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CRISPRs details
NC_009089_6
Flanking alignement tool
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NC_009089_6                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile 630
RefSeq :
NC_009089 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_009089_6
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
Number of repetitions :
14
Begin Position :
1434756
End Position :
1435639
1434756
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAGCTTTCATAGCATCCTCTTCTGAACATTCATCACT
1434821
1434822
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TAGTAAGTTAACTCATACATACCACCTTCCCCATAAA
1434887
1434888
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TATTATAAATCTTTAAATAGCCTTCTAAGCGTCTACTA
1434954
1434955
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ACATTATCAACATCATCTAATTTTTTTGTCACTGTA
1435019
1435020
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TAAGAATTAACTAATGTGAATTTTTTAGACATGTCAT
1435085
1435086
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ACAAACAAGTGTAGGATAAACTTTCCTTGCCCAGTATA
1435152
1435153
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TAACAAAATTTGCGAGTACACTTATTTCTAATATATC
1435218
1435219
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ATAAGAGTGGTTTAAGAAAATAAGTTATTTTTCAAA
1435283
1435284
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TGACTCGTGCTATTTTTTTTACACGCCTAAGAGGTA
1435348
1435349
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CGAAAAATCTAGGAAAAACTATTGTAAAAGCGTTTA
1435413
1435414
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTTGATTACATGGGCAGTTTTTTATTATAGAGTGTTA
1435479
1435480
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAAAATCTTATTAAAGATTATTCAAAGTCTTTTGATT
1435545
1435546
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT
1435610
1435611
GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG
1435639
Left flanking sequence : Till position 1434756 (length
bp)
GGTATATGATAAATATTATCATTTGCACTACTCGTGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAATTGTATAGATGT
AAGTGTTGGAAATACTCAATTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1435639 (length
bp)
ACAGATATAATGTCAAAATAAGGTTAGGACTTTTAAAAGCATAGCCATATCAGTAAAAATTTAATTATCA
TTTAAAAATAAATTTTTATTTAAAGAATAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp