Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_010729_12                                                                                                                 top


Strain : Porphyromonas gingivalis ATCC 33277 RefSeq :NC_010729 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_010729_12
DR consensus (30 bp) : GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATNumber of repetitions :120
Begin Position : 2181484 End Position : 2189363

2181484GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAACGAAATGAAAAAGACAACAAACAGAAGACCCTC 2181549
2181550GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGTGCCAGCTGCAGGGGGATGACATAGCCATTGACGA 2181615
2181616GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGTGCCAGCTGCAGGGGGATGACATAGCCATTGACGA 2181681
2181682GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCCGCGCCGCGAGGTGGAGACCCTGCCGGAGGCGAA 2181747
2181748GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCTGAGAAAGAGGGGAGGGAGGAGCGATAGACGAAGT 2181814
2181815GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGAGAATCTATTGAGTAGCGAAGTCGTCACAAAGAT 2181880
2181881GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGCCATAGCTCTTCAATTTCAATTTCTTCTTTTAAT 2181946
2181947GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGAAAATAACAAAAATAGATATATTTATAAAAAAGA 2182012
2182013GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATACTCTTATCATCTACTATCTCAAAAGCTCTTTTT 2182076
2182077GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCGCTATAACCCTATGTGATTCAGGAATCGGCTTGCTA 2182144
2182145GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGAAACATTCGAGCCGTATTCAATTACGCCATCAATG 2182210
2182211GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCACCCATTGTGCCGCCGTCCTGACCGAAAACTTCTTTA 2182278
2182279GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCGCTATAACCCTATGTGATTCAGGAATCGGCTTGCTA 2182346
2182347GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGAAACATTCGAGCCGTATTCAATTACGCCATCAATG 2182412
2182413GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCACCCATTGTGCCGCCGTCCTGACCGAAAACTTCTTTA 2182480
2182481GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCGCTATAACCCTATGTGATTCAGGAATCGGCTTGCTA 2182548
2182549GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGAAACATTCGAGCCGTATTCAATTACGCCATCAATG 2182614
2182615GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCACCCATTGTGCCGCCGTCCTGACCGAAAACTTCTTTA 2182682
2182683GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTTCTTCATCTCGCGCTTGCTCAAAAGCGCGTTCA 2182748
2182749GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGCATCAAGTCACGAACTTTCTGCGAGATGGAAA 2182812
2182813GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCGTCTCGAAAAAATATCGGGACGTTTTTGTTTTCT 2182878
2182879GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCTCCTTCACTTTGTCGACAATGTGCACTGTATTTG 2182943
2182944GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGGCGGAGTATCTCTTTGCCACCCAGTCCGCGCGCA 2183009
2183010GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGTAACCGCCTCGGTAGACCGCTCCGCACGGTCGTT 2183075
2183076GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGTGCATTCCGGACAGCTTTCGCTTAAAAAGTTAGCGG 2183142
2183143GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAGAACGAACGCCTGCGCGATAAGCACCGCGAGCGTA 2183209
2183210GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTTACCTGCAGACTTGTGCCCACCCACTTGATAGA 2183275
2183276GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGGTCACGGAGCGATACCATGAGTGTTTAGTAGATG 2183341
2183342GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGGAGGAGATCAGCTATGCGGATGATACCACCCGTG 2183407
2183408GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCAGAAAACTCGCGTCCATCTGATAGATGTACACGA 2183473
2183474GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTAAACGATCGAGGCGCGGAGACCCTCCTTGCCAGTA 2183539
2183540GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCGTTCAGGAAAAAGTAACCGAGCTGAAGACCATGCT 2183606
2183607GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGGTGCTATCGCAGGACTGCAGGACATCCTCAATC 2183671
2183672GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGCCGCTCGACTTGACGCCATGCAAAAACAGATAGA 2183737
2183738GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCTGCGAGTTGTGAGAGGCAATAAACTGCTGGGAGC 2183803
2183804GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTGCTGTTAATTCTGTCATCTCTTATTTCTTTTA 2183868
2183869GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCTATCTGCGTATAGCCCTCGCCGTCCACGCCCTG 2183933
2183934GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGGGAAGCTGCTTTGCTCGCTGAGATAGCAGCACTTCA 2184000
2184001GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTTATTGACGCCACCCCGCCGACGAAAAAAAATCAT 2184066
2184067GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTTCGGTCTTTACGTTTGTCGCCACGGATACATGCT 2184132
2184133GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTGTAAATAAATTACATGGCTATTGAAAAACAAATT 2184199
2184200GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGATTGTACGACTTTGCTATAAAGTCTGAGTTATTAA 2184265
2184266GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTATCAACAATCACCGTCATATGTGTAATATACTTGA 2184331
2184332GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGGGCAGGCGTATTGCCCCACTTCTCCCCGAATGCAT 2184397
2184398GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGAGGAATCATATCAGTGTTTATTTTTTCATCGATT 2184463
2184464GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGGAAGTGGGTAGAAGAAAGCCCCAACGTGTTTAAG 2184529
2184530GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCATGACAAAGAGACGGTTATCGGTAGAGGACAGGCA 2184595
2184596GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGCGTGGAAGGGGCATGTACACTTGTAGTTCGCCC 2184660
2184661GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGACAGGCCCTGCAGCGTGTGAGAGCGGAAATGC 2184724
2184725GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTTTCAATCATGATATTTTATTTTTCCTGCAAACGC 2184791
2184792GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCGCATGTGGGAGCGCGGCGGTCTCTGCTTTACGAA 2184857
2184858GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCAGCGTGATGAGCGCTTGAGGCTCCTCCATCGAGT 2184923
2184924GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAGGATGATTTGGAAAATTTAGTAAGATAGTTGATA 2184989
2184990GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTCTTGGAGAAAGCGAAGACCATGAACCTAAGCGTCG 2185056
2185057GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGGAAATATAGTTATTGTATCTACTAAAAGACATAGT 2185122
2185123GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATACCCCATCTTGCAGAGTATATGCGAGCAAAATTT 2185186
2185187GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTAGTTAGCACAGTTGCTACTATCGTAGTAGCTGT 2185250
2185251GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGATAAACTTTCTTCTCGAATTAAGAAAATCGAGA 2185315
2185316GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCGCGGCCATCGAGGCCACCGCCTCCGTCCTCCGCG 2185381
2185382GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTATGAAAACAGAAAAGAACTTCTCAGCCCTGAGTTTG 2185448
2185449GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCAAACTCAATGATTATCTGTCAAGAAGCAAGAAACGA 2185515
2185516GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGTAAAAATTACCCTAGATGCCGAAACGGACGGCCTT 2185582
2185583GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCAGAATTTGCACGAACAGTATGATGTTCGTGTTCTT 2185648
2185649GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAGCGCGAGACAGGCCGAGCCGGCACAGCTTAGTGC 2185714
2185715GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAAACGGCGATAAAATAGCGTTCGAGATTTTCCGCA 2185780
2185781GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTAGTTGTAGCGATTGTCTCAGTTGCATTACTCCTTAC 2185847
2185848GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAATAACGAGAAAAAGAATGCTTAAATTGTTCTTCGT 2185914
2185915GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGAAGAGGGTAAACTATTTGCTAATCTTGAATGCTT 2185980
2185981GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCTCAATATCTTTCATAGCTACTAAAAATTTACGAA 2186046
2186047GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTGCTGTTAATTCTGTCATCTCTTATTTCTTTTA 2186111
2186112GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCTATCTGCGTATAGCCCTCGCCGTCCACGCCCTG 2186176
2186177GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGCCCCCTCACCCATCTAACCTCGAGCCGTTGAGCC 2186242
2186243GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGATTACATAATGATAGACGACAGAGATTGTGCAGAA 2186308
2186309GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGTACTGATAATTACGCTGCAAGGTCAGACGGTGAT 2186373
2186374GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTGCCAGGGCTTGCTGATGCGCGCGCTCCAGCTGCT 2186439
2186440GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATACAGAACCAGCTCCGTCAAATCTCCCGCTTTTTGTC 2186505
2186506GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGCCCCCTCACCCATCTAATCTCGAGCCGCTGAGCC 2186571
2186572GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTATTCATTCGCTCAAGCGAGGGCATCCTGCTGCAGC 2186637
2186638GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCTCGCGGAGGGAGAGGGTGCCGGTATCCTGCCTCC 2186703
2186704GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGAGTCTGTATGTGAAAGTGTAGTTCGAAACATTAT 2186769
2186770GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGAATACTTTGAAGTTGTATTCAATTACTTTGAA 2186833
2186834GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCGTTGTGACAGAGCTGCGCCGTCGTGGCTATGATG 2186899
2186900GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGAAAGCCCGAAGATAATCTACACGCAAGATTGTTA 2186965
2186966GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGTCATCAGGTGGATATTCTTACTGCTATCCACGA 2187030
2187031GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCGTCTGCGACGTATCGCAGCTCTGCCAGCTCCGCG 2187096
2187097GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCATCTTCGCAGGAAAGAAGAAGGCTCCGTCCTCGA 2187162
2187163GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAACAGTCAAGGGGGAGCCGACCTCTCCGGCGGATTT 2187228
2187229GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCAGTGCGGCCGACAAGGCTAACCTCGCTCAGCTGA 2187294
2187295GTTTTAATTTCTGTATGGTGCAATTGAAATAATCCATGTTCATGAGGAGAGGATACGAGTTCTATT 2187360
2187361GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCTTTTGCTATTGCAGCAAACATATACAATAATAA 2187425
2187426GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATACTTCATGGATTTAGCGAGATACTCATTATAATTAA 2187491
2187492GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCTTCAAAGATAGTTGTTATCAAATATCGCGCTGAA 2187557
2187558GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATCTTCAAAGATAGTTGTTATCAAATATCGCGCTGAA 2187624
2187625GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCTCAAGCGTCCAAGAAAGTTCAAGAAATTGTACTA 2187690
2187691GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTACTATGGTGTCTGCATTTGAGATACGCAAATAGCAA 2187757
2187758GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCTCAATATCTTTCATTGCGACGAGAAATTTGCGAA 2187823
2187824GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAATCTATGATGATATAGAAGAAGACGACTTGTTGTT 2187889
2187890GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTAATGATTTTCTGAAATAAAGAAGCAGTTGCATA 2187955
2187956GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCTCAATATCTTTCATTGCGACGAGGAACTTGCGAA 2188020
2188021GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCCCGTGGTAACTCATACCACCGACTATTCCACCGT 2188086
2188087GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTTGAGTAATCATCGAATAATTATCGATTAATCATT 2188152
2188153GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTATATGCATCATATTCTTAAAGTATTTTATTTGAA 2188218
2188219GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGACGAATACGGCGTTCATCATCGATAGTCGCGATGC 2188284
2188285GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGGGCGGCCAACCGGTCACAACAAGAATAGACCGAT 2188350
2188351GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTCCTTCCAGTCGCAGCTTAAGATACTGCGACTAC 2188415
2188416GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAATTTTCATCAGAGCATAAAAAAGGGCAAACTTTTT 2188481
2188482GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGATACGAGCACCAAGGCTGCGATACCGATTGCGTA 2188546
2188547GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCTCGAGCAGATCTTCCTGCTCTTTGATGAGTGAGG 2188612
2188613GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCAGGTTGATTATAATGTTGAAGATGCTTTAAGGG 2188677
2188678GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCTCGTATCGACTTTCAAGCAGGCTGGAGTGCAGCCT 2188743
2188744GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAATATGAGATCGGAAACAATTATAGTTGCGTCGATAT 2188810
2188811GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCACAATAACCGACAAAATGTCTCGCGTAACGTACAA 2188877
2188878GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGTCGCCTGTTTTCTTGAACTCCTCACTGATTCGTA 2188942
2188943GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGATGGTGTCGACATCATACGACAATAGATCGTCGA 2189007
2189008GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGATGGTGTCGACATCATACGACAATAGATCGTCGA 2189072
2189073GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAATATTTTTTCAAAAATTGTAAAACTTATTAAGTCA 2189138
2189139GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAAGTTGCTGATTGTCTTAGAATGAAAGGTTATGCTC 2189204
2189205GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATAATATTACATAATGGCACACTGATGGTAAACTT 2189269
2189270GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCATGATGTACAAATATATCATGATCGTATACTAC 2189333
2189334GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT2189363
Left flanking sequence : Till position 2181484 (length bp)
TGCTGTTTTTAATACTCAAATATACAAAACAACTCCCTATTATACAATGAATTAACAAACAAAATACACA
CCAATCGCCGTGCAAAGGTCTCCATATATC
Right flanking sequence : From position 2189363 (length bp)
CCGTTACAAATATAGGCTTTTCTGTTTGAATGTGAGGAGTTTACGAGAAGGTGAAACCCAAAATTCAGAC
ATTCATAGTTGTCGATGTCTGATTCTATGA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp