Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_009633_9                                                                                                                 top


Strain : Alkaliphilus metalliredigens QYMF RefSeq :NC_009633 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_009633_9
DR consensus (30 bp) : CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATNumber of repetitions :62
Begin Position : 2274931 End Position : 2278995

2274931CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATGGTGTTACTGGACATAATAAATATTGCACCAGACTG 2274996
2274997CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAATAATTGTGATGTGACTTAAATTATCCTTTGCTG 2275061
2275062CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTTTGGAGTAATTTGCAATCTGCTATATAATCCCTCC 2275127
2275128CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTTGCATTGGCAAGCAATTCTAAAGCTTCGGTATTATC 2275194
2275195CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTTTTAAAACCATTAGAAAAGTCTTGTGGTGATGCAGT 2275261
2275262CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTATTTTGCATACATTGCTATAACCCTCAAATCATCTT 2275328
2275329CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATGTGTTAGAACATTGTAGTAAAAACAGTATCGCCAAC 2275394
2275395CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAAAGTATTCCGCTATACTGGTTTTGTTCTTCTCAAAA 2275461
2275462CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAGATTTAACAGTGTTGATACTAACATCATATTTTACA 2275528
2275529CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATATGACTAGGAAAGTAATCACTACGATTGGCATTATT 2275594
2275595CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATATGATTAATAGGTCCATCTTCATTTTTATAAAACA 2275659
2275660CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAGAGAATATAAGATAGACTTATTCAACGCATTAGATT 2275726
2275727CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATCCATTTAGTGGGAATAATATGTTGGGCGGTGAAGAA 2275792
2275793CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAATTGCCCTTGCAAGTCAAAGGTGGAATTTTTTCCC 2275858
2275859CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTGAGGACAGGTGCATTGAAATTCAAAGGGTTAATGG 2275924
2275925CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATCAGCAACCACCAATTCAAATCTATATTCAAATAGT 2275989
2275990CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATCGCTTTAAGCAACTAACTAAGGATGTAGAACAAAAT 2276055
2276056CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATATAGATAGTGAATTGCAAACTATTGAATTGATATTTA 2276122
2276123CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAGATATGCCTGTCATTTCAGATAGTTTGGTCATACT 2276188
2276189CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAAAGCTAAAGGATCACGTTCATATATATCTTGAGA 2276253
2276254CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATCGAAATAGGCAGAATGATGGAAATGTTGTTAGAT 2276317
2276318CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATATTACTAGCAAAGTAAATAAGACTAAATTACCTAC 2276382
2276383CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTTGGAAGGACTTGGTTCATAATGATAATGGCATTTA 2276448
2276449CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTCTAATGCATTATGCAAACCCTGAATCCAACCAAA 2276513
2276514CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTCCTAAGCATGGTCGAAAATTATCCCGTACTTGTACT 2276580
2276581CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTTTAATACTCATGTAATTTACGTTACTTTAGATAA 2276645
2276646CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATGTTTGAGGATCTTGCCAGTTTGTTTTTGCCATTTAAA 2276712
2276713CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAAACAATAAGGAGTGGTTTAAATTATATTATTATT 2276777
2276778CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAAAGAAAACCACGGAGTTAGGTAGGACTCCGTTTGC 2276843
2276844CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTTCTAATAAAAAACTGGATCATGAGATCGTGAAGATC 2276910
2276911CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAAGGTTGCGAAACTAATTGCAGCTTACTTGAAATTAG 2276977
2276978CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAGGTCAAAGGGGCACTAGGGCAAATGTAGATCAAGG 2277043
2277044CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAGGGTATGCCTAAAAAGGGCTATATGCGCGAGTCAGT 2277110
2277111CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATGGATTTGAGGATGAAGAGTTTGCACTGGGAGACACCA 2277177
2277178CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATACTATACCCGATTCCCAGTGCCAGTGTTGAAGCAAAG 2277244
2277245CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATGAGGGAAGAGACTACCACTATCCACCGTAAAAGCAA 2277310
2277311CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATATTAGAGTGTCCTTAGACAATGCAATCATCCGAGA 2277375
2277376CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATCAACATCTCCTGCTCCATTCCTGATGATCTCAAGG 2277440
2277441CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATGTTGACATAACAAAGGATAGTATGCCGTTTACACCTC 2277507
2277508CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATCCGCTAAAGGTACCTGTGCCAAATGGGATGTTCCCAA 2277574
2277575CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTTGAAACGAAAGGCTACGAATACCCTTACAGAACC 2277639
2277640CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGCAAATATCGCACACCTTGTTTTTAACTACTTTCAATCCAC 2277704
2277705CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAACTATAATACAGGTCGCATTACTTTTAAATCACTAA 2277771
2277772CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTGGCTTTAGTGGTGGGTGCGATTGCAGGGGTTATAGC 2277838
2277839CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATATGTGGGAAGGAACACGCACTAAAGCGCAATATGAA 2277904
2277905CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAGTAGTCCTTAGCTTTATGATAGAGATATTTAATT 2277969
2277970CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTTTGTTACGCCCCTTTGGTACTTGTTGTTATTTAA 2278034
2278035CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATATCAAACTGTAACGTGGCTTAAAAGCATGGGAACAAA 2278101
2278102CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATATCCTCCTGGGCTTTGCCACTATTTAACACAGCATTC 2278168
2278169CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTAATTAACCCTCCTTCGTATAATATTTGAAATGCGC 2278234
2278235CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTTCCTTATAGGTTCCTTTAAAACATACCAAGCATGG 2278300
2278301CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTTGTTTGAGGAATCCAATTCAATCCATCATCTGTGC 2278366
2278367CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATGAACCAGAGCCACAAATTATATTAGGTACTGTAAAAGG 2278434
2278435CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATGTAGAATTAGGCGGTAAAATGAGAAACATCAGATACA 2278501
2278502CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTGCGTTAAGTTAAGTGAAACAATGCAAAGAAACCTTG 2278568
2278569CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATCCAGCAGGCAAATCAGAATAAGCCTGACTTATTTCT 2278634
2278635CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTTATCAAGGACCTCTTGTTTGATTTCTACATATCCCC 2278701
2278702CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATAAAATAAATGAAGAGCTGCCTTACGGGGTTTGTAAAT 2278768
2278769CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTGAGCAGGCAATAATCGTGTTATCTCAAAACACTTA 2278834
2278835CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAATTAAATTTATGCAGACATGGAATGCTGTGGCCGGAT 2278899
2278900CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAGTACAAAGATAGAGACAATCAACTCATGTGTCATAAC 2278965
2278966CCATTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAG2278995
Left flanking sequence : Till position 2274931 (length bp)
GAAGAATTCATTTTTAGAAATACTTAATTTTTTGTAAAAGCTGTGGTTAGACAGGATATTAGCCAATAAG
CCAGTTGTTTGAACGCTTTTAAGTGAACGC
Right flanking sequence : From position 2278995 (length bp)
TTGTATATTCGGGCCTTTTTATAATTCCCCTTAGCCGGTATATAATGAACATAAAACTTGAGGTGACGTT
TCATTAACAATAGGATTTAAATAAAATGCA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp