Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_012623_4                                                                                                                 top


Strain : Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 RefSeq :NC_012623 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_012623_4
DR consensus (24 bp) : GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGNumber of repetitions :66
Begin Position : 1893082 End Position : 1897307

1893082GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTTCCGATATGAATTGGATTATTCCATAGAACGTCTGGA 1893144
1893145GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGAACCCTTGCCCACTTACTGAATATAACGTCTTTGAGCCTT 1893208
1893209GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGCGTCTTTTCTGAGTAGCGTAGGATGTTCTTTTTTTATCCAT 1893273
1893274GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGATAAGAAAAAGAGAAATAATAATTCATAAAAAATTCCAA 1893336
1893337GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTATACAAAAATTGAATGGATAGAAAAAATTATACCGGTTTT 1893402
1893403GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGGTTGATGACTTTATTCCAAGAAATCCATTATTTAGACCAG 1893466
1893467GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGGCTTTATTTCCTTATTATTTTCTTTGGTTGAAACACTTTGA 1893531
1893532GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGAAAATAATGTATGAAATATTGTATTTTGTTATAATATCTTT 1893596
1893597GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGAAAATAATGTATGAAATATTGTATTTTGTTATAATATCTTT 1893661
1893662GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGGCATTGAAACCGCGGCCCGAATCCACGCCTGTGGAGACAGC 1893726
1893727GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGAAAATAGGTTTTTTTACGCGATTTCACCGTTCGTGCTGA 1893789
1893790GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTCTAAAAATCTAACATATAAATTTTCTATATTATATCTCT 1893854
1893855GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGCTTCACTGATGTAATCTATGCACTCCTCCTTCATTTCATCAAC 1893921
1893922GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTAAACGGAGTTATACGTGTTCTGTATTGCGTTATTCGCAG 1893985
1893986GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGAGAGTGCCAGGCTTTAGGCTGGGACAGTCAAGCGTAGGAA 1894049
1894050GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGCGGTAAGTGAAAGAGAATGGTCTACTGTCGAACCAGAGT 1894112
1894113GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTCTTTTATTGCTTGCCTTATTAATTGACTTAATTGTTCAT 1894177
1894178GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGAAATCATTGCTGACCCTAAATGTATCATTGGGGGATGTCCT 1894242
1894243GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGATATAATTACTATTGATGATATTAAAAAAAAATAAAATTCTTTTT 1894311
1894312GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTTCCCTATCATTTTTAGGCTCATAAGTAGTTAACATT 1894373
1894374GCTAAGCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTATGTTTTTCTAATTCTGTACGGTTATCTGCCGAATTTAT 1894442
1894443GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTCTTTCGTGGCGTGTTGTCTTCTTGAAGTAAATCGAATTTAT 1894508
1894509GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTCCAAACGCCTTGAGGATGTTCTTTTAAAAAATCTAGGAC 1894572
1894573GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTTCTGCGGTTTCCGCCGTTTTTCGCTGCACACTTTCCTCTA 1894638
1894639GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGGCAATCAAGAGATTTAATACTTCAACATCGCAATCACAGA 1894702
1894703GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTTTTACTCCCTAGTATAGTGTATGTCTGATATAATA 1894763
1894764GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTATTATATGTTATGATATTATAGCCAGCTTCTTTCAATAGCT 1894830
1894831GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGGTATACTTTATCAATTCTTCAAGTGTTAGACAACCACGATTT 1894896
1894897GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGCAAGATTGTAAGGGAAGGGTTGACCGGGTAAAGTCACTGC 1894960
1894961GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGCAACCCAATTCCTCAGTAGGTGCTAGCTCTAGCGTAAACTTG 1895026
1895027GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGATAAACCATTCGTTACAAATAACACAAAACAAGGTCTCT 1895089
1895090GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGATTTCTTTTGAGTCATATATTTTTATTTTATTTTCTTCA 1895152
1895153GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTAAGGAGTTTCCATATTGCAATCCTTAGGAGTTCACTTACC 1895217
1895218GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGAAATCTATTCGGAATAATTTATGATTTTAGTGAAATTAT 1895280
1895281GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTCTATAAACACTCTTGGTAATTTTACATAAAGATGCTCCGA 1895345
1895346GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTCTTCCGTCTTCGTAACAATTTTCTCTGTGACGCTCTCAA 1895409
1895410GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTCCTTAACGTAATAAGGAGTCTGATCTCTCATACCC 1895469
1895470GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGGTCGTGTTCTACAACTCTGCAGGAGGGACAATTTACATAC 1895533
1895534GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGCAAAAGCCCTTTTTCTTTCCCCGCCTATGTTCTTCTTCG 1895596
1895597GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTCCCGTGGTCGCAGATAGGCTACATAGGGATAAGAGGC 1895659
1895660GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTTAACTTGTCTCTCACTTATGTTTAAAACTTTTGCAATTT 1895724
1895725GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGCTCCGAGGGTAAATATCAACAAGCCCTGCAATTAGCCCAACAG 1895791
1895792GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTAATTGGAACAAGCGAGGGACATTTACCTGTGCCAAGTTTTCTT 1895859
1895860GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGGTTTTGGCAAACATATGTTTGACCAAAAATGGTGGAAA 1895921
1895922GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGAACTGGTTAGCGAAAAAGGTTTAAATACCAGTTTTGGCA 1895984
1895985GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGAGAACTGCTTTTTCTTTTTTACCTAACCTAACTTTTTGACTCA 1896051
1896052GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTCTCGTTTTCCCTAATTTGATATAATGTCATAAAAAGATCCGT 1896119
1896120GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTGTTCTCACTCTCGCATACAACTTATAATATTCTGTGTGCT 1896185
1896186GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGGAAATATCAGCGGAATTACCCCCACCACCGCGTCATAATA 1896249
1896250GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGAGAGTCCGAGAGAGACTATTCATTTGACGACAATGTGAG 1896312
1896313GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGAAATTATATTTGGCTCTTGATGATTTAACTATGGCATTA 1896375
1896376GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGAAATTATATTTGGCTCTTGATGATTTAACTATGGCATTA 1896438
1896439GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGATATTGGCTGACCTAGTACTCCTAAATTTCAATATTCCAA 1896502
1896503GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGGAGGAAGGATTAATTTCAGCACGAATTTCTATTAATCC 1896564
1896565GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGCCTGCTTAGGCTGCACATTTTCTTCCAGAAGGTCGAATTCA 1896629
1896630GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTGAGAGGTCAGAGAAGTAAAAATCTATAACCGTGAAATTTTAG 1896696
1896697GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTTCCACTATGGTCTTACACAAACCTTGCCAACATGACATTTGACC 1896766
1896767GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGCAAAAAACTCTACGATTTTTTCAAGATATTCTTTGTACTG 1896830
1896831GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGATAACAACACTCCAATTTACAAAAATAATCTTTATAAT 1896892
1896893GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTAGTCCAAGCGGAAGCTTAGAGGCTGACCTGAATAAAAAGGTATT 1896961
1896962GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTATGCCTTGGATCATAAGATATATATTTTGTATCACTAT 1897025
1897026GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGGTTAGCATTATACGAATGTAGGAAGTTTAAAGATCAAGTCTTA 1897092
1897093GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTAGACTCAAGAACTGGTAATCCAAAGCCTTCAGTTCCAGA 1897156
1897157GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGGTCACTTTTCACTTTACCTTCTTTGAAATTTGTTATTTT 1897219
1897220GCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTAATTGCTGACGATTTAAATAAACTCATTGACGCAATTG 1897283
1897284GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG1897307
Left flanking sequence : Till position 1893082 (length bp)
AGATAAGAAAGAGTAATATAATACTAATGGAAAGAGTAGAGAAGAAAAACTTATAAGAAAGGGAGAAGAA
AAGATTAAATAGAGGGTTAAAAAACCCTCA
Right flanking sequence : From position 1897307 (length bp)
TTAGTGTATATTACCCTTGCAATTACTTCGTCTTCACATATTTGTTAATCTACTATAATAACGCCCTTCA
ACCTCTCCCTAAGTATATTGTCGGCATCTA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp