Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_011899_1                                                                                                                 top


Strain : Halothermothrix orenii H 168 RefSeq :NC_011899 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_011899_1
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCNumber of repetitions :22
Begin Position : 1621711 End Position : 1623280

1621711GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCCCTCCTCAAAATAGGTTATTGCCATATATACCCCTGT 1621784
1621785GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCTTATATGTTGCAACACTTACATCTCCTTTATTTCAAG 1621858
1621859GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCTCAACCTGAAAATCCTTTAGAAAGTCCCTTTTAATC 1621931
1621932GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCCGCCTACCGGACAATTTACCAGGAAAAAAGACCCGCT 1622005
1622006GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCCCGATTTATACCGTTTTTCGATATCAGGGTAGTTA 1622077
1622078GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCCAACCTTTTTCATGACCCCAATTTAACTATTGGGCATT 1622152
1622153GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCCTAGATTAACTATTGAAAACCACCTTATATCTTCAGA 1622226
1622227GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCCATTCGGTAGCTTCTGAATCTTCCCATTTGAGGG 1622297
1622298GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCTGGAGTGGTGGCCGAATTGGCGATGGCGCCGGACTG 1622370
1622371GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCTGATTACCTAAAGTCAAATCGTAACTAGCTGGTTG 1622442
1622443GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCCAATAAGGGGTGATTGTTTTGGCCCACTTACAAAAAA 1622516
1622517GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCTATTTGTGATTTGTTTGATAGTCATCAACCTATCAT 1622589
1622590GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCTCTGAAAGCAGGTACTTATGTTGAGCCTATTCGTGG 1622662
1622663GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCCTGGAAAGAATGTAAAACTAGGGGAAAAAGCTATCA 1622735
1622736GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCCTAACACTAGCATTATAAGGCGGATCAGTCAACAC 1622807
1622808GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCTTAGCATAGAACTCCTCCAATCTCGATAACCAGTCTC 1622881
1622882GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCCTAAAACCGGCAGAAGAAAAAGAAAATATAAAAATA 1622954
1622955GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCGCATAGCACAATTATTTTAGAAGGGTGATGTTTTTGAG 1623029
1623030GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATTTAATATTAACTTTCCAATTATCAGGTTTGCTTAA 1623100
1623101GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCTTCTGTTGAAGCATCTGTTATGTTTGGCGATTCAT 1623172
1623173GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATCCCAATGATCTTTGCCAAATCCTCTTGAGAATAAT 1623243
1623244GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC1623280
Left flanking sequence : Till position 1621711 (length bp)
TTATGGGGCACCTCCTGGGTTAATTATATACCTAAACCCAGTGTCCGACAAATGGGGGAAGGTCAAAAAG
AGATAAAGGAATTTGCCAAATATGAGGTAA
Right flanking sequence : From position 1623280 (length bp)
CGTTTTAATTTAAAATTACCTATATAACAGTAATCTAAGGTATTTTTCTAGAACATAACTCTCCAATAAT
CATGGTTATAATTATTCATATTAAAGTAAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp