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CRISPRs details
NC_010379_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_010379_1                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium botulinum B1 str. Okra
RefSeq :
NC_010379 (plasmid pCLD )
CRISPR id :
NC_010379_1
DR consensus (29 bp) :
GTTTAACTTCTACATTATATGTATTTAAA
Number of repetitions :
13
Begin Position :
28
End Position :
866
28
GTTTAACTTCTACATTATATGTATTTAAA
GCATTGAAAGCATAAAAAATAAACTAGAAAAATATAA
93
94
GTTTAACTTGTACATTAGATGTATTTAAA
GTTTAAAGATTATAAGTTAAGGATATGTTTTTAAT
157
158
GCTTAACTTTTGCATTAGATGTATTTAAA
CTATTGATTGACAAAAATTTTTAGTTTTATTTAA
220
221
GCTTAACTTTTACATTAGGTGTATTTAAA
CGGAGGTTTTTGTAATGCTAAATCCTATAAAAAACAA
286
287
GTTTAATTTGTACATTAGATGTATTTAAA
CTAAATAAGGAACCTACTAATTTTTTATTGTTATTAAA
353
354
GTTTAACTTATATATTAGATGTATTTAAG
CCCTCCATTTCTAAACTATAATTAATTAT
411
412
GCTTAACTTTTGCATACGATGCATTTAAA
CCTTTATGTGAGTTCTTTTTTATTATATTGTTATTGAGCAAGAACTCCAATTTTACTGTTTTATAAATTA
510
511
GTTTAACTTCTACATTAGATGTATTTAAA
ATTCCGTTTTTTTAAAATAGGAAATTTTTAATAAAAAAAGAC
581
582
TTTTAACTTCTACATTAAATGTATTTAAA
CACGCATATTTGAAATATGGAAAATGGAGTAAGATGG
647
648
ATTTAACTTATATATTAGATATATTTAAA
CTACCGATTTATAAAAATTTTTAGTTTTATTTAA
710
711
GTTTAACTTCTGCATTGGATGTATTTAAA
AACTTTCAGAAGGCATATTTTCTTAAATATTTG
772
773
GTTTAACTTCTACATTATATGTATTTAAA
CGTTGTAAAATATGTAGGTGGAGCTAAGGAGTGTAA
837
838
GTTTAACTTCTACATTAGATGTATTTAAA
866
Left flanking sequence : Till position 28 (length
bp)
AGAATCCAAATTACACCTCCTAGTTAT
Right flanking sequence : From position 866 (length
bp)
GTACCGTTTTTAGAAAAAAGATTGTTTCATTTACACATATAATATATAAAAAAGCAAATAGCTATTTGAA
TTATTAAGCTATTTGCTTTTTTATATATTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp