CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_009706_5
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_009706_5                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium kluyveri DSM 555
RefSeq :
NC_009706 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_009706_5
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
Number of repetitions :
25
Begin Position :
2835088
End Position :
2836691
2835088
TATATTTTACAACACTTGTTAAGGTTCAAC
ATAAATTTAAACATTTACCATTAAAAT
2835144
2835145
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
TCATATTGAATCATATCATCAGTTTTTTCTATGGCA
2835210
2835211
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
GTATCCAAAGCTTCTGGAGCTGCATCTATTACCATT
2835276
2835277
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
TATTAAGAGATGCCTTGAGTTATGGAGCAATCCTAA
2835342
2835343
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
CTAAGTCAATATAGTTTTGTATTTCAGGTATCAGCTT
2835409
2835410
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
CTGACCTGTAATTGCAAGTGCAGCAGCCAGCCATTG
2835475
2835476
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
CCTGTACAAAATGTGCTTTTGGTTGTAAACCCATC
2835540
2835541
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
ATTTAGGATCAATATTAAATATCTCCTTTCTGGAGT
2835606
2835607
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
CTCGATCTTTTCAATGTCTGTTACTGCTATTTTGTC
2835672
2835673
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
TCCTGTGTTCTTCTATTTTACTTTCGTTATAGGCCT
2835738
2835739
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
TACTGTATTTCAAATTATCACAGGATATTCTAACAA
2835804
2835805
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
TTAGTCATTTCAGTTGGATAGTGTTCAGCATAACTTG
2835871
2835872
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
TATAACATTTTTAGTGCTTCATATCTTCTTTCCCC
2835936
2835937
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
TATGGAATTTAGCAAAGGCAGAAGAATCAATACTTT
2836002
2836003
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
CTATGTTTTTTATCTTTGTGTTTAATTCCTCTAC
2836066
2836067
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
CTGAAGCAAAAGAAAATACTAACACACCAGAAAGTAA
2836133
2836134
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
CCTAGTTGGGTTATTAATGCCTCCTTTTTCTTTT
2836197
2836198
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
GCTTATAGTCAAGGAAAATCCGTACTTAGAAAAGAGG
2836264
2836265
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
CCAGTACCGCCTGTATTAAATGCTATTTTACCTTCTG
2836331
2836332
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
GATTTAATCCATTGTTTTAGTGTCAATTCATCTTTAG
2836398
2836399
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
ATTTCCAGAGTGGAAAACAGCAGACATAATTATACC
2836464
2836465
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
CTTCCTCACCTATAATAGTTACTATGGGGTCTATGC
2836530
2836531
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
GTACAAAAACTTCCTTCTCGCAGAGGTCACCCTCTA
2836596
2836597
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
TAAATAGTAAAAATTATAAAAATTGAATACGTTCA
2836661
2836662
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
2836691
Left flanking sequence : Till position 2835088 (length
bp)
ATACTATGCGAAGATATATTAAATTATGTTTTAAACCTTAACCATTAAAATTGATTGTAATATTAGCTTT
AAAACTCTCGAACATATAATATTCTGCTCA
Right flanking sequence : From position 2836691 (length
bp)
TAACGTAAAATAGCCATTTCTTATTTTTATTATATCCTTTAAACCACCATAGATAAAGCCTTTTATTAAA
ATCTTTCCAACCATTTTTGATTTTTTGAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp