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CRISPRs details
NC_010418_1
Flanking alignement tool
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NC_010418_1                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree
RefSeq :
NC_010418 (plasmid pCLK )
CRISPR id :
NC_010418_1
DR consensus (30 bp) :
GTTTAACTTCTACATTAGATGTATTTAAAC
Number of repetitions :
14
Begin Position :
129803
End Position :
130707
129803
ATTTAACTTTTACATTATATGTATTTAAAC
CTTAATGAGGAGGTTGTTTAATGAAGAAAAAAATAA
129868
129869
GTTTAACTTCTACATTAGATGTATTTAAGC
CCTCCATTTCTAAACTATAATTAATTAT
129926
129927
GCTTAACTTTTGCATACGATGCATTTAAAC
CTTTATGTGAGTTCTTTTTTATTTATTGTTATTGAGCAAGAACTCCAATTTTACTGTTTTATAAATTA
130024
130025
GTTTAACTTCTACATTAGATATATTTAAAA
TTCCGTTTTTTTAAAATAGGAAATTTTTAATAAAAAAATAC
130095
130096
ATTTAACTTCTACATTAAATGTATTTAAAC
ACGCATATTTGAAATATCGATTTATAAAAATTTTTAGTTTTATTTAA
130172
130173
TTTTAACTCCTGCATTAGATGTATTTAAAC
TTATAAAAACAAAAAGATTTTCATTTATCTTAAT
130236
130237
GTTTAACTTTTACATTAGATGTATTTAAAG
TACAACTATGCACTATTATTT
130287
130288
GTTTAACTTCTACATTGGATGTATTTAAAC
AAGAATTTAAGAGAGGTTTTACCTAAAAATAAGATAC
130354
130355
GTTTAACTTCTACATTAGATGTATTTAAAC
AAAATCGGAGGCTTTTTAATAATATTTTTAATAA
130418
130419
GTTTAACTGCTACATTAGATGTATTTAAAC
GAAACATTAAATTTATAATCTGAAAAGGGGAA
130480
130481
GTTTAACTTTTACATTACATGTATTTAAAC
GTGTTAATAGTAACAATAAAAACAAATAAA
130540
130541
GTTTAACTTCTACATTATATGTATTTAAAC
TACCGAAAAACACAAAAAAGATATAAGAATTTTTCCTATAT
130611
130612
GTTTAACTTCTGCATTAGATGTATTTAAAC
AATTAATTTGTTCTCTCATTTGTAAATATACATAT
130676
130677
GTTTAACTTCTGCATTAGATGTATTTAAAA
130706
Left flanking sequence : Till position 129803 (length
bp)
TCCACCTCTTAGGTGGTGGTAGTTCACAAGTCATATAATGAAAGCATGTTATAATAATTATATAAACATT
TTATTATTTACAAACAGCTTATTTTTATTG
Right flanking sequence : From position 130707 (length
bp)
GTATAAGTTTAAATATAAATAGAGAAAGAGAAGGTGCAAAAATGAAGAAAAAAAGCATAGATAGAGCTTG
CTATGTTAACATTTTACCTAATTTATATAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp