Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_013216_1                                                                                                                 top


Strain : Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771 RefSeq :NC_013216 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_013216_1
DR consensus (30 bp) : GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATNumber of repetitions :68
Begin Position : 933526 End Position : 937981

933526GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGCACTTTTATATACACCTCTATGCCCCACTATTTCAA 933592
933593GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTGGTTCCGTCAATATCTATTTGTAGAACATAGACG 933657
933658GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATCGTCCATAATGCTTTCAAGAGACTCGCGCATAGC 933721
933722GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATCCCGAACTGCTAAGTCCTGCAGCAACAGCAGATCAA 933787
933788GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATCCTATATTCCGGGGCCGATGTGGCAGCCTGCTGCGT 933853
933854GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGCGACTAATGCGTAACAATTCGGCAGCTTCGTCAGG 933919
933920GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATAGTATTGACACTAATAACACGGTTCATGTCAGCGGC 933985
933986GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTTTTGCACCTCCTATATATACCCCGACAACTCGTAA 934051
934052GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATCCTAATTCTACGTATGATTCAACTGTTCCGACAACTGT 934119
934120GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATACTTCAGAGAATAAAGCACCTTTGGCGATTTGTTCA 934185
934186GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGTATTTAGTGCAGCCTCTACCTGACTTAGCACGATAC 934252
934253GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATAAGTATAATTGGAACGCTCTATACGAGGAATATAACT 934319
934320GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATCAAGTACCTCTCCTCGCGGGCTTCCCGGCCCGCTCGT 934386
934387GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTAAATATGGACGAAGGGCAAGGAGAACCGTCAAGCG 934452
934453GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTTCCAGGTCAGTGCGAAGCCACCAGCCATAAAACAGG 934519
934520GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTGAGTATAAGGTCCGGAAATATATTTCATTACACA 934584
934585GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGATACTTTTCTGGACTGCTGCTGAAAACCATAAAAAGT 934652
934653GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGTAAGCATTGATGTGGGTTCGAGTCCTGCGCCCGGCGT 934720
934721GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTATTTAAATACTGATATTGAGGAGTTAGCGGGGCTGT 934787
934788GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATACCTTTGTAGGATTGCGTTTGCGGGAGGCAAGAGAGT 934854
934855GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTCCGGGGCTTTGGATAGCATGGTTGCTTTGGCCTA 934919
934920GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGAGTTATTGCAGCAGGTAAAGGTTGCTTGGGAGAAGA 934986
934987GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGTAACTGCAACCGTTGCGGAAATTCGTGCAATGGAT 935052
935053GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGGGGTGGCGTCAGCTTCAGCTATCAGGACACTTAGCGT 935120
935121GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTATGACATAAAAAGAAAATTACCGTAAGGAGGACTGT 935187
935188GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATCTAACAAAACGTTCCAGATAATCGCAAAGTATGCGG 935253
935254GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTGCTACCCTACTTATGAAAATGGGAGTGCAGCCAA 935318
935319GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGATGGCGCTGTATGGAGTGCGGCGCCGGCGCATA 935382
935383GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTATATCTACCAGGTGACCAAGGAGGAATGCCTAGA 935447
935448GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATAAAGTTCAGCGAACTTATGAGAAACCTCTAACCTGT 935513
935514GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTATTTAACACCTCCCTCTATAATCTTTGATTTTCTC 935579
935580GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATCAGAGCAAGTGCTGCAGATACAGGCTGCCGGTGAT 935644
935645GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATAAAATATATCTGTCATACATAGCGCCATTTTTAAACC 935711
935712GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATACGCCGGACGAAATTGTATCAATAGTTACAGCTTA 935776
935777GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGCTACTGACCCCGCTGTTATTGACGGAATTCAAGAA 935842
935843GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTATGTCTCCTGATTGTAAATTATTAGTATAGTCATA 935908
935909GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTGGCCTGTTTTTCCGGTCAGAATCAGACCGTCAGCT 935974
935975GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGGTGGTTCGCGGCAAAGCTATAAAACGAATCATACC 936040
936041GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTTCGTTTTAACCCGCTAGCAGGCTTTCTGCTGTTT 936105
936106GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATAAGACAAACGCAGGCCGGTACTGGCCGCCAAGCGTC 936171
936172GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTTTTTTAAAGATGAACAAATGGTTATCATTGAGAT 936236
936237GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGATTAGCTGTTTAACAATGGAACAGAGTTTAATTAGC 936303
936304GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGACATCTTAATCTAAAAAACTGTATTTTTTAGCTGC 936369
936370GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTAACAGAGATCAAGAAGCGTGATTTGCTTTGTTATATT 936437
936438GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATATGATGAAAAACCTGATTTAATCAGGATTGTTGGA 936502
936503GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGGATTTGCACTCCTGGGCTATGTGTGTGCGCTGGT 936567
936568GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTTTAATTCTTCTTGGGTAACCATTCCGCTTATGCCA 936633
936634GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGCAATGACAGTTTGTTCCGTTAAGGAGGCATCAAT 936698
936699GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGACAACGGCAAGTGGGAAGAAAAATACACTAGGCA 936763
936764GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATAATATTATGCCAGGAGTGCAGGAGGGGGACTGTCAA 936829
936830GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTCGACAAATTTGATTTTAGCTATTATGGCGATAAC 936894
936895GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATAACAATATGCCAGTAAATTAATTAGATGCGAATACT 936960
936961GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATAAGTTAGAACCAGAAGAGGTGGGTATAGCAGATGAA 937026
937027GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATCGAAAAACTGTTGTAATACGTCCTGGGTTTTTGTAC 937092
937093GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGTGCATGTTGAAGTTGTAGACAGTAATGAAAAATTT 937158
937159GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATATGCATACCACATACATGATGTTGCATACGACCCTT 937224
937225GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATATGATACTTGAAGAGGGCATGGATTTTAAGCCTTT 937289
937290GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGGTGGTTCGCGGCAAAGGAATAAAAGCTGTCATAG 937354
937355GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTCTTCCTTAACTGTCTTGATGTCATGACACCGCTTACA 937422
937423GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGAGTGTTATGAGATCCTATGTGCTAGTATCTATTAAC 937489
937490GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATACGGTTCATCAGGTAAGATAATCCGCTTTGATTTTC 937555
937556GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGGGATAAGGTGTTTTTGACTTCAACGCTGCGGCCTC 937621
937622GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGGTTAATTGACACTAAAGGTCAGTTAATACGCCTT 937686
937687GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATGGTCTAAGTTATTTGCAATTATTAACTATCGGGTGA 937752
937753GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATACGCATTACGAGTGCGTGAAAAGTACTTTTTTAGCC 937818
937819GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATTGAATTAGCTCGTATCTTTTCAATCGGTACTGGTATG 937885
937886GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAATATCAGATGCGGTAAACAAGGTAATACCTAGTAGAAT 937951
937952GATCTAATTTAGCCATAGTGGAATGTAAAT937981
Left flanking sequence : Till position 933526 (length bp)
AGATTTTATAAAATTAGGTGTAGAATAAACTCATGTGAATAGCAATCGACAATAATTATCTTTTCGTGTT
TAATATTTAAGCACACCAACCTTGAGGGGT
Right flanking sequence : From position 937981 (length bp)
TACCCACCTTCCGCAAGATAAAAATCTAAACCTGTAAAATAGTGGAGCATAAATAATATTAATTACAACC
ATAAAAAAAACTGATCCATAAACTGGAAGG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp