Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_009706_5                                                                                                                 top


Strain : Clostridium kluyveri DSM 555 RefSeq :NC_009706 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_009706_5
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACNumber of repetitions :25
Begin Position : 2835088 End Position : 2836691

2835088TATATTTTACAACACTTGTTAAGGTTCAACATAAATTTAAACATTTACCATTAAAAT 2835144
2835145ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTCATATTGAATCATATCATCAGTTTTTTCTATGGCA 2835210
2835211ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACGTATCCAAAGCTTCTGGAGCTGCATCTATTACCATT 2835276
2835277ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTATTAAGAGATGCCTTGAGTTATGGAGCAATCCTAA 2835342
2835343ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACCTAAGTCAATATAGTTTTGTATTTCAGGTATCAGCTT 2835409
2835410ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACCTGACCTGTAATTGCAAGTGCAGCAGCCAGCCATTG 2835475
2835476ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACCCTGTACAAAATGTGCTTTTGGTTGTAAACCCATC 2835540
2835541ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACATTTAGGATCAATATTAAATATCTCCTTTCTGGAGT 2835606
2835607ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACCTCGATCTTTTCAATGTCTGTTACTGCTATTTTGTC 2835672
2835673ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTCCTGTGTTCTTCTATTTTACTTTCGTTATAGGCCT 2835738
2835739ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTACTGTATTTCAAATTATCACAGGATATTCTAACAA 2835804
2835805ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTTAGTCATTTCAGTTGGATAGTGTTCAGCATAACTTG 2835871
2835872ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACTATAACATTTTTAGTGCTTCATATCTTCTTTCCCC 2835936
2835937ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACTATGGAATTTAGCAAAGGCAGAAGAATCAATACTTT 2836002
2836003ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCTATGTTTTTTATCTTTGTGTTTAATTCCTCTAC 2836066
2836067ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCTGAAGCAAAAGAAAATACTAACACACCAGAAAGTAA 2836133
2836134ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCCTAGTTGGGTTATTAATGCCTCCTTTTTCTTTT 2836197
2836198ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACGCTTATAGTCAAGGAAAATCCGTACTTAGAAAAGAGG 2836264
2836265ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCCAGTACCGCCTGTATTAAATGCTATTTTACCTTCTG 2836331
2836332ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACGATTTAATCCATTGTTTTAGTGTCAATTCATCTTTAG 2836398
2836399ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACATTTCCAGAGTGGAAAACAGCAGACATAATTATACC 2836464
2836465ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCTTCCTCACCTATAATAGTTACTATGGGGTCTATGC 2836530
2836531ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACGTACAAAAACTTCCTTCTCGCAGAGGTCACCCTCTA 2836596
2836597ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACTAAATAGTAAAAATTATAAAAATTGAATACGTTCA 2836661
2836662ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC2836691
Left flanking sequence : Till position 2835088 (length bp)
ATACTATGCGAAGATATATTAAATTATGTTTTAAACCTTAACCATTAAAATTGATTGTAATATTAGCTTT
AAAACTCTCGAACATATAATATTCTGCTCA
Right flanking sequence : From position 2836691 (length bp)
TAACGTAAAATAGCCATTTCTTATTTTTATTATATCCTTTAAACCACCATAGATAAAGCCTTTTATTAAA
ATCTTTCCAACCATTTTTGATTTTTTGAAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp