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CRISPRs details
NC_011653_10
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_011653_10                                                                                                                 
top
Strain :
Thermosipho africanus TCF52B
RefSeq :
NC_011653 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_011653_10
DR consensus (30 bp) :
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
Number of repetitions :
31
Begin Position :
1260669
End Position :
1262686
1260669
GTTTCAATCTTTAATAGGTATGCTAAAAAC
CAAATGCAAGCAATTAGAAAATTTTATGGTAAAGAAT
1260735
1260736
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
AGACACATCTTCATCTCCTTTGTTATTTTTAAAAGA
1260801
1260802
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
CTCGTTTCTTTTACCGAGCTTGGTTGCCACATCTGA
1260867
1260868
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
TTAGATACTTTTTTTGATTTTGAGGGCAATTTTTGGA
1260934
1260935
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
ATTCAAATTCACTTATCCTTTTTATCCAGAAGAAGT
1261000
1261001
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
TCTTATCAGAATTACCAACCAAATTCAGCAATTCCTT
1261067
1261068
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
TCTTCATGTCATAGTCATTACTCAGAGACCTCAAAATG
1261135
1261136
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
CAAACAAAGATTACGACGTCAGCGTTAGATTCGACC
1261201
1261202
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
TTTAGTTATGCTATTTAAAAAGTAAAGAGGTGATATA
1261268
1261269
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
TATCAATTTCTGTTGTCCCTCTATTGCCTGTTATAT
1261334
1261335
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
AAGGTGGTGGCAGCAATGGATGATATCGCAAAGCAAG
1261401
1261402
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
TCAACTTCTCATTTACTATTGCTTCTACTATTTCGT
1261467
1261468
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
GTATGCCATTGCTCTTCCAGAGAGTGGTTTAATTTT
1261533
1261534
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
AATGAATATAAACATAGATGGATTTGGAATAAAAA
1261598
1261599
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
AAGCGATTTGCTTTATTTTGGCAATGCATACGTTTATT
1261666
1261667
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
TGTCAAAGGAAACAACAGCAGATGAACCAGAAGAAT
1261732
1261733
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
TGGGAGAATGGCAAAAAGAGGAAGAAAGTTGAAGT
1261797
1261798
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
TTAAACATTATCACACCTCCTTTCTTTACCAACCTT
1261863
1261864
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
AAGTAATAGTGTGATAATGATTGATGTTGCTACACCTGA
1261932
1261933
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
CTATCATATCAGCTGGAAATGGGGTTGCAAGAGCAA
1261998
1261999
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
CCGGAGGTGACTTCATATATGAGAACTATTGAGTA
1262063
1262064
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
GATTAATCACCGCAACGTTCGAGATAACAGGAGTAAA
1262130
1262131
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
GCAATGGGCTTAGCCCGTTGCCCTTTTTAAAACAA
1262195
1262196
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
AATCACCGCCAATAATTTTGGTTGGTGGGAAATACA
1262261
1262262
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
TTTCGGAACCTTTTTGGTTCCAAACTAACAATCATG
1262327
1262328
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
CTATTTCGTTGTTGCCTCGATTAACAAGGTAACATT
1262393
1262394
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
TGTTTAAGCAAGATAGGCAAGATGTAGAGTTGTTAGA
1262460
1262461
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
TCTTGTTCAAGTTTCACAATGATGTGGTAAATGTAT
1262526
1262527
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
ATAATTAGTATATTTGAATGGGCAATCGACTTCTT
1262591
1262592
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
TTTCAAGAAAATTCTAGATATAACTCCAGGTTGCC
1262656
1262657
GTTTCAATCCCTAATAGGTATGCTAAAAAC
1262686
Left flanking sequence : Till position 1260669 (length
bp)
CTTTCGAATGGTACAGGCTTATAATCTTTTATCTTCTTTCAACCTATTGTAATTATAATGAAAACATATT
TTTTGCAAATGATGAATTATATTTAGAATA
Right flanking sequence : From position 1262686 (length
bp)
CCGTTTAACACTTATTTTTAAAAGTTTTTGGTATTTTTACTTTTTTTACCATTTTGTTAATCAATTTCCA
GAACCTTTTAATTTCCTCATTTTTCTTTTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp