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NC_013315_19                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile CD196 RefSeq :NC_013315 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_013315_19
DR consensus (29 bp) : ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACNumber of repetitions :24
Begin Position : 3244496 End Position : 3246042

3244496ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGTGGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTTATTCTACAA 3244559
3244560TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAATAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT 3244624
3244625ACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAACCTGACACTGTGTCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT 3244690
3244691ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGATTAAGCCCAGTAAAAAGACTCGAATCTCTTATCGC 3244756
3244757ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGCAAAAAATGTTGATATTCCCAAAATTAATATTGATGA 3244823
3244824ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATTATAGAAGTACATATATTGCTGAAAAACCTCTTGT 3244889
3244890ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGTTAGTGATATCAATATGCTAAGCAATATTTTTACA 3244955
3244956ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTATATTTCGTCGCACGGATTCGTGCGAAGGGTTGG 3245021
3245022ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAATTTAGTTATATCCATTTGTTTAACCCAATTAGT 3245086
3245087ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTTCATTTTGCACTATATCAAGCTTAGTATACAATG 3245152
3245153ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTTATATTTAATTTTAAAGATTAAAGGTATAAACAA 3245218
3245219ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTACTAGAATTATTAAATGAAATGAACAATAATATTGT 3245284
3245285ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGATTTAAATGCAACACAAATTATAACATCTAAGAAT 3245349
3245350ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGATTGAAATTTCAACACTTTCACCTTGTATATCT 3245414
3245415ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGGTTAAAAAGCAATATAAAAGATTGCATGGAATTACT 3245481
3245482ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGTCTCAATAACAACAGTCGAAGCAGAAAAATCCGG 3245547
3245548ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTAAAATGAGAAATAAAAGTAAACAAAAAGGTTTAGT 3245613
3245614ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTGAAACCCTCGGATTTAGTAACCGATTCTATGTCGAGTCT 3245683
3245684ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAATCTAAAATATGTTCGTTAAAAGGGAGTGTGTAATTA 3245750
3245751ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTTCTTATACAACTCTTAACTCCAAGCCCATTTTGGA 3245817
3245818ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTATAAAAAAAGAGTTAGAAGCATTAGACAAATGGA 3245882
3245883ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTGTTTTTTAGTTTTCGTGATTCAAATGGTTCTTTGTT 3245948
3245949ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAACTCATGTAACAAGTATTAAGACTTGCACCTTTAA 3246013
3246014ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC3246042
Left flanking sequence : Till position 3244496 (length bp)
TGATTTTATTTATGTCTTTATTGTTTAATTTCTTTATCATAAATTTTGTTTCACCTCATTTTTGTATTGA
TTTTATAATGTTTATAGGTAAGTGCATTTT
Right flanking sequence : From position 3246042 (length bp)
CCCAAAATAGGTATAATTGAATACATTGAAAATACTTCAATCAAGCAATTATAATTCAATAAAAACATCA
AAATTTGCAGTGAGCGAGCAGTAGTGCAAT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp