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CRISPRs details
NC_010296_20
Flanking alignement tool
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NC_010296_20                                                                                                                 
top
Strain :
Microcystis aeruginosa NIES-843
RefSeq :
NC_010296 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_010296_20
DR consensus (37 bp) :
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
21
Begin Position :
2823103
End Position :
2824595
2823103
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CAGCCCGAATGGTACGAGACAGCCTGGGCAGACCAA
2823175
2823176
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TGCTAATCATTCTTTTAAATCTAATTCAGTAAACTT
2823248
2823249
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GTGATTGAGGTGTAGGTAGTTCCCGCCCATCCAACTG
2823322
2823323
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTCTGATGGCCAGTTTACGGTTGAGGTAATGGGG
2823394
2823395
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATGTAAAACGGGAATCCGCAAAGAGTGTTACCCGG
2823466
2823467
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AAGGATCGTCGGGCGCGGGATTCGGGAAATGAAATT
2823539
2823540
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATGGTTTTTACTCCTAAGTATTTGTTTTTACTGGC
2823611
2823612
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AAACTGTAACCCATATCGTTCCGTGATTCTACGGT
2823683
2823684
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCCAGATCGGATATTTAGTAAATTCGATTACCTCTT
2823756
2823757
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ACCAAGTATTTTGCTGGTAAAGAAACAGACGAATT
2823828
2823829
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GCAGAATCGGAAAAGACGATTAACAATTTTTCCGA
2823900
2823901
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTTTAATCGATTCTTTTTCATTAGCAAGTAATTC
2823972
2823973
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTTGCTTCTTATTGCCATAGTGACAAAACCGTATGG
2824046
2824047
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GTAAGCACCTCTCGATACTTGCCACTGGACATATTT
2824119
2824120
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CAGTTGGACTGACTTATCGGCATCAGATTTTTAGC
2824191
2824192
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTGAAACTGGCAATAGCGTCGGTGTAGGAGCGGCGG
2824265
2824266
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCCTTCGAGGTAACGCCTTTTAAAGCCAATCCCAAC
2824338
2824339
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AGTTAATCGATGAATAGCGATCACCCTCTTGACTGATCGA
2824415
2824416
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CGCCTACTAAATTCCCCTCATCTTGAATTGATAGC
2824487
2824488
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTCTTTTGATGATGATGCTAACCGGGAAGCAATC
2824558
2824559
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGACTTCCAA
2824595
Left flanking sequence : Till position 2823103 (length
bp)
AGGGATTGGGGTTGAGGCTTTTCTCGATTTGTTTTTTGTCTAAGTCCCACTATTAGGGATTGAAACTCCT
GCTTTGGTAAAATTACTGATGCCCATAAGC
Right flanking sequence : From position 2824595 (length
bp)
AAAATAAACTATTCATGCTCAAGAATAATAATCATTCTCGGAGTGTAGGAGGTAGGGGTCGATGGTTGCC
TCCTCCTTCCAATTTTGTAGTAGAATTAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp