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CRISPRs details
NC_010418_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_010418_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree
RefSeq :
NC_010418 (plasmid pCLK )
CRISPR id :
NC_010418_2
DR consensus (30 bp) :
GTTTAACTTCTACATTAGATGTATTTAAAC
Number of repetitions :
12
Begin Position :
131045
End Position :
131754
131045
ATTTAACTTTTACATTAGATGTATTTAAAC
AACACATATTTGGAATATCGCTAATGGAATAAGGTG
131110
131111
GTTTAACTTGTACATTATATGTATTTAAAA
TAATTTATTATTACCTTTTTA
131161
131162
GTTTAACTTCTACATTGGATGTATTTAATG
ACCTATTTTATTTAATTAATGAAAGGGAAAATA
131224
131225
GCTTAACTTATATATTATATGTATTTAAAC
TAAACTCCGCAAACGTTTATTGTCCTAATTTTTATTA
131291
131292
GTTTAACTTCTATATTAGATATATTTATAC
TAGCAAGGAACCTCCTAATTTCTTATTGTTAATAAG
131357
131358
GCTTAACTTTTACATTAAATGTATTTAAAT
AGCGTGTGTAAAAAACAAAAAGAATAACTA
131417
131418
GTTTAACCTCTACATTGGATGTATTTAAAC
TATTTTATTGATTATTATTGCTTCTTAAAAAAATAG
131483
131484
GTTTAACTTCTACATTAAATGTATTTAAAC
ATACTTAGGAATATTAAAAATCTTTCAGTTTTTAT
131548
131549
GTTCAACTTTTACATTAGGTGTATTTAAAC
GGAGGTTTTTTAACAATATTTTTCTCCTT
131607
131608
ATTTAACTTCTGCATTAGATGTATTTAAAC
AAAAAATAGGGATTTTGTAAGCATTAATTTTTTAT
131672
131673
GTTTAACTTTTACATTAGATGTATTTAAAG
TACAACTATGTACTATTATTT
131723
131724
GTTTAACTTCTACATTAGATGTATTTAAAC
131753
Left flanking sequence : Till position 131045 (length
bp)
TTATGGAGATTAAGGGAAATTTATCTTTTACTCATATAGTTAGAGATTCACATGGATTTATTTTTGCAGT
AGAAATAGCAGATTTATAAAAAAATAAAAC
Right flanking sequence : From position 131754 (length
bp)
AAAATTAAATTTATAATCTGAAAAGGGGAAGTTTAACTTTTACATTAATTTTTGCAGTAGAAATAGTAGA
TTTATAAAAAAAGAATGCATTTAACTTTTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp