Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_010674_2                                                                                                                 top


Strain : Clostridium botulinum B str. Eklund 17B RefSeq :NC_010674 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_010674_2
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCNumber of repetitions :16
Begin Position : 2143426 End Position : 2144430

2143426AATTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAAACAAGTAAAAGGAGATTTTAATACTATTAATTTAAT 2143489
2143490ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCATTTTCATAATGTTTTAATGTAGTAATTACTATTTG 2143555
2143556ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCGATGATAGTGGTATTGGATATACAACAATAATCGC 2143620
2143621ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCTTACATTTCCTGTCCAACTTATGGTATTTTCACC 2143684
2143685ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCTTTCCTCAGTTCTATTTTTAGTAGTTGTATTTTG 2143748
2143749ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCAGAAATATCAAAGACTATGTTATCTTATAATATTTC 2143814
2143815ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCAGATACTGTACATTGCTACAACAAAAATATTGATAT 2143880
2143881ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCATTACAATTAAACTTTGATGCTCTATACCCATTTCA 2143946
2143947ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCGAACAGGATTGTATATTTTCGTTGCATAATATACA 2144011
2144012ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCCAGATGTGAGAGTTGAAAGGCTACAGGATATTGA 2144075
2144076ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCCAGGCGATAATATTAAAGAAAAAGTAAGTATAAC 2144139
2144140ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCTCATCAATTTTCATACCATCAAATTGATTATTTGC 2144204
2144205ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCGACGGTAAGCCTTTTTTTGGTGTTGCAATAAATAA 2144269
2144270ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCAACTGGGGAGGAATTAGACCTACAGTTGTAATTTG 2144334
2144335ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCATTTTTTTAATTCGTATGATATTATCACATAAATTA 2144400
2144401ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC2144430
Left flanking sequence : Till position 2143426 (length bp)
TATATTTCTATAAATTTCTTTGCAAATTCTATTATACTCTATATTTTTCCATATAAAAATCAAAAAACAC
CAACACGTTCAGTGCTGATGTTTATAATTT
Right flanking sequence : From position 2144430 (length bp)
CACAGTAAAATAGCCATTCTCTAAAATCAATAATACCATTAAGGCATTGAAACTTCAAGGTTTTAAGGAA
ACTTTACCAGCCGTTTGTCAAATTTTAATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp