Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_013501_1                                                                                                                 top


Strain : Rhodothermus marinus DSM 4252 RefSeq :NC_013501 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_013501_1
DR consensus (29 bp) : GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCNumber of repetitions :74
Begin Position : 539686 End Position : 544167

539686GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTAAACTAATGGTAGCATGATGTGGCTGGATAT 539746
539747GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCGTACCGGGCGCCGGTTTGTAACCCTTAATGCG 539807
539808GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTATTCGTGAAGTCTCGCGCGGATCTGGCGCTC 539868
539869GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCGTGTACGTGAATGGATCGCACGTTATAAGGGA 539929
539930GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCTCATTCTCGGGAAGTGCATTAGTGCAGCTAACG 539990
539991GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCATTTCGATCTCTTCGGGTGTGTAGATAGTTTG 540051
540052GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCTTGCTGGAAAGCGCCGTGAAAGCGGGTAAGATC 540112
540113GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCTTCGATGCAGATCGGCTCTTTCATCTTATTCTT 540173
540174GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTGGCGAAGATAAGAAGGTGCTCTTCGCCGAGA 540234
540235GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCCTGGCCCGCGACTACGTGCGCGTCATGGCTGC 540295
540296GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCACTCCCTACCGTGTCAAGCCCTCACACTTCAG 540356
540357GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTCTTCCAAAAGTTTCTATTGTGGAGCGTGTCC 540417
540418GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCCTCTGTGAGCCGCGAGGCCGACTCCCAAGGCC 540478
540479GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCGCAAGCCCAGGCGAATCTTAAAATGGCAACGG 540539
540540GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTCGCCCGCTGGAAGACGGACCGCGGCGAATAC 540600
540601GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCTCGTGTATGAGAATGCGATTTCGTCGACGAACT 540661
540662GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTGGACGAATTTGCCCCCGGCCGTTGCATGGGC 540722
540723GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTCGAACGGGCCTCTGCATCCTCTATAGAAAGG 540783
540784GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTTTAGGCAAAAAATTCTGGAGGTTTCTCTTTC 540844
540845GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCCTACACGATATGGGATGCCGTAAACATCTACA 540905
540906GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCGACTCGGTCGGTCTGATTGGCCCGCCAGTCGG 540966
540967GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCGACTCGGTCGGTCTGATTGGCCCGCCAGTCGG 541027
541028GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCTCGTTGCCACAGATCTGGCGGGAATGTGCGCCA 541088
541089GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTCCCTTGGAAATAGAGCTGAACGGCACAGCGG 541149
541150GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCACGATCCAGTTCTACCTCGATCTTCTGGCGCT 541210
541211GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCCCTTCCGCGTAGAAACGGATCCGGTCCAGATC 541271
541272GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCCGTCCGAGGTGGCGAAGGATAAAGTGATTTGG 541332
541333GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCGTGCTGTATTACACGAAAACCAACCGCCATCT 541393
541394GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTCGACGAGCGTGACGTACTTCGTGCCGACCAG 541454
541455GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCGTATAGACCTTGCCGTAGTGTTTTTTGCAGAA 541515
541516GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCTTGCACTAACGTTGCACTAACGATTGCACTTTG 541576
541577GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCACATCGGGCACGCCATCAGGCCGCGTGAAGCC 541637
541638GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCCTGGGGCTTTCCAGGCTAAAGCAGTTTAAGAA 541698
541699GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTTGATGAGCTTTTCCTGGAAGCGACCGATCAG 541759
541760GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTCTTTCACGCCGATCAGGTGGACTCCCTCTTC 541820
541821GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTAAACGGAGGTTTGCCATGCGCATCAACGAAT 541881
541882GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTCTGCACGTCCAGCGCCAGGCCCACCGTGTGC 541942
541943GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCCTCTCTGCTCTACCCGAAAGCTTCCGGCCCTG 542003
542004GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCCTTAGCGGTTGTGGAAAGGGTTGAAAACGTAT 542064
542065GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCCGCTTCAAGCCCGACTTCGTGGGCGACGTGAA 542125
542126GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCGACCGTCTCCCCATCCTGCTGGGCCTTGTCGA 542186
542187GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCTTCGATCTCCTGGTCGCCGATCCGGATGACCTG 542247
542248GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCTTGCGCTTTGACGGACTCGGCCACCTGCACCAG 542308
542309GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTTTCGGCGCAGCGCCAGCTGCTGACGGAAGTG 542369
542370GGTGTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCGTCACGAAGAAAGGCTCAGGAAGCAGGTCCTG 542430
542431GGTGCCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCTTCGAATGGTGTGGTGTATAGGTACTTAGACGC 542491
542492GGTGCCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTATGATCGACTTATGAAAAAGTTGAACATTCG 542552
542553GGTGCCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCTGTTGATTACGTCCGCTTCGTAAACATCGCGC 542613
542614GGTGCCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCAGCACCCGCTCGGTCGATCCGTCCGGGCCGCC 542674
542675GGTGCCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCGTGATCGTGCGCTCAGCCATTCTCTTGCCGCA 542735
542736GGTGCCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCTGCCAGCGATACGCCGCAGCGACTTCGGATTGA 542796
542797GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCATGGCCGTCGATCTGGCCTACATTTACGACAAG 542857
542858GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCTCCAGACCGGCAAGCCCTGGCCGTTATCAAGCT 542918
542919GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCCGACGGCACGACCTACGTCATTCCGAACAACGA 542979
542980GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCCTATGCGGAGCGCCTCTTGCCGGCCGAGACGGT 543040
543041GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCCTGCCGCCGGGTTTGCCGCGCCGCTCCCAGAGG 543101
543102GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCCTTCCAGGCGCATCACTTTTTCGGATAGATCCA 543162
543163GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCGTGCCTCTTCGGCCGTGTACACGGAGCGGCAGA 543223
543224GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCCGATCGTAAAGCGGTAATGCTCGAGGCGTCGCA 543284
543285GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCCTAAGGGAAAGGGCCGCCCTTCTTTCCGAAAAG 543345
543346GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCCAAAGCCATGGAGCGCCCTGTGATTCGCATGCT 543406
543407GGTGCCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCCCAGCGCCAGGTTGTGGCGCCGCGCGTAGAGAT 543467
543468GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCTCCGGCCGCGATGCAAATGGTGCGCATCGTCCA 543528
543529GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCCCACGCGCTGAGGCCGTCATGGTCGAAGATGCC 543589
543590GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCCCCGGAAGAAAAAAGAGGCCCGAAAAAAAAAGC 543650
543651GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCCGAGGAGCTGGTGCGCCAGGAGGCCGTCCTGGA 543711
543712GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCTTACGCCGCAGATCCCCTCTGATCTCTTTATTC 543772
543773GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCTCGTTTCAAAACGGGTACGATTATCTTCGTCTG 543833
543834GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCTTATCCCGTCCTCGACAAATGCCGAGGGTGGGA 543894
543895GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCCAGAAAAGCGCGGCCTATCGCTCATCGAAGAGC 543955
543956GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCTCAGATTAGGGCCACCAATGGGGCGCTAGCTGT 544016
544017GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCTTGGTGAAAATGCGGTAAAGACTGCGTGAAGAA 544077
544078GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCCAATACTTTCACAATACCATCGCCAGGGGCCAG 544138
544139GGTGCCCCCGCACACGCGGGGATAGTCCC544167
Left flanking sequence : Till position 539686 (length bp)
GCTGGTGGAAAGACCGGACCTGGACGAAGAGGAGGGATCGTCTCTCTAATCAATCCTTAATTGTCCTTTT
TTTGCCGCGGTTATGCCATAATGGCATAGA
Right flanking sequence : From position 544167 (length bp)
GCGGTCGATGCGGAAAAACCTCGAGACTGGCGTCGCATCGGTCGCAAATACAGAAAAAGGCTGCTGCACA
TAAAGCAGCAGCCTGGTAGGTGACCCGGGT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp