Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_010379_1                                                                                                                 top


Strain : Clostridium botulinum B1 str. Okra RefSeq :NC_010379 (plasmid pCLD )
CRISPR id : NC_010379_1
DR consensus (29 bp) : GTTTAACTTCTACATTATATGTATTTAAANumber of repetitions :13
Begin Position : 28 End Position : 866

28GTTTAACTTCTACATTATATGTATTTAAAGCATTGAAAGCATAAAAAATAAACTAGAAAAATATAA 93
94GTTTAACTTGTACATTAGATGTATTTAAAGTTTAAAGATTATAAGTTAAGGATATGTTTTTAAT 157
158GCTTAACTTTTGCATTAGATGTATTTAAACTATTGATTGACAAAAATTTTTAGTTTTATTTAA 220
221GCTTAACTTTTACATTAGGTGTATTTAAACGGAGGTTTTTGTAATGCTAAATCCTATAAAAAACAA 286
287GTTTAATTTGTACATTAGATGTATTTAAACTAAATAAGGAACCTACTAATTTTTTATTGTTATTAAA 353
354GTTTAACTTATATATTAGATGTATTTAAGCCCTCCATTTCTAAACTATAATTAATTAT 411
412GCTTAACTTTTGCATACGATGCATTTAAACCTTTATGTGAGTTCTTTTTTATTATATTGTTATTGAGCAAGAACTCCAATTTTACTGTTTTATAAATTA 510
511GTTTAACTTCTACATTAGATGTATTTAAAATTCCGTTTTTTTAAAATAGGAAATTTTTAATAAAAAAAGAC 581
582TTTTAACTTCTACATTAAATGTATTTAAACACGCATATTTGAAATATGGAAAATGGAGTAAGATGG 647
648ATTTAACTTATATATTAGATATATTTAAACTACCGATTTATAAAAATTTTTAGTTTTATTTAA 710
711GTTTAACTTCTGCATTGGATGTATTTAAAAACTTTCAGAAGGCATATTTTCTTAAATATTTG 772
773GTTTAACTTCTACATTATATGTATTTAAACGTTGTAAAATATGTAGGTGGAGCTAAGGAGTGTAA 837
838GTTTAACTTCTACATTAGATGTATTTAAA866
Left flanking sequence : Till position 28 (length bp)
AGAATCCAAATTACACCTCCTAGTTAT
Right flanking sequence : From position 866 (length bp)
GTACCGTTTTTAGAAAAAAGATTGTTTCATTTACACATATAATATATAAAAAAGCAAATAGCTATTTGAA
TTATTAAGCTATTTGCTTTTTTATATATTA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp