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NC_010296_21
Flanking alignement tool
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NC_010296_21                                                                                                                 
top
Strain :
Microcystis aeruginosa NIES-843
RefSeq :
NC_010296 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_010296_21
DR consensus (37 bp) :
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
41
Begin Position :
2826228
End Position :
2829166
2826228
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CTTAAGACAGTGCCTTTGAGCGATAAGGGCGATTATC
2826301
2826302
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GCAAATGCAAAATCTTCGGATCAAGCAGAATTATCTG
2826375
2826376
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GCAAATGCAAAATCTTCGGATCAAGCAGAATTATCTG
2826449
2826450
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AGGCGGGCCGGGAGACAGCCTTTTTCTTTGATCAG
2826521
2826522
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTGTGAGTCCCTGTGCAACAATCCGAAAATTCCC
2826593
2826594
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ACTACACACAACCGAATTGTAAGTGATAATTTATC
2826665
2826666
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CTGACAGAACGGGTTGAATGGGAAGGTAAGCCTA
2826736
2826737
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GCACAAAGTTGTCACTTTGTCTCGTCAGGAAAGC
2826807
2826808
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AAATTTTGCATTTGCTGAAAAAATCTTTGACCTTC
2826879
2826880
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GCTGGTGTACCTAGCCTACAATCTTAGTTTAAATC
2826951
2826952
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CATTTACTTTTTAATGAAGGCACGCCATAATTTAA
2827023
2827024
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TGTGCAAAGCTACGCCCATCGATTTCCCGTCTGGG
2827095
2827096
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TGGGAGATTGGAATCACAGCCGAAAAATAGGATCGA
2827168
2827169
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCGGCTTTTTTAGCTCCCTCAGTAATGATTATTGG
2827240
2827241
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCCAACTATACCGATGATTTCGGTACTGAATACAA
2827312
2827313
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCCGTATTTGCGGGTGTTGGAGCTATACTCAAAAAGA
2827386
2827387
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ACTATGGTATAATGAAAGTACAAACAAAGAAAAG
2827457
2827458
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTGATTATTTCCGTGGCTATTTTTAAGCATTGCTCAT
2827531
2827532
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CATAAAAGTGCCTCTTTAATTCCGGCTTCTAGAG
2827602
2827603
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTTTACTTGCAACTTATTCTCAATAAAAAATCA
2827673
2827674
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CAGAGGCTTGAGCTAATTCAAATTTTTCACGCGCTA
2827746
2827747
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTCCTTCCCTCTCGGCTTTTGCCCGGATAATCGGA
2827819
2827820
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TAAGTTCTGTAGAAAACGACTTAGATATACAGCTT
2827891
2827892
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ACTGTATTCCTTTGGTGCGAGAGTATCGGGGTATC
2827963
2827964
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTCCTTTATTTTTGGCTGTTTCTCCTAAGCTTGA
2828035
2828036
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTCGGAGTATCCTGTAGATATGTACTTTTATAAGG
2828107
2828108
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTTTTGTATTCCGTGGAAGAATACGAAGAAATGAA
2828180
2828181
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATCGACATAAAACACATACTAACAGTCCTAACCAG
2828252
2828253
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AAAGCTAGGCTAATAGCGGCACTGATTAAAATTTC
2828324
2828325
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GTAACTGCCTTATTTTCTGGCAGTTTTTTCAAAAAT
2828397
2828398
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TACTCGTCGGGAACCCTATCACCCGCTTTCGGTTCC
2828470
2828471
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CTGCCATTGTCCGCAATGGTAGCCCTAAGCTATCTGA
2828544
2828545
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GCCAATAAATCCAATTCTCGCCGGCGCGTCTTGACA
2828617
2828618
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AACAGAAATATTGCTGATTTCGCCGCTATGCCACGC
2828690
2828691
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCCTCGGAACAGCAGTTGCGGCGGTGGCTGAATAA
2828762
2828763
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AATTACCACCGGCTTAATCCACCCAGACTGCCGA
2828833
2828834
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GAGGGAAAATCTGCCCTTGTCGCAGATGCCCAAATATC
2828908
2828909
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CATGATTTTCTAAATATTCAGCTATCTCTAGCCGA
2828980
2828981
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CATTTACTTTTTAATGAAGCCACGCCATAATTTAA
2829052
2829053
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CTCACTTTAGGCTAGTGTTTGCCCTCTCGTGAAAAAGCAA
2829129
2829130
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAGT
2829166
Left flanking sequence : Till position 2826228 (length
bp)
AAAAAAACACTTTTCTATTTTTTTGTTGGGTATTTTATTCTCTGGAAGTCCCTTAGGGATTGAAACAGCA
ATATTTTTGGCATCGGATTCGGTCAAAACT
Right flanking sequence : From position 2829166 (length
bp)
GAAGGGAATTTCTGAAATGGAATTCAGTCTGTCTATATTTGACTATACTTTTACTAACTAGGGCTTGCTG
AATAATGGTAAAACCCTTTGAAAATAAGGC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp