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CRISPRs details
NC_009089_17
Flanking alignement tool
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NC_009089_17                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile 630
RefSeq :
NC_009089 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_009089_17
DR consensus (29 bp) :
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
Number of repetitions :
20
Begin Position :
3455483
End Position :
3456758
3455483
ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGT
GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA
3455546
3455547
TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAAT
AAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT
3455611
3455612
ACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAAC
CTGACACTGTGTCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT
3455677
3455678
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CGGTCGTAACGTGTCAATCCTATTGGGTTTTAGATA
3455742
3455743
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AAGAAAGAGCTATTGAAGCATTAAACAGAATACAGG
3455807
3455808
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CGTCTACTGTTGCATCATTTAGTGACCTAGCACTTTG
3455873
3455874
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ATTTATATAAGTATGCAGGTGAGGGGATTTTTTGATA
3455939
3455940
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TATTAAAAAATTACTACCTTTAAGTTGACCTTTTAAA
3456005
3456006
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AAATATTAGATAGAATAGGGATAAATGAAGAATATG
3456070
3456071
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CAGAGATAGAAATTATTTTTATTATACGTTTTTTTGT
3456136
3456137
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TAATTTGTTCTATTTTTTTATCTAGTAACTTAATTGG
3456202
3456203
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AACTACATATAAATAAATTCAAAGCCATGAAATTCG
3456267
3456268
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ACGGATACTTTCTTTTCTTGCATCAGCATTTTGTTTCA
3456334
3456335
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TATAATATAATGTTTAGTATAACTAAATAATTTTGA
3456399
3456400
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CTTATGGTACTCTTACAAGAGTAGAAGGTGTATACCT
3456465
3456466
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AGAATAAGATAACAACAATAGAATATAAAAATATCGT
3456531
3456532
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TATTAAAATCTGTGAAAAATGCTTGGATGCCAACTCG
3456597
3456598
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
GTTATTCAGATGCATATAAAAACGCAGGTCAAACCTT
3456663
3456664
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AAATTGAAGTAATAAAGAAAATAAGCTATGAAGCTAA
3456729
3456730
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
3456758
Left flanking sequence : Till position 3455483 (length
bp)
TGATTTTATTTATATCTTTACTGTTTAATTTCTTTATCATAAATTTTGTTTCACCTCATTTTTGTATTGA
TTTTATAATGTTTGTAGGTAAGTGTATTTT
Right flanking sequence : From position 3456758 (length
bp)
CCCAAAATAGGTATATTTGAATACATTGAAAACACTTCAATCAAGCAATTATAATTCAATAAAAACATCA
AAATTTGCAGTGAGCGAGCAGTAGTGCAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp