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CRISPRs details
NC_013315_20
Flanking alignement tool
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NC_013315_20                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile CD196
RefSeq :
NC_013315 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_013315_20
DR consensus (29 bp) :
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
Number of repetitions :
10
Begin Position :
3491430
End Position :
3492052
3491430
ATTTACAACTAATTTAGTGTAATCTAAAC
TTGTAGTGCCTAGTCACAACTCTCACCCCTTCAATA
3491494
3491495
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
CTCTCTACTAAAATTACTTCCACATATAGCTACAGA
3491559
3491560
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
TGTACCTGGGTCTTTTATCTTACTTGTAAGTGTACTTCT
3491627
3491628
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
ATTGCAGATAGGTCTGTGCCATCATTCGTGCTGTTAC
3491693
3491694
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
TGGGATGGATTTTGAAGCTTCTATGTCAAATGTACA
3491758
3491759
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
GAAACCTCTCTTTAAAATTATTCATAGAATTTATAAA
3491824
3491825
ATTTATAACTAATTTAGTGTAATTTAAAC
ATTGTTGCTAGAAAACATTAAAATACATTACACATA
3491889
3491890
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
GGCTGGACTTGTAATAGTTGTAACTAAAATTAGTGAA
3491955
3491956
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
GGGTAGAATGAATCAAATAGCAAAAGTACTTTCCGGAAT
3492023
3492024
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
3492052
Left flanking sequence : Till position 3491430 (length
bp)
GTTGGGGTATTATTGGGGTATAATTTTCTACTTTCTAAAACTCTTGCTAATTCAATAATATAAATCAAAC
TCTCAGTTAAGTTTCTTAATGAATAAGTAA
Right flanking sequence : From position 3492052 (length
bp)
CCCAAATAAAACTATAGTAATTACAACACTTGTAGGGTTATTAAAATAGTTAATTTGCAGTGAGGCACCA
GTAGTGTTTTTAGCTAAAAACAAAAATTCA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp