAATAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT 3455611
3455612ACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAACCTGACACTGTGTCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT 3455677
3455678ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCGGTCGTAACGTGTCAATCCTATTGGGTTTTAGATA 3455742
3455743ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGAAAGAGCTATTGAAGCATTAAACAGAATACAGG 3455807
3455808ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCGTCTACTGTTGCATCATTTAGTGACCTAGCACTTTG 3455873
3455874ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATTTATATAAGTATGCAGGTGAGGGGATTTTTTGATA 3455939
3455940ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATTAAAAAATTACTACCTTTAAGTTGACCTTTTAAA 3456005
3456006ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAATATTAGATAGAATAGGGATAAATGAAGAATATG 3456070
3456071ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCAGAGATAGAAATTATTTTTATTATACGTTTTTTTGT 3456136
3456137ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAATTTGTTCTATTTTTTTATCTAGTAACTTAATTGG 3456202
3456203ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAACTACATATAAATAAATTCAAAGCCATGAAATTCG 3456267
3456268ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACGGATACTTTCTTTTCTTGCATCAGCATTTTGTTTCA 3456334
3456335ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATAATATAATGTTTAGTATAACTAAATAATTTTGA 3456399
3456400ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTTATGGTACTCTTACAAGAGTAGAAGGTGTATACCT 3456465
3456466ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGAATAAGATAACAACAATAGAATATAAAAATATCGT 3456531
3456532ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATTAAAATCTGTGAAAAATGCTTGGATGCCAACTCG 3456597
3456598ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTATTCAGATGCATATAAAAACGCAGGTCAAACCTT 3456663
3456664ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAATTGAAGTAATAAAGAAAATAAGCTATGAAGCTAA 3456729
3456730ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC3456758
Left flanking sequence : Till position 3455483 (length bp)
TGATTTTATTTATATCTTTACTGTTTAATTTCTTTATCATAAATTTTGTTTCACCTCATTTTTGTATTGA
TTTTATAATGTTTGTAGGTAAGTGTATTTT
Right flanking sequence : From position 3456758 (length bp)
CCCAAAATAGGTATATTTGAATACATTGAAAACACTTCAATCAAGCAATTATAATTCAATAAAAACATCA
AAATTTGCAGTGAGCGAGCAGTAGTGCAAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp