CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_011899_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_011899_1                                                                                                                 
top
Strain :
Halothermothrix orenii H 168
RefSeq :
NC_011899 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_011899_1
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
Number of repetitions :
22
Begin Position :
1621711
End Position :
1623280
1621711
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
CCTCCTCAAAATAGGTTATTGCCATATATACCCCTGT
1621784
1621785
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
TTATATGTTGCAACACTTACATCTCCTTTATTTCAAG
1621858
1621859
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
TCAACCTGAAAATCCTTTAGAAAGTCCCTTTTAATC
1621931
1621932
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
CGCCTACCGGACAATTTACCAGGAAAAAAGACCCGCT
1622005
1622006
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
CCGATTTATACCGTTTTTCGATATCAGGGTAGTTA
1622077
1622078
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
CAACCTTTTTCATGACCCCAATTTAACTATTGGGCATT
1622152
1622153
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
CTAGATTAACTATTGAAAACCACCTTATATCTTCAGA
1622226
1622227
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
CATTCGGTAGCTTCTGAATCTTCCCATTTGAGGG
1622297
1622298
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
TGGAGTGGTGGCCGAATTGGCGATGGCGCCGGACTG
1622370
1622371
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
TGATTACCTAAAGTCAAATCGTAACTAGCTGGTTG
1622442
1622443
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
CAATAAGGGGTGATTGTTTTGGCCCACTTACAAAAAA
1622516
1622517
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
TATTTGTGATTTGTTTGATAGTCATCAACCTATCAT
1622589
1622590
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
TCTGAAAGCAGGTACTTATGTTGAGCCTATTCGTGG
1622662
1622663
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
CTGGAAAGAATGTAAAACTAGGGGAAAAAGCTATCA
1622735
1622736
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
CTAACACTAGCATTATAAGGCGGATCAGTCAACAC
1622807
1622808
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
TTAGCATAGAACTCCTCCAATCTCGATAACCAGTCTC
1622881
1622882
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
CTAAAACCGGCAGAAGAAAAAGAAAATATAAAAATA
1622954
1622955
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
GCATAGCACAATTATTTTAGAAGGGTGATGTTTTTGAG
1623029
1623030
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATT
TAATATTAACTTTCCAATTATCAGGTTTGCTTAA
1623100
1623101
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
TTCTGTTGAAGCATCTGTTATGTTTGGCGATTCAT
1623172
1623173
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
CCAATGATCTTTGCCAAATCCTCTTGAGAATAAT
1623243
1623244
GTTTCAATCCTTCTTATGCTGGATGTATCAATTAATC
1623280
Left flanking sequence : Till position 1621711 (length
bp)
TTATGGGGCACCTCCTGGGTTAATTATATACCTAAACCCAGTGTCCGACAAATGGGGGAAGGTCAAAAAG
AGATAAAGGAATTTGCCAAATATGAGGTAA
Right flanking sequence : From position 1623280 (length
bp)
CGTTTTAATTTAAAATTACCTATATAACAGTAATCTAAGGTATTTTTCTAGAACATAACTCTCCAATAAT
CATGGTTATAATTATTCATATTAAAGTAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp