CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_011296_5
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_011296_5                                                                                                                 
top
Strain :
Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347
RefSeq :
NC_011296 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_011296_5
DR consensus (29 bp) :
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
Number of repetitions :
121
Begin Position :
1929305
End Position :
1937222
1929305
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AGGATTTAATCTTTTCAAAAATCTGTCTAACCCACTG
1929370
1929371
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AAGTGTATCCTCATCTTTTCACAATCTGCCTTTATCA
1929436
1929437
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTCCATCTTCTGTTTGAACCTCTTCCATCTGATAAC
1929501
1929502
TTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TAAGAACGGTGCTGACTTCACTTACTTCATCTGTCAC
1929567
1929568
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AGAATACAGAGTAATCAATTGCAGATTTCTCCAGA
1929631
1929632
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTCAGATTCATCAAAGAAAATTTTTGGTGTCATTGC
1929696
1929697
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ATTGAGAAGAAAAGCAGAAAGAGAATTATTTTTAGA
1929761
1929762
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TGGATATTTTTCGCTGGCGTAGGTAATGGCAAGTGCA
1929827
1929828
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GAAAAATACTTTTGGAATTAGCAACTAAATATAACT
1929892
1929893
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TGAGCGGATATAACTTCATTGAGCTTGCGTGGGGAAG
1929958
1929959
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TGCTTCTTGCTTAGCTTTCCTTTCTAATTCTAAATCGT
1930025
1930026
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TATTCTACCCCAAAGATATTCCATTGCGAGGTCTTG
1930090
1930091
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AAAATATATTTTATAAGTTTATTCCTACCTCCAGTAAA
1930157
1930158
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTAACCGTGCAATAAACATACTTGTGAACTATACAGT
1930223
1930224
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
CATACCTTTCGTGAGGTGGTAGATGCTAAGGATTATTG
1930290
1930291
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TCGCAATCCCTCCTGCTATGGTAGTCCCTCCTCTGA
1930355
1930356
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTTTTTAGCTCTTGTTTGCTCTGTTTTCTTGCTAAG
1930420
1930421
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ACAATATAAATAAGGCAGTTTCTCTTCAGGAAAAAA
1930485
1930486
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ACGCATTAATGTTGCTGAACTTGCAAGGGTAATTGGA
1930551
1930552
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTGAGGATGTCCGTTGGCATGACCTGCGGCGAACATT
1930617
1930618
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GGGGATTGTGGATTACAGATATGACAGATTCAATC
1930681
1930682
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AGGGACTAAATCCTCTGGCGGGGTTGTTAAGAAAAA
1930746
1930747
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ACAATTAACAAAGAGTACCCCGCCGAACCGAAAACGT
1930812
1930813
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AGGAAGAAATAGTAAAGATACTGCAGCATACTCCCGGT
1930879
1930880
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GGTTCTAAAAACAGACAGAAAATTATAGGGCTTATA
1930944
1930945
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTTTTATAATTTATCAGAACATTACTGCAGGGTATA
1931009
1931010
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ATTGAAGGAGTAATAAAAAGATTCTCTGCATCAGGC
1931074
1931075
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTTACATAAGTGAATCAAGGGTAATTATTAAAACTGT
1931140
1931141
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TAGAAAGAAATCAGAAAAAGAAGCTCTATACATACTTT
1931207
1931208
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GATGAAGAAAAAATTAGACATAGGACAGCTTGACCTG
1931273
1931274
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GAGGGGAATGTGTTTAAGGGAGCAATTGAAAATACCTGC
1931341
1931342
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
CTTGAGGCTGCCTGTCAGAGGCTTGGCTTGTCTATGCAAG
1931410
1931411
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTTAATAAATAATGCTAATATTTCATTAAAAGCAAA
1931475
1931476
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GATGTTAAGAGTAAAAACTCCTATAATTAATCCTGC
1931540
1931541
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTCTCTTTGAAGTTCCTATAGAGAGAATTAAATTAA
1931605
1931606
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GCATTATATAGAGAAATTCAGTACCACCGCCTTTGG
1931670
1931671
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GGAGTTGATGGATTTATATAATTATCAGGACTCGA
1931734
1931735
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AGCATGTATTTGCAAGAAGTGAACAAGAGCTTGAAC
1931799
1931800
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GAATTTGAAGTTGAAATTTCTAATGATGATTTCTTTA
1931865
1931866
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GGCAACCACTGCTGTAAAAGACAAAAAAGTAATCTCTG
1931932
1931933
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TACTGCTTCTATTGTTATGTAAGCAATTTCTCCAAC
1931997
1931998
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GGCAACCACTGCTGTAAAAGACAAAAAAGTAATCTCTG
1932064
1932065
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TACTGCTTCTATTGTTATGTAAGCAATTTCTCCAAC
1932129
1932130
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ATACTTGTTTTACAGAACACTAAAAAACACAACCGAA
1932195
1932196
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AACATGTCAGTTTTCTCATTGGCTTGAGTATCTTCTA
1932261
1932262
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AGATGTGCTGATGAGCGAGAAAGAGTTTTCAGAGAAGA
1932328
1932329
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GAAGCTAAGAAGGTTGAAGAAAAACCTGCTCAGAAGA
1932394
1932395
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TGTAAAGTAAACTACGTAACGTAGTTTACTTAAAAC
1932459
1932460
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GTTGTTGCCTTGCCTTCGTGCTTTTCAATTTGCACTT
1932525
1932526
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
CAACTGTAACTGTTAAAGATGGTGAAACCACTGCTATTGT
1932594
1932595
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TCTTTTTTAGAATGAATTCTATAATTCATCATTATATT
1932661
1932662
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTAACATCTCCCTTGTCAATCGCAGATACAGGCAA
1932725
1932726
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ATGGAAATTTATATGTAATTTTGAAAGTAGTTGCT
1932789
1932790
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
CGTTGATTGCATGTTCTTAAGCACTATCTGCATTG
1932853
1932854
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ATCTATCCCTTTTTCCGCACAGATGCGGGTTCTTG
1932917
1932918
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ATGCCATAAGGGCTGTGGCAATAGTAGATGCACCAAT
1932983
1932984
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTATACTTATTTTTGGGTTCTTGAAAAACAATCAAG
1933048
1933049
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ATATTTGCCAGAAAAGTTAAAGCAATACCTTATCTCA
1933114
1933115
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TATTACTCTCAACCCAATCACGAATTTGTTCTGTTGT
1933180
1933181
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TGCTTGAAGAACTGAAAGAACCGGAACCATACTGCA
1933245
1933246
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TGAACCCGTAATTATTCAAGATGCCGCAATATTCTTT
1933311
1933312
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TGCTTGTTGACCATAACAGAAACTTTTTAGCTCCACA
1933377
1933378
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GAGGGTGAGGACATTTGTATTATTTGATAGAATAAGT
1933443
1933444
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTTTTGCATCTATATATGCTGTTTATATAATTTTTAAA
1933510
1933511
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ATTCTCATACTCAAAAAGAAAAGCCCTTTCTGGCTCACCATCT
1933582
1933583
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AATTTTATACTTTGCAAATTCTGTTTTTTATGTTTG
1933647
1933648
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GAATTCATGAAAAAATGCCAGAAAGCTAAATCTTTGAT
1933714
1933715
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GAGTCCATACTGTGTTGGGCAGTATAAAGAGCTCCG
1933779
1933780
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GCCATTTTTTTGTTTAGATTTCAACTTCAAAGTCTTC
1933845
1933846
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TAATATTGACAAACTTGAAAATGCAAGATGTATGATGC
1933912
1933913
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TATGATGCTGGACCTGATAAAACATTTAGAAAGCA
1933976
1933977
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GTTCAACAAACTCTTTGTGTTTGATTTTATTGACAA
1934041
1934042
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GAGACCAGATACAAGAGCATTAGGAATAGCATTAAGA
1934107
1934108
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GAAAACCACGTTTTGACAATAGAAGGTCTTACAAAA
1934172
1934173
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AAATCATCATAACCTTCTGAAGCACTTCTGGAACTGT
1934238
1934239
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AAGTTTCTTAACTTAGTATAAAAATTATCACAAATAAATTC
1934308
1934309
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
CCGTTGGTAGTGGAGACAGGCTTTGTTGGAAGTTTGA
1934374
1934375
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ATCACATATGCAAAAAGATACGCATTGTCTTTAGCTCT
1934441
1934442
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GATGCAAAAGGATGTTACAGAAAATATGTTAAAAAA
1934506
1934507
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
CAACGGGACAGAATGTTACTGTTGATGAAGTTGAGAT
1934572
1934573
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ATTTCAAGTTCTAAATCCTTAAAATACCTTGTATCTAT
1934639
1934640
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ACAATAAAAGATCCAAGTTGCTGTTGCGTTAAAACA
1934704
1934705
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ATAGTCTTTGCCAAAAAGTGTGGCTTTACCAATAT
1934768
1934769
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GTTATAAAGCATATTGTTATGTCTCTGAACTTCTTT
1934833
1934834
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TCACATATGCAAAAAGATACGCATTGTCTTTAGCTCT
1934899
1934900
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AGTGAACTTTGTTAGACAAATCTAACTTAGTGAGTGA
1934965
1934966
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GTAGACCCATCGCCACATATGTCTCCAATTCAACAATA
1935032
1935033
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TGAAATTCCTAAAGACAAAATCATCTATAACAAAGA
1935097
1935098
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GTATGTATCGGCTTTATTGCAATCAATATCTTACA
1935161
1935162
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GTTGCAAGAGCTTTTATCCCAACCAGAGCTAATCT
1935225
1935226
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TGAATGCTTGAGATATTTAGTTTATAACCGAACAAGA
1935291
1935292
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TGTTGCGTTCAAAATCTCTACTTCTTTCTCTAAGCGT
1935357
1935358
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
CCTGAGTTAGTTGAGGCGGGGAGAGGGGTCCTTCCTA
1935423
1935424
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTAAACGAATGGAATGAGACAATGATAAAGCGATAC
1935488
1935489
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TGTGTATGCCAGAAGAAATTGTTTCGGCATTTTCTT
1935553
1935554
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TATCAGCAGTTCGTCAAGTTTAATGTTTTTAACAGA
1935618
1935619
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AATATCAAATTTATTACTCAACCAGCAAGGACAATAATAAC
1935688
1935689
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ACTGTACTGACACAACAGCGGAAATAACAAACTACAA
1935754
1935755
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
CTCTTCTATGTTTTTGTCTTTGACATTAACCCCTTC
1935819
1935820
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTTGTTTTTTGATAAGTTACTATTTTCGTTGTTAT
1935883
1935884
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TGCATCTGCAGGAATGCTTACAAGAGATATTTCAAG
1935948
1935949
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TAACTTTCCCTGAAAGTGCTGACATTTGAACCCATAC
1936014
1936015
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTATACTGCTCTACTGCATCGTAGGCAAGTCTAAATA
1936080
1936081
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TCCCATCCTGCCCTGGCAAATTCTCTATAACATAAAC
1936146
1936147
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TCCTGCAAAAATCAATCTTCTTAAAATTACTGCTTT
1936211
1936212
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
CTTGTTTTTACATCGTGAACCTTCCCCTTGAAACA
1936275
1936276
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TGGTGCAGGTGGCTCTGGTGGAGCTGCGGGCTCTGC
1936340
1936341
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TCGTCCGCCCACTCGCTTACCGTCTGCTTTGGTCT
1936404
1936405
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AACTTCATCCCATGCAAGCCCTCCAGGATGGAATCT
1936469
1936470
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TAAAAGCTATTCTGACATCTTTGGCAGTTTTTTCTGAA
1936536
1936537
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AACTTCAACTGGGCACATATTCCAGATGCAGACTTA
1936601
1936602
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AAAATTTCCAAACTGCCAAAAACCTTTATTTTTTCA
1936666
1936667
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AGACAGGCTTTGTTGGAAGTTTGACGGGGAGAGTATT
1936732
1936733
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GACCTTGATAGAAAAATCACTATTACCACAAGACCTC
1936798
1936799
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTTGCTCCCTTTTTCGCACAAATTGGGCAACTGGTAGGTA
1936867
1936868
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
TTGGCACACATATCAGATATTCACCATCTTTGATTGT
1936933
1936934
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
AAGCTGGATGCTTGACTTCACAGTCACTGAACCATC
1936998
1936999
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
CTGGTGGATTATCACGCTTCTGGTTGGCAATTTAGTC
1937064
1937065
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
ATGAAATCCTCAGTAGGAACAAAGATGCCCCCACAC
1937129
1937130
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
GATGCTGGACCTGCAAACATTGTTGAGGCTATTGG
1937193
1937194
CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC
1937222
Left flanking sequence : Till position 1929305 (length
bp)
GGAGGAGATTCTTCGTCTAAATCGCAGTCAAAGAAGTCCCTAACATGTCTCAGATAAGAAATTATAATGA
GTTTACAAATACTGTAAAATTGCTCACCCC
Right flanking sequence : From position 1937222 (length
bp)
CCAGCTTGTCAATGAACAATGAATTGCTCCCAAAATTCTTTATATTTCTAAATTTTACAAAAAAATTATC
GCATCTGAGAACCCCCTCAAAAAACAAGTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp