Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_013315_15                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile CD196 RefSeq :NC_013315 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_013315_15
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATNumber of repetitions :19
Begin Position : 1849663 End Position : 1850878

1849663GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTAATTTATCTATAATTTAAAACGGTGAATTACATAT 1849728
1849729GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTAAAGAGGGGTACTTCGTACTTTTACCACTCAAACTA 1849794
1849795GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAGGTCAAGCATAGATTTTGCAACTGGAAGATAAGAAGA 1849861
1849862GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGTTTTAGAACAGAAAAAATTGTATAAATTGTGGAATG 1849927
1849928GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTGTAAAATGTAAATAGCATATTAATTTTTCTTTCAC 1849993
1849994GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGGAGCATTATGTTTTTAGGTTACGGAGCAACATTTA 1850059
1850060GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGGTGATAGTGGAAGTTTTACTTATACTTGGCGTGCTG 1850125
1850126GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTCAGAATACTTAGCTCCTGCGCCTATATCGTCTGAAT 1850192
1850193GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAGTTTTGCGCATTGTATGTGTGCCTAGATTATCT 1850257
1850258GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATGTCCCCACATCAATTTTCCTCCGCATGAAAAAATC 1850323
1850324GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTAGAAACAACAGAATAAACATAATATATAAGCATA 1850389
1850390GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTATATCGCATATTCTTTTATCTAGGTCTTCTTTTC 1850454
1850455GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATAATCTTGTTATAGACTTTACTATTGTTGTAATAGA 1850520
1850521GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTTACCAGACCCTGCAACACTAAATGACTTACATA 1850584
1850585GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTCATCAGTATTTGTAAAATGCTTTAACTTATCATAAT 1850650
1850651GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTTACTTTTCCTTTCTATGTGTCCAATTCGGACACATT 1850718
1850719GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAATCTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT 1850784
1850785GCTTTATATTAACTACATGATATATAAATTGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTGAAATTT 1850849
1850850GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT1850878
Left flanking sequence : Till position 1849663 (length bp)
GGTGTATGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1850878 (length bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACCCCAATAATTTATACAGCATTTTCTACTTTAAAATATAATTATTTT
TTATCATTTGTAGTAAATAATTACCAGATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp