CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_012589_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_012589_4                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus islandicus L.S.2.15
RefSeq :
NC_012589 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_012589_4
DR consensus (24 bp) :
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
Number of repetitions :
103
Begin Position :
631174
End Position :
637795
631174
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTATTTTTACTAAAGAAAGATGGAATAGCAGCAAAAGTGCT
631239
631240
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACTTACGTATTTTGAACAATTTACGTAATCTTGAGTTAGAGA
631305
631306
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTCTCTGGGTTAATCTCATATACTACTTTTATAAGTCCCTTTTT
631373
631374
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGCCTTGCTAAACTTACATGGTAATTTATAATTTTTGGAAA
631438
631439
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTTATTTTCGTTTTACTCGAGAGTTCATTTAATACTTT
631501
631502
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTATTTCATTTAGTCTTAACAAAAGTGGATACAGAACCTAAT
631567
631568
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAACATGACAGAAGACCAGAAAAAGCAATTGTTAATGCAAA
631632
631633
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCTTTCTTCTACGATATATCCTCTAGCTATAGCCTCAGCT
631697
631698
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATATAAAGTATATCACAAGGGTTGTTTATGCTGTAGATATAG
631764
631765
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTGTTTCTTTCATGATTACTCGGAATAAAAATCGGATCT
631827
631828
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATAGATCCCTCATACTTACTACGAAAATTAGAGGAGTAC
631890
631891
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACTTGACGTCTTGACGGCTTACGATGAGTAAACAAGTAAAATTCA
631959
631960
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATTCGGCATGGTTTACAATAATCAATGCTTTTTCCC
632020
632021
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTTTCGTCAATTCATGAACTAAACTTATCTCATCTTCTT
632084
632085
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACAACCCTAGTGCAGTAGCTATATTCTTTGCGTCTTGGATATCG
632152
632153
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGTTCTATCAGCGTCGTCAAGAAAACGCCACCGTATACGG
632216
632217
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGTAAATTGTACATCAAACTGTGCATCATCTGAATGCGGATAT
632283
632284
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATACGAATCACCTTTTTTCCCGATTACGTGACAAAAAC
632345
632346
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCCACAATTCTTCTATATCGTCGCTGTAATACGTAAGCAT
632409
632410
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCAATTTTAAGAGCTTTAGTGGAACTAATTCAACAAAAAC
632473
632474
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACATGATATACAAGATAAAAAAGTGTTACAATAACAGTTAT
632538
632539
GTTAATCTATTATAGAATTGAAAG
AAAACTAAAAACTTCAATTCACTTATAGCTTTTTTCCTTA
632602
632603
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAAATCACGCATGTAGGTCTCTATATCGTACAACACTTC
632665
632666
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATATTCTTCCTTTTTCTCTTCGTCATTTTTTATTAGT
632726
632727
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTCACATTTAGCAAAAACTATACTCTGTTCTTGTCTTATT
632790
632791
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTAATCTGTCATATTGCGTAATTTATGATATAAAATATA
632854
632855
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTTCGTGTTCTGGAGGATTAATTATCGGTTCTGGTTCATGT
632919
632920
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTCATCTCTTTTAGTTCTCCGTTATCCATCTCGTAGCATCCTG
632986
632987
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CACGTAAATATGAGTCAGGTATTACATAGTTGATGACATTGT
633052
633053
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATATTTTCGGTATCACAAACGAAAATTGTGGTATTTTT
633115
633116
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GACTTAACTGTAAAAAGTTAATTCCCTTTTTTCTCTTTTCTTTCT
633184
633185
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAACGTAAACCGATCGTCATAAATCCACTTCTCAGTTTCG
633248
633249
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTATTCACTATGCGTTTATTATCTAATATGACAAAGAAAAAGA
633315
633316
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTATTTCTGTATTCAAATTTGATTTTTTCTTTGTTTCTGA
633379
633380
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTGTGATTGAACCGCTTAGGCTGAGTTTTCTGAAACTTCTC
633444
633445
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTAATCATATTTACTAGAGCCGGACCTCCACCAAGTCTATTGAG
633512
633513
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCTTTTTCACAGATATCTTAATTATTTCTTGTCCTAAGAT
633576
633577
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTTCCTATTTCCTAATGAACCTAGAATTACAGTGCTGACTT
633642
633643
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AACAAACTTATCATCAAATACATTGAGAAAATCTATGAACTAAT
633710
633711
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAGCTCTGCTTTCATTAGTTAGAAAATCAATTTATGCAATTCT
633777
633778
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTTCTCTTACAATTTCTTCACTAAATGGCACAATTTTTA
633841
633842
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAGCAATGGATTGCTGAATATAGAACCTCCTGTACCTCCTGCAC
633909
633910
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTATTGCGACAGTTTGTATTGTCATTTCAATTTTAAA
633971
633972
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATATCTATTTTAAAAACGCAATTAAGGAATTTTCTTATT
634034
634035
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TATCTTCTCCACAAGAAATTCAGCTCACGGCACAATCTC
634097
634098
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TACTTCGTTTAAAAAGTCAACTGATGTCTCTGCGAAAGC
634160
634161
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CAAATCTATTTTTTGCAATTTTACTAGCTTCAATTTTTGAAA
634226
634227
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTCTGCTTGACTCAATAGTGCCGATAACTCTTTCATTTT
634290
634291
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAACCATAACTCGTGGCAAACGTTACGTCTTCGTAGTCTCC
634355
634356
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCTACGTCTGCTGCTCTCAGCCCTGCTAATGCTGCTTCAG
634419
634420
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CGCCATATTTTTCAATATCTTTATGATTTCCCTCACGTGCCAT
634486
634487
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTGATGTTCCTCCATTTGCAATAAGCTGAACGGCATTTAT
634550
634551
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTTTGTTTTCTACAAACGTGTTCATTTTCGGCTCTAAGTAT
634616
634617
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GCGAAACCATAGATTCACCTCCTCACCTTCTTAGACCACCC
634681
634682
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTACCAGAACGGGCAACCCATGATAGTAAACGACCCCAT
634745
634746
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATAGATCCCTCGTACTTACTACGAAAATTAGAGGAGTACC
634809
634810
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTCGGGGTGTTTAGTAGCGACCTCTTCCTTAAAACTTTT
634872
634873
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCCGAAGTCATAGAAGAGATTTACAGGAGAAAGAAGGCGA
634936
634937
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCAACTGCTATCTCCTGAGCTGTAACACGTTCATATGT
634998
634999
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GATTCAATAAGATCTTCATACTCTCCAAGAGTATACA
635059
635060
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAATTCGCTTATTAGACAAAATGCACTATTGAAACTAAAAA
635124
635125
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCATCTTTACTAGCTAACTTATTTATTTTTACTTTTAT
635187
635188
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TACATGGAGAAGCAGTATATTGAACTATCTAGAAAATATT
635251
635252
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CGCATATTTCCCAGGAGCAATCTTCGCAACTCATTACTCTAC
635317
635318
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TACGTGGCTTCTAACCAGAAGAACCACCCATCGCACTCA
635380
635381
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTATTTGTTCCAATTACTAATTTTCCGATACTTCCATAAA
635444
635445
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AACGACTTACAAGCAATTGCCCAGGAATTGGCGGATAGGA
635508
635509
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTGCGATAAGATTAGAAACGTTAGAAACATCAATACCAG
635572
635573
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTTTCTCCTCTTCGGCGCTCTTGAAGAACGTAACAATAGCCAC
635640
635641
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCTCTTCAGCCGTAAGATCTACATACTCCACAGAGATGAC
635704
635705
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACAGCGTACAAACTGAAGATCCTCAAAGGAACGCCAACAGA
635769
635770
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTAAGCTGGTAGGTCTGGTTGGTGAAGGGGTTTATGTATT
635833
635834
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCATGGACATTATACACTAGTAAATCACTGCTGTCCTCT
635897
635898
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTGGCGTACAAACAAGCAGATTACATTATTCTTTTCTA
635959
635960
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATAAGGATCGTTTTTATGTTCTTCTTCGTCATCATCTTC
636022
636023
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CATGAAACATCACAACAACAAACTAGAGAATCAAATCA
636084
636085
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATGGCTACATCTAGTTTCATGGTCTCGCAAGGATATATGCC
636149
636150
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GCAAAATGCTTAATACCTCTAATTTACTTCTGTCGTCTAACAA
636216
636217
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAAGAGGTATTGAAAGGAAAACGGTGCAAAAACGAAGGAAA
636281
636282
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAGACTTCCAATGCGAGTTGGAATCCTAACGTAGTTAA
636343
636344
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTAGTATTGAAATTAGTAACGACAAACATATTTCTAAAA
636407
636408
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACCTATTAGTGTTTTTCACGTTTGCTGCCGCATTTACTG
636470
636471
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAATGTATGCTGAAACTGGCGGTATTTCCGTGATGTTAG
636533
636534
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCATACTACGTTTTTCTCGGTATAAACAGGCTTCTTCTTT
636597
636598
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTTCGTAAACTATTAGATCTGTTTTATCTTCATCACACT
636661
636662
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGCGGAAGCCTAGAAGCGGATCTCAACAAAAAAGTGTTTGG
636726
636727
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTCAAAAGTAATACTTTTTTTCTCCTAAACCAAAGTAATATCTTCTTT
636798
636799
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAAATGTCTTCTGGGGTCATAGCTTCGTGAGCGAGTACTAT
636863
636864
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCCATAGAAGTCACAGCAGGGTCACCTCATTCCTCCTC
636925
636926
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCCCTCAAACAGCTGTTTTAGGGAGTTGAGAGGGAACACCAG
636992
636993
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CAAGAATTGTACCGTTTCTCAGCCTATATGCAAATAATATCTT
637059
637060
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CAAAAATATACTCTGTCTTAGAGTTTAAAAATGTTTCTGTC
637124
637125
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AACCCAATATTTCATAATCATTGTTAGGTTCAATGTATCTA
637189
637190
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAACCCTCTTTTAAGCTGAACATATTCACGATACTTTTGACTGC
637257
637258
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTCCTCATTTCCATCAATAAGTCTTAACCAGTATCTAT
637320
637321
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAAGAATCATAAATGTAGTAGTTTTTCCAGTTCCTCTGTTAGA
637387
637388
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CGAGAAAGGGTTTTTGGGGATAGGGATAGGGGCTGCATTAAT
637453
637454
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTTTGCTTAAGTTTCTGATATCCTCTAATATACTCCT
637515
637516
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATGAAACTTCTGTAATGTCTACTGTTATTCCATTAGTTA
637578
637579
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAGGTTATTGAGATACCTACATTCAACGTACCCGCGTCA
637641
637642
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTTAGAATGTACTTTTGAACCATAGGAGAATTGAAAATCAT
637706
637707
GTTAATCTACTATAGAATTGAAGT
GTCTTGTTTATTGTAAGCGACAATTTGTAGGGATTCACTCT
637771
637772
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
637795
Left flanking sequence : Till position 631174 (length
bp)
GATAAGAAAGAGTAATATAATACTAATGGAAAGAGTATAGAAGAAAAACTTATAAGAAAGGGAGAAGAAA
AGATACAATAGAGGGTTATAAAAACCCTCA
Right flanking sequence : From position 637795 (length
bp)
AGGGCTCATCTTAAATGGGTAAACACGGAAACATCGTTTGGTGTTATTCAACTCTTTTGAGGGAAGAATC
TAGTTGAGCCTATAGCATTTCAAATTACTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp